陶定银
- 作品数：11 被引量：9H指数：2
- 供职机构：中国科学院大连化学物理研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金全球变化研究国家重大科学研究计划中国科学院知识创新工程重要方向项目更多>>
- 相关领域：理学医药卫生生物学更多>>
- 基于M13噬菌体展示单链抗体文库的新型蛋白质均衡器的研制及其在肾病患者尿蛋白分析中的应用被引量：1
- 2009年
- 通过将展示单链抗体(scFv)文库的M13噬菌体固定于冷凝胶整体柱表面制备了一种新型蛋白质均衡器。由于展示的scFv片段具有种类多、数目大以及与蛋白质结合的特异性强等优点,因此其非常适合用于复杂蛋白质样品的预处理。将肾病患者尿蛋白在平衡器上反复上样5次后,依次使用2mol/LNaCl、50mmol/LGly-HCl(pH2.5)和凝血酶溶液洗脱与均衡器结合的蛋白质,收集各馏分,并采用串联微柱反相液相色谱-电喷雾质谱进行蛋白质的分离鉴定。与未经均衡器处理的样品相比,鉴定的蛋白质数目由142个提高到396个。此外,凝胶电泳的分析结果显示,在上样流出液中蛋白质的浓度差异明显变小,大量的高丰度蛋白质存在于NaCl洗脱液中。上述结果表明,基于M13噬菌体展示scFv文库的新型蛋白质均衡器能够有效减小样品中蛋白质的浓度差异,有利于发现更多的低丰度蛋白质。
- 赵鹏陶定银梁振张丽华张玉奎
- 关键词：蛋白质肾病患者
- 用于液相色谱与质谱联用的毛细管喷雾接口的制作装置
- 本发明涉及用于液相色谱分离系统与质谱联用接口的制作，具体地说是用于液相色谱与质谱联用的毛细管喷雾接口的制作装置，包括“U”型支架，“U”型支架的两个顶端分别设置有同轴的横向滑槽，在滑槽内分别放置有中空的调节螺杆，调节螺杆...
- 张丽华陶定银段继诚孙良亮张维冰梁振张玉奎
- 文献传递
- 非水溶性药物潜在靶蛋白筛选方法探索
- 2011年
- 针对化学蛋白质组学在筛选非水溶性药物的靶蛋白中存在的问题,建立了以非水溶性药物颗粒为载体的靶蛋白筛选方法.通过避免药物固定化,不仅可以保留全部的药物官能团,而且减少了蛋白质在固载基质上的非特异性吸附,可提高获得数据的可信度.将非溶性药物地塞米松颗粒直接与人小细胞肺癌H446细胞提取蛋白质通过间歇性振荡孵育24h,然后采用缓冲液清洗药物颗粒,最后对药物颗粒特异性结合的蛋白质进行酶解和分离鉴定.结果表明,筛选出41个潜在的药物靶蛋白,参与了与DEX药物作用机理相关的多种蛋白质代谢通路和糖代谢通路,同时还发现部分蛋白质参与了帕金森症疾病过程.
- 陶定银夏思敏刘晋湘张丽华梁振张玉奎
- 关键词：地塞米松
- 用于液相色谱与质谱联用的毛细管喷雾接口的制作装置
- 本发明涉及用于液相色谱分离系统与质谱联用接口的制作，具体地说是用于液相色谱与质谱联用的毛细管喷雾接口的制作装置，包括“U”型支架，“U”型支架的两个顶端分别设置有同轴的横向滑槽，在滑槽内分别放置有中空的调节螺杆，调节螺杆...
- 张丽华陶定银段继诚孙良亮张维冰梁振张玉奎
- 文献传递
- 串联微柱液质联用系统用于蛋白质组学研究
- 本文通过将几根易于填充的短微柱通过微死体积二通相串联,构建了串联微柱液质联用系统,并用于蛋白质组学研究。在单次的分离分析中,可鉴定1692个蛋白质(假阳性率<1％),将一维的单次分析能力达到与普通二维色谱相当的分析能力。
- 陶定银梁振张丽华张玉奎
- 关键词：液相色谱质谱联用蛋白质组
- 文献传递
- 基于紫杉醇药物颗粒直接作用的化学蛋白质组学靶靶蛋白筛选方法
- 夏思敏陶定银袁辉明梁振张丽华张玉奎
- 关键词：紫杉醇相互作用
- 用于液相色谱分离系统中色谱柱的串联方法
- 本发明涉及液相色谱分离系统中色谱柱之间的连接，具体地说是用于液相色谱分离系统中色谱柱的串联方法，1)在主体色谱柱与被接色谱柱的连接端分别对应的设有一个金属或PEEK连接头；2)在主体色谱柱和被接色谱柱连接端的端面分别设置...
- 张丽华陶定银乔晓强朱贵杰张维冰梁振张玉奎
- 文献传递
- 全二维微柱液相色谱-质谱鉴定人胃癌组织中的差异蛋白质被引量：6
- 2009年
- 构建了以阳离子交换色谱-反相色谱(SCX-RPLC)为分离模式的新型全二维微柱液相色谱-质谱分离平台。采用了醋酸铵缓冲液梯度洗脱,实现了第一维肽段的分步洗脱,洗脱的肽段经富集除盐后通过接口进入反相色谱微柱,通过线性梯度实现第二维进一步分离,最后进入质谱进行检测。采用此平台分析了人胃癌组织与正常组织提取蛋白质信息,其中正常胃组织鉴定蛋白质数为537个,而癌症组织鉴定蛋白质数目为506个。对胃癌和正常组织两种提取蛋白质酶解产物的蛋白质检索结果进行比较分析,将鉴定的蛋白质按照物理性质进行分布,找出正常组织与癌症组织间蛋白质差异,筛选出一种可能发生变异的癌症特有蛋白。
- 罗福文陶定银赵鹏张丽华贾玉杰张玉奎
- 关键词：胃癌组织蛋白质组
- 人神经母细胞瘤的磷酸化膜蛋白质组分析被引量：2
- 2011年
- 针对人神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞系的磷酸化膜蛋白质组,发展了基于多酶酶解法结合杂化硅胶基质固定化钛离子亲和色谱(Ti 4+-IMAC)整体柱富集的分析策略。该方法通过对细胞裂解液进行超速离心,以及1 mol/LNaCl和0.1 mol/L Na2CO3顺序清洗,获得膜蛋白质组分。所提取的蛋白质分别经胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶和胃蛋白酶平行酶解,产生的肽段经Ti 4+-IMAC整体柱选择性富集磷酸肽后,采用纳升级反相液相色谱分离和质谱鉴定,成功鉴定到43个磷酸化蛋白质,其中有14个定位于膜上。研究结果表明,采用该策略开展SH-SY5Y细胞系磷酸化膜蛋白质组学分析有望加速对该肿瘤的研究和相关潜在标记物的筛选。
- 侯春彦马俊锋陶定银张丽华梁振张玉奎
- 关键词：人神经母细胞瘤膜蛋白质
- 液相色谱-质谱法比较分析正常人与胃癌患者的胃组织蛋白质
- 2010年
- 通过蛋白质组学技术筛选胃癌相关标志物是目前胃癌研究的热点,也是早期诊断的关键。针对组织蛋白质提取物非常复杂的特点,并根据疏水性的差异,采用反相液相色谱对正常及癌症组织提取蛋白质进行分离。通过比较正常及癌症组织提取蛋白质的谱图差异,收集并酶解差异最大的保留时间为45～47min的馏分,采用液相色谱-多级质谱联用(LC-MS/MS)鉴定其酶解产物。鉴定结果显示,正常及癌症组织中的共有蛋白质为9个,正常组织中有6个特异蛋白质,而癌症组织中有17个特异蛋白质。通过进一步分析,筛选出胃癌组织中含有的丰度较高的两个蛋白质。应用生物信息学方法分析这些蛋白质,能为将来的药物靶点、药物作用通路研究提供更多的信息。
- 罗福文陶定银赵鹏张凌怡贾玉杰张维冰
- 关键词：特异蛋白质癌症胃组织
