欧阳曙光
- 作品数：10 被引量：123H指数：5
- 供职机构：军事医学科学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家杰出青年科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 一种新型人蛋白分泌相关因子
- 本发明提供了一种新型人蛋白分泌相关因子的cDNA序列及其所编码的氨基酸序列及其可能的功能。其cDNA序列全长为2768个碱基。其氨基酸序列全长为516个氨基酸。该基因定位于人染色体22q13.2～13.3,基因组序列全长...
- 贺福初张成岗鱼咏涛邢桂春魏汉东刘晓勤张绍文欧阳曙光罗凌刘孟珉吴祖泽
- 文献传递
- 序列同源性分析软件Blast的WEB界面构建及其应用被引量：12
- 2001年
- 基于局域网 (Intranet)内的PC/Linux服务器 ,构建了序列同源性分析软件Blast的WEB界面 .局域网内的所有计算机均可通过WEB方式访问该服务器进行公共数据库和自建数据库的查询 ,具有保密、高效、免费的优点 ,能够满足实验室和研究院所的大规模。
- 张成岗张利达欧阳曙光张启发贺福初
- 关键词：LINUX操作系统WEB界面生物信息学序列同源性分析软件
- 基于PC/Linux的核酸序列电子延伸系统的构建及其应用被引量：10
- 2002年
- 新基因全长cDNA序列的获得常常是分子生物学工作者面临的难题。人类基因组计划及其相关计划的实施导致了大量表达序列标签 (EST)的产生。利用一定的生物信息学算法 ,这些EST序列往往可用来对新基因片段进行延伸。采用Linux操作系统 ,利用Blast软件和Phrap软件以及EST数据库在微机上构建了EST序列的电子延伸系统 ,并对来自于人胎肝的 11386条EST序列和 5 11条插入片段全长cDNA序列进行了电子延伸 ,结果显示8373条EST序列和 389条插入片段全长cDNA序列得到了程度不等的延伸 ,部分结果通过RACE实验得到证实。该套系统可高效地、规模化进行EST序列的延伸 ,可为通过实验获得新基因全长cDNA序列提供重要线索。
- 张成岗孙焕东欧阳曙光吴松峰贺福初
- 关键词：生物信息学表达序列标签CDNA微机核酸序列
- 肝细胞生长因子Kringle的三维结构模建及与功能的关系被引量：2
- 1998年
- 利用同源模建的方法模拟得到了肝细胞生长因子4个Kringle域的三维结构。结果表明,HGFKringle与纤溶酶原Kringle的氨基酸序列具有较高的同源性,其功能区附近的序列比较保守。HGF的Kringlel和3与其它具有Lys结合功能的Kringle相比,功能区的残基发生了变化,可能丧失了结合Lys的功能,而2和4仍具有一定的该功能。根据Kringle 1的模建结构,推测该Kringle功能区的结构为一个通道,该通道的底部和一侧有部分疏水残基,同时两侧还分布着少量酸性或碱性残基,该通道可能具有结合特定肽链的功能,从而与Kringle 2一起实现HGF与受体结合的作用。
- 张绍文欧阳曙光毛秉智贺福初
- 关键词：肝细胞生长因子KRINGLE结构与功能关系
- 造血因子家族蛋白立体结构与进化关系的初步比较和分类
- 该文主要针对细胞因子中蛋白晶体结构已知的典型造血因子进行立体结构数据的比较与分类研究.作者使用自行编制的二级结构数据提取程序,将PDB数据文件中二级结构信息及其相关的原子坐标数据联系起来,再把具有方向性的α螺旋和β片导等...
- 欧阳曙光
- 关键词：造血因子聚类分析
- 基于PC/Linux的核酸序列分析系统的构建及其应用被引量：21
- 2001年
- 基于PC机和Linux操作系统 ,利用Phred/Phrap/Consed软件和Blast软件 ,构建了核酸序列大规模自动分析系统 .该套系统可自动完成从测序峰图向核酸序列的转化、载体序列去除、序列自动拼接、重复序列鉴定以及序列的相似性分析 ,可加速对大规模测序数据的分析和利用 .
- 张成岗欧阳曙光张绍文瞿祥虎鱼咏涛周钢桥吴松锋贺福初
- 关键词：PC机LINUX操作系统生物信息学大规模测序核酸序列
- 一种新的人神经分化因子
- 本发明提供了一种新的人神经分化因子的cDNA序列及其所编码的蛋白质序列。其cDNA序列全长为1990个碱基。其蛋白质序列全长为187个氨基酸。人神经分化因子可能具有促神经细胞分化和抑制神经细胞肿瘤生长的作用。
- 贺福初鱼咏涛张成岗张绍文欧阳曙光罗凌刘孟珉魏汉东吴祖泽
- 文献传递
- HLA空间构象的模拟比较被引量：7
- 1998年
- 通过对两对骨髓移植后发生移植物抗宿主病（ＧＶＨＤ）的供受体有差异的ＨＬＡⅠ类抗原的结构模拟和比较，发现差异ＨＬＡ抗原在空间构象上存在明显差异，并表现在分子表面上，这种蛋白质分子表面空间构象上的差异是移植后ＧＶＨＤ的引发因素。研究结果提示移植供受体差异ＨＬＡ蛋白质的模拟比较可以用于预测ＧＶＨＤ的发生。
- 刘明东欧阳曙光马恩普韩颍刘秀珍贺福初
- 关键词：组织相容性抗原分子构象移植物抗宿主病
- 细胞因子配体-受体亲和性对其共进化的约束作用
- 进化,发育,遗传并称为生命体所特有的三大基本特征,而进化更被看作是发育和遗传的源动力.从宏观上揭示了生物进化规律的“达尔文进化论”其核心是“自然选择”和“适者生存”但在微观的分子水平,“达尔文进化论”却受到了“中性进化”...
- 欧阳曙光
- 关键词：细胞因子亲和性分子进化达尔文进化论
- 文献传递
- 生物信息学:生物实验数据和计算技术结合的新领域被引量：77
- 1999年
- 大量的蛋白质和核酸数据的积累与理性地分析这些数据中所蕴涵的生物学意义的双重需要 ,产生了综合生物学研究与计算技术研究等领域最新成果的交叉性学科“生物信息学” .分别从基因序列或蛋白质结构等生物信息数据库、基因组分析或蛋白质结构分析等常规生物学计算软件、基因组数据库检索或蛋白质空间结构识别与预测等在线生物学计算服务器、人工生命等几个方面 ,概述了发展中的生物信息学的最近动态和有关信息 ,并同时提供了相关的热门生物信息学站点和资源在互联网上的超文本或文件传输协议地址 .此外 ,还介绍了讨论组、新闻组等其他形式的医学、生物学、信息学资源 .最后 ,就生物信息学存在的问题与前景进行了讨论 ,指出生物信息学将是一次国际性的科学大协作 。
- 欧阳曙光贺福初
- 关键词：生物信息学计算机科学计算技术
