李乐
- 作品数:5 被引量:31H指数:1
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- 一个大豆BURP蛋白家族基因的克隆与功能分析
- BURP蛋白家族是由Hattori等(1998)命名的,仅存在于植物中的一类具有相同结构域(BURP—domain)的一类蛋白,其命名来自于4个具代表性的成员BNM2、USP,RD22和PG1β蛋白的首字母。本文以电子克...
- 许红亮高雅吕胜军李乐胡英考
- 关键词:大豆基因克隆
- 文献传递
- 拟南芥和水稻木聚糖酶家族全基因组鉴定、分类和表达分析
- 木聚糖酶是指专一降解半纤维素木聚糖为低聚木糖和木糖的一组酶的总称,根据分子量和序列同源性木聚糖酶大致分为2类:一类是分子量小于30kD略呈碱性的木聚糖酶(F/10家族);另一类是分子量大于30kD略呈酸性的木聚糖酶(G/...
- 李乐许红亮王鹏超胡英考
- 关键词:拟南芥水稻木聚糖酶
- 大豆LEA基因家族全基因组鉴定、分类和表达被引量:31
- 2011年
- 【目的】鉴定大豆全基因组中的LEA家族基因,对其进行定位、分类以及组织表达分析,为植物LEA基因的功能研究与利用提供基础。【方法】利用大豆基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定并获得大豆LEA家族基因的全序列、定位和拷贝数信息;通过序列比对进行进化和分类分析;利用大豆发育表达芯片数据、NCBI中UniGene的EST表达数据进行组织表达谱分析。【结果】系统地分析鉴定了36个大豆的LEA家族基因,根据结构域的差异和系统发育分析将这些LEA基因分成8个亚家族。基因定位分析结果表明,这些基因分布于大豆的16条染色体上,启动子分析表明,几乎全部LEA基因的启动子区含有逆境反应顺式作用元件。各个发育阶段表达谱的分析结果表明,多数成员至少在一个组织中表达,10个差异表达的基因中有5个在种子发育时期优势表达,另外5个在其它部位优势表达。【结论】通过全基因组扫描,获得大豆基因组的36个LEA家族基因,它们分属于8个不同的亚家族,分布于16条大豆染色体上,启动子区含有逆境相关顺式作用元件,基因表达具有一定特异性。
- 李乐许红亮杨兴露李雅轩胡英考
- 关键词:进化分析差异表达基因
- 一个大豆BURP蛋白家族基因的克隆与功能分析
- BURP蛋白家族是由Hattori等(1998)命名的,仅存在于植物中的一类具有相同结构域(BURP-domain)的一类蛋白,其命名来自于4个具代表性的成员BNM2、USP、RD22和PG1β蛋白的首字母,其中BNM2...
- 许红亮高雅吕胜军李乐胡英考
- 文献传递
- 大豆全基因组BURP蛋白基因的鉴定及其组织和逆境表达分析
- BURP蛋白家族是一类只存在于植物界、在植物的抗逆和生殖发育过程中起重要作用的蛋白。大豆中BURP家族蛋白虽然有零星报道,但还没有系统全面的鉴定与分析。本研究以生物信息学方法为手段对大豆全基因组的BURP家族成员进行了全...
- 许红亮吕胜军李乐胡英考
- 关键词:大豆生物信息学