汪自立
- 作品数：4 被引量：13H指数：1
- 供职机构：四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学交通运输工程自动化与计算机技术更多>>
- 基于RNA-Seq数据的大熊猫基因组补充注释
- 大熊猫Ailuropoda Melanoleura基因组已经测序并组装（AilMel1.0）,随后Ensembl和NCBI分别先后发布了AilMel1.0的注释结果。他们的注释主要依据已注释物种的同源对比,而这些对比的物...
- 汪自立李午佼杜联名范振鑫张修月岳碧松
- 关键词：大熊猫RNA-SEQ
- 文献传递
- 二斑叶螨和肩突硬蜱基因组微卫星分布规律研究被引量：13
- 2013年
- 本研究利用已公布的二斑叶螨Tetranychus urticae和肩突硬蜱Ixodes scapularis的全基因组测序结果,对其基因组中的微卫星序列进行了系统分析和比较。结果表明:在二斑叶螨基因组中共找到微卫星7934个,出现频率为1/11.45kb,占全基因组碱基总数的0.16%,其中三碱基重复微卫星最多,占总数的72.83%;在肩突硬蜱基因组中共找到550629个微卫星,出现频率为1/3.21kb,占全基因组碱基总数的0.57%,其中单碱基重复微卫星最多,占总数的73.74%。另外,肩突硬蜱基因组中微卫星的重复次数普遍高于二斑叶螨基因组中微卫星的重复次数,二斑叶螨基因组中微卫星的GC含量(34.10%)明显高于肩突硬蜱(24.35%)。微卫星家族方面,二斑叶螨基因组倾向拥有更多的唯一序列(P<0.0001)。A、T、AG、TC、TG、GAT、ATTT、AATA是两个物种共有的常见核心重复序列。
- 汪自立黄杰杜联明李午佼岳碧松张修月
- 关键词：二斑叶螨基因组微卫星
- 基于RNA-Seq数据的大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)基因组补充注释
- 大熊猫(Ailuropoda Melanoleura)基因组已经测序并组装(AilMel_1.0),随后Ensembl和NCBI分别先后发布了AilMel_1.0的注释结果.他们的注释主要依据已注释物种的同源对比,而这些...
- 汪自立李午佼杜联名范振鑫张修月岳碧松
- 关键词：大熊猫RNA-SEQ
- 大熊猫血液转录组分析
- 大熊猫Ailuropoda melanoleuca 是我国特有珍稀濒危动物,目前野生大熊猫仅有2500-3000只。大熊猫全基因组已测序完毕,预测了2万多个基因。然而大熊猫至今没有转录组数据,NCBI dbEST数据库中...
- 杜联明李午佼沈福军杨茗羽范振鑫汪自立简佐义侯蓉岳碧松张修月
- 关键词：大熊猫转录组免疫基因注释选择性剪接
