王海霞
- 作品数：2 被引量：6H指数：2
- 供职机构：首都医科大学基础医学院病原生物学系更多>>
- 发文基金：艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 潜伏期结核分枝杆菌HLA-A~*0201限制性CD8^+CTL表位的高通量筛选被引量：4
- 2013年
- 目的采用生物信息学软件预测并筛选结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)HLA-A*0201限制性CD8+CTL表位。方法以标准株H37Rv和北京基因型结核分枝杆菌为研究对象,利用结核分枝杆菌全基因组芯片技术筛选缺氧培养后表达上调的基因,应用SYFPEITHI生物信息学软件分析相关基因编码的多肽序列中可能存在的HLA-A*0201限制性CD8+CTL表位;利用T2细胞进行HLA-A2结合试验,检测候选表位肽的结合亲和性,以HLA-A2解离试验检测其结合稳定性,从而筛选出HLA-A*0201限制性CD8+CTL表位。结果从SYFPEITHI数据库预测到的表位肽中筛选出4条能够结合HLA-A*0201分子的表位肽,通过HLA-A2结合试验得到Rv0440-1(KLQER-LAKL)、Rv0440-9(TLLKGAKEV)、RV0350-6(VLKGEVKDV)与HLA-A*0201分子之间均有较高的亲和性(FR>1.5),通过HLA-A2解离试验得到候选表位肽Rv0440-1和Rv0440-9与HLA-A*0201分子的结合具有较高的稳定性(DC50>4h)。结论经生物信息学技术预测以及HLA-A2结合与解离试验初步筛选出的Rv0440-1(KLAGGVAVI)和Rv0440-9(TLLKGAKEV)是潜伏期结核分枝杆菌HLA-A*0201限制性CD8+CTL的优势表位,但有待进一步实验验证。
- 孙燕妮王一松王海霞平国玲王甦民张力平
- 关键词：H37RVCTL表位
- 结核分枝杆菌Rv0440 CTL表位肽的免疫原性研究被引量：2
- 2014年
- 目的体外鉴定结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,Mtb)Rv0440蛋白序列中表位肽362-370aa和369-377aa的HLA-A*0201限制性CD8+CTL表位的免疫原性,为基于表位的结核疫苗研究提供实验依据。方法根据T2细胞HLA-A*0201分子与多肽结合力分析实验结果,选取结核分枝杆菌Rv0440蛋白质氨基酸序列中对HLA-A*0201分子高亲合力的Rv0440-1(362-370aa,KLQERLAKL)和Rv0440-2(369-377aa,KLAGGVAVI)作为候选表位肽。用候选表位肽刺激PPD(+++)健康志愿者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMC)检测细胞分泌IFN-γ的水平。用候选表位肽诱导特异性CTL细胞,检测特异性CTL细胞对负载表位肽的T2细胞的杀伤活性,观察Rv0440-1和Rv0440-2的HLA-A*0201限制性CD8+CTL表位的免疫原性。结果 ELISPOT实验结果显示,表位肽Rv0440-1能够明显诱导HLA-A*0201(+)、PPD(+++)健康志愿者PBMC分泌IFN-γ(P<0.05);且表位肽Rv0440-1负载DC诱导的CTL在效靶比为10∶1时对负载相应表位肽的T2细胞的特异性杀伤活性高于对照组(P<0.05);与对照组相比,表位肽Rv0440-2没有诱导能力。结论表位肽Rv0440-1(362-370aa,KLQERLAKL)具有良好的免疫原性,是有效的结核分枝杆菌的HLA-A*0201限制性CTL表位。
- 王海霞孙燕妮王甦民赵亭平国玲张力平
- 关键词：结核分枝杆菌表位肽
