王海瑜
- 作品数:5 被引量:31H指数:3
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- 相关领域:生物学自动化与计算机技术更多>>
- 基于多分类器组合的蛋白质结构预测研究
- 随着人类基因组计划的顺利进展,越来越多的蛋白质序列被测定出来,利用理论计算方法来研究蛋白质的结构和功能从而指导实验是一项非常有意义的工作.该文从蛋白质的一级序列出发使用多分类器组合的一些算法对蛋白质结构进行分类研究,论文...
- 王海瑜
- 关键词:多分类器组合蛋白质结构支持向量机
- 文献传递
- 基于多支持向量机的DT算法研究及应用被引量:3
- 2004年
- 该文提出一种利用多个支持向量机分类器的输出向量来实现对分类器进行融合的决策模板算法,且采用交叉验证的方法得到模板,并将其运用到蛋白质结构类分类当中。实验表明:该文算法可有效提高分类精度,因此具有一定的应用价值。
- 王海瑜潘泉张洪才张绍武
- 关键词:支持向量机分类器融合
- 基于支持向量机的多类蛋白质折叠子预测被引量:10
- 2004年
- 基于支持向量机 ,以氨基酸组成成分、氨基酸组成成分与氨基酸残基指数自相关函数组合两种特征提取方法构成的特征向量表示蛋白质序列 ,对多类蛋白质折叠子问题进行了相关研究。结果表明 ,由氨基酸组成成分与氨基酸残基指数自相关函数组合构成的特征参数集 (其参数集以符号HOPT、PARJ、PONP、WOLS表示 ) ,其预测精度比氨基酸组成成分特征参数集有不同程度的提高。对于独立测试样本集 ,HOPT结果较好 ,采用“唯一的一对多”策略 ,其总预测精度为 41 .91 % ,比氨基酸组成成分提高 6.94个百分点 ,这些结果说明自相关函数含有一定的蛋白质空间折叠信息 ,支持向量机对于小样本分类预测是一种非常有效的方法。
- 张绍武潘泉张洪才王海瑜张敏贵
- 基于支持向量机和贝叶斯方法的蛋白质四级结构分类研究被引量:17
- 2003年
- 用支持向量机和贝叶斯两种方法对蛋白质四级结构进行分类研究。结果表明,基于支持向量机的分类结果最好,其10CV检验的总分类精度、正样本正确预测率、Matthes相关系数和假阳性率分别为74.2%、84.6%、0.474、38.9%;基于贝叶斯的分类结果没有支持向量机的分类结果好,但其10CV检验的假阳性率最低(15.9%)。这些结果说明同源寡聚蛋白质一级序列包含四级结构信息,同时特征向量的确表示了埋藏在缔合亚基作用部位接触表面的基本信息。
- 张绍武潘泉张洪才张云龙王海瑜
- 关键词:支持向量机贝叶斯方法蛋白质亚基
- 一种改进的加权融合算法
- 2004年
- 该文以多个支持向量机分类器的输出向量为基础,运用决策模板来估计各个分类器的精度,然后使用常见的融合规则实现融合算法,并将其运用到蛋白质结构类分类当中。实验表明:该算法可有效提高分类精度,因此具有一定的应用价值。
- 王海瑜潘泉张洪才
- 关键词:分类器融合支持向量机