方永启
- 作品数：9 被引量：25H指数：3
- 供职机构：浙江大学农业与生物技术学院生物技术研究所更多>>
- 发文基金：浙江省科技计划项目云南省省院省校教育合作计划项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>
- 水稻RAD21同源基因(OsRIX4)存在多种mRNA选择性剪接模式被引量：3
- 2007年
- 水稻RAD21同源基因(OsRIX4)存在着多种mRNA选择性剪接模式,从中鉴定出一类特殊的剪接模式,即一个组成型外显子内部的部分片段可以被单独剪除,该类型不属于已知的5类剪接模式之一.这种剪接模式所产生的转录本能够独立地得到翻译.OsRIX4基因多转录本的表达各具组织特异性,其中OsRIX4-4和OsRIX4-5转录本的表达量与水稻育性呈正相关.这种剪接模式的发现,可以为理解和定义植物mRNA剪接模式提供新的内容,也凸显转录后mRNA加工和调控机制的复杂性.
- 董海涛郭小勤裴雁曦戴承恩方永启屠奇超庄杰云赵东郑康乐李德葆
- 水稻光温敏核不育系培矮64S在不同光周期/温度下表达谱的变化被引量：4
- 2005年
- 用含3328个基因的cDNA阵列分析了水稻光温敏核不育系培矮64S于长日照/高温及短日照/低温下幼穗的基因表达谱特征.统计数据表明,以短日照/低温(花粉可育)为参比,长日照/高温(花粉不育)下表达丰度显著变化的基因高达14.60%,482个基因下调表达,仅4个基因上调表达.以实时荧光定量PCR技术对所有上调表达基因和随机选择的9个下调表达基因进行了检测,各基因表达丰度的变化趋势一致,验证了cDNA阵列杂交结果的可靠性.这些差异表达基因几乎涉及所有的细胞生物学反应,但MAPK同系物MMK1和MMK2在mRNA水平表现出截然不同的基因表达特征,大量参与信号传导的信号分子的表达丰度也发生明显变化.可以推测,花粉形态建成及相应的生理功能所需要的程序性转录调控受严重干扰可能是MAPK信号传导途径发生显著改变所导致.
- 郭小勤董海涛郑康乐骆红梅谭学林方永启王炎钦邓晔戴承恩娄沂春邵菁史文琴赵东李德葆
- 关键词：光温敏核不育水稻CDNA阵列
- 水稻花期特异表达基因的cDNA和RNA阵列检测被引量：1
- 2004年
- 用水稻孕穗期、开花期总mRNA为探针与含有 2 2 0 0个独立基因的cDNA阵列杂交 ,以检测开花期群体基因的表达谱。结果发现 ,在所获得的 172 0个有效克隆当中 ,有 4 72条基因表达下调 (占 2 7.4 4 % ) ,892条为持家基因 (占5 1 86 % ) ,35 6条基因表达上调 (占 2 0 .70 % )。表达上调的基因中有 2 5 0个功能已知 (占 14 .5 3% ) ,10 6个是功能未知的新基因 (占 6 .16 % )。其中S 腺苷甲硫氨酸还原酶、查尔酮合酶、酰基载体蛋白Ⅱ基因、过敏反应蛋白、醇溶蛋白、3 酮脂酰载体蛋白合酶Ⅲ和β D (1→ 3) 葡聚糖外水解酶等基因参与水稻开花和胚胎发育过程。为了进一步验证它们与开花过程的相关性 ,选取查尔酮合酶、酰基载体蛋白Ⅱ、醇溶蛋白、S 腺苷基甲硫氨酸还原酶和过敏反应蛋白等 5个基因为探针 ,与 75 5个水稻RNA斑点阵列进行杂交。结果证实醇溶蛋白和过敏反应蛋白基因受发育调节在乳熟成穗中高表达 ,查尔酮合酶和S 腺苷基甲硫氨酸还原酶基因在叶片中受光诱导、在根中受缺氮胁迫时高表达。在所有表型中 ,查尔酮合酶、S 腺苷基甲硫氨酸还原酶和酰基载体蛋白Ⅱ基因有相近的表达趋势 ,过敏反应蛋白和醇溶蛋白基因的表达趋势也相近。
- 王丽华邓晔方永启谭学林李德葆
- 关键词：水稻花期基因表达谱CDNARNA
- 水稻GBSS与淀粉分支酶基因转录本丰度对直链淀粉含量的影响
- 2008年
- 为探讨水稻胚乳淀粉合成相关酶基因表达丰度与直链淀粉含量(AC)的相关性,为稻米品质改良提供指导,以127份早籼稻,143份晚粳稻和19份粳糯稻为材料,应用水稻胚乳RNA阵列分析了供试品系的直链淀粉含量和Wx(包括成熟转录本和非成熟转录本)、Sbe I基因mRNA丰度之间的相关性。结果表明,Wx基因非成熟转录本的剪接及修饰对AC值的大小起着十分重要的决定作用。而sbeI基因在不同品系间的相对表达丰度与相对应的AC值无直接相关性。
- 王炎钦董海涛姚海根姚坚程方民方永启戴承恩李德葆
- 关键词：水稻胚乳分子杂交直链淀粉含量
- RNA阵列技术检测自发性高血压大鼠甲羟戊酸途径酶的基因表达被引量：1
- 2008年
- 目的:探讨甲羟戊酸(MVA)途径的9个酶在不同周龄自发性高血压大鼠(SHR)发病过程中的基因表达变化特点。方法:提取2、4、6、8、10、12不同周龄雄性SHR以及正常血压大鼠(WKY)的心室肌、血管平滑肌、肝脏和肾脏4种组织的总RNA,共294个样品,利用高通量RNA阵列技术(RNA array)检测甲羟戊酸途径的9个酶的基因在不同周龄SHR和WKY大鼠中mRNA表达谱的改变。结果:(1)SHR大鼠从第6周开始收缩压明显高于WKY(P<0.01)。(2)12周龄SHR大鼠体内血清胆固醇浓度明显低于WKY大鼠,组织中的胆固醇浓度没有明显差异(P<0.01)。(3)在SHR大鼠心脏、血管、肝脏、肾脏组织中:MVA中间产物的合成酶如法呢醇焦磷酸合成酶(FDS)、异戊烯化焦磷酸化异构酶(IDI)、法呢醇转移酶α亚基(FT1)和β亚基(FT2)的表达明显高于WKY(P<0.01)。(4)SHR肾脏组织中羟甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)、甲羟戊酸激酶(MVK)、焦磷酸甲羟戊酸脱羧酶(MVD)、鲨烯合成酶(SQS)和鲨烯环氧化酶(SQ)表达较为一致,早期(2-4周)SHR大鼠的基因表达明显高于WKY,随着周龄增加SHR的表达进一步增高,且与WKY相比都有明显差异(P<0.01)。(5)在心脏、血管和肝脏中,HMGR、MVK、MVD、SQS和SQ的基因表达无明显规律。结论:SHR大鼠随着周龄的增长甲羟戊酸途径中各酶基因表达的改变,以非胆固醇产物类合成酶(如IDI、FDS和FT1、FT2)表达增加为特点,这一改变是否与高血压有关尚待进一步验证。
- 李亮胡申江董海涛康兰陈乃云方永启
- 关键词：自发性高血压大鼠甲羟戊酸途径基因表达
- 冻融法纯化水稻胚乳RNA及稻米品质重要相关基因表达谱研究被引量：11
- 2005年
- 提出了一种从水稻胚乳组织中快速分离总RNA的方法,可以简便地去除RNA中存在的淀粉等多糖类杂质,所获的胚乳总RNA其质量可满足Northern印迹、微阵列制备等分子生物学实验要求。将从966个水稻品种的胚乳中分离所得的RNA制备RNA阵列,用于稻米品质重要基因Wx基因的表达谱分析,结果证实:水稻Wx基因表达丰度总体上与水稻胚乳的直链淀粉含量呈正相关;应用于Northern印迹实验,表明在水稻胚乳组织中,淀粉分支酶Rbe1具有两个长度不同的同源基因,其中一个分子量大的为胚乳特异表达,分子量小的则在水稻各组织中共表达。
- 张海燕董海涛姚海根向跃武谭学林方永启邓晔金庆超Cabezas DANIEL姜玉新戴承恩阎文昭李德葆
- 关键词：胚乳WX基因稻米品质淀粉分支酶分子生物学实验
