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原子类型电拓扑指数在脂肪醇类化合物毒性预测研究中的应用被引量：6: 2008年; 采用原子类型电拓扑指数(ETSIAT)为结构描述子,对梨形四膜虫、番茄、红蜘蛛、发光细菌荧光素酶、呆鲦鱼以及鼠的脂肪醇毒性进行了定量构效关系(QSAR)研究.在偏最小二乘法建立QSAR模型的基础上,采用内部和外部两种验证方法对模型进行验证.研究结果表明:ETSIAT可以很好地表征脂肪醇与多种生物毒性相关的结构信息,所建模型具有良好的稳定性和外部预测能力.偏最小二乘模型分析结果显示:疏水性可能是影响脂肪醇毒性大小的主要因素,其毒性随C链长度的增加而增强,且相同C原子数的直链脂肪醇毒性明显高于支链脂肪醇;由于空间位阻效应,长链脂肪醇与短链脂肪醇可能存在不同的毒性作用机理。; 刘丽梅虎皮喜田龙瑞才李建李志良; 关键词：定量构效关系脂肪醇毒性

选择性雌激素受体调节剂的分子对接和定量构效关系研究: 雌激素受体/(estrogen receptor, ER/)是雌激素信号通路中的一个关键蛋白,具有ERα和ERβ两种亚型,在人体生长和组织代谢平衡中发挥关键作用。选择性雌激素受体调节剂/(Selective Estrog...; 李建; 关键词：选择性雌激素受体调节剂雌激素定量构效关系分子对接活性

雌激素β受体喹啉类配体的分子对接及3D-QSAR研究被引量：1: 2009年; 对33个喹啉衍生物的雌激素β受体活性进行了分子对接以及比较分子力场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA).研究发现对接得分与亲合活性pIC_(50)具有显著的线性相关关系.进一步分析表明:色烷环与喹啉环上的羟基与受体间的氢键作用,样本与受体口袋的疏水作用,以及样本与受体Arg346和Glu305残基间的静电作用是影响亲合活性的主要因素.此外,样本喹啉环上取代基的空间位阻作用亦对活性有重要影响.根据对接后的优势构象,将33个样本进行叠合并进行CoMFA与CoMSIA研究,其中以选用立体场、静电场、疏水场和氢键供体场建立的CoMSIA模型结果最优,其主成分,r^2,q^2(LOO)和r_(pred)~2分别为6,0.958,0.669和0.741.三维等势图分析结果与对接分析结果基本一致.; 李建梅虎龙云刘丽杨力; 关键词：三维定量构效关系分子对接喹啉雌激素Β受体

原子类型电拓扑状态指数预测吲哚喹唑啉衍生物的抗癌性被引量：4: 2009年; 采用原子类型电拓扑状态指数(ETSIAT)对17个吲哚喹唑啉衍生物的抗癌活性进行定量构效关系(QSAR)的研究.经逐步回归变量筛选,得到包含4个ETSIAT变量的最优偏最小二乘模型,其复决定系数R2、留一法交互验证复决定系数Q2和均方根误差RMSEE分别为0.806、0.736和0.248.将样本随机分为训练集和预测集后,采用相同变量组合对模型进行外部验证,结果显示模型具有较高的外部预测能力.模型分析结果显示,与抗癌活性相关的4个ETSIAT描述子对应结构碎片分别为≥N襒,—NH—,襒O,>N—.其中—NH—结构碎片与抗癌活性呈负相关关系,而≥N襒,>N—和襒O则与抗癌活性呈正相关关系.此外,研究亦显示,取代基R1上存在强的吸电子基团可显著提高化合物的抗癌活性,且影响抗癌活性的因素可能还有R2基团的空间位阻效应.据此设计出4个化合物的预测活性比最高活性样本分别提高7.7%、15.3%、23.1%和130%.; 梅虎刘丽杨力李建闫宁王琴; 关键词：抗癌定量构效关系

二芳基三嗪类HIV-1逆转录酶抑制剂的分子对接及3D-QSAR研究被引量：4: 2011年; 对40个二芳基三嗪类HIV-1逆转录酶抑制剂进行了分子对接研究,结果表明,2个疏水性芳香取代基团与结合口袋底部形成的疏水和范德华相互作用、三嗪环母核及其R4取代基与结合位点产生的氢键和静电作用以及R4取代基与袋口形成的空间位阻效应是影响该系列化合物活性的重要因素。根据对接优势构象进行分子叠合和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)研究,建立了4个高预测能力的3-D构效关系模型,其中以选用立体场、静电场和疏水场建立的CoMSIA模型为最优,其主成分,r2,q2(LOO)和r2pred分别为6,0.971、0.738和0.833。模型结果表明,3个力场对活性贡献由大到小依次为疏水场、静电场和立体场。CoMSIA等势图分析结果与对接分析相一致。; 王琴梅虎孙家英李建闫宁林治华; 关键词：三维定量构效关系分子对接逆转录酶抑制剂

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李建