赵佳琛
- 作品数：46 被引量：210H指数：8
- 供职机构：北京市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：北京市卫生系统高层次卫生技术人才培养项目首都卫生发展科研专项北京市优秀人才培养资助更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 一组针对新冠病毒omicron株S基因的特异性引物组及其应用
- 本发明提供了一组针对新冠病毒omicron株S基因的特异性引物组及其应用，所述特异性引物组包括上游引物和下游引物，所述上游引物的核苷酸序列如SEQ NO：1所示，所述下游引物的核苷酸序列如SEQ NO：2所示，所述的引物...
- 崔淑娟赵佳琛刘医萌彭晓旻卢桂兰石伟先潘阳张代涛杨鹏王全意
- 2021-2022年流感监测季北京市乙型Victoria系流感病毒血凝素基因特性和抗原性分析
- 2023年
- 目的:分析2021-2022年流感监测季北京市乙型Victoria系流感病毒(BV)的血凝素(hemagglutinin, HA)基因特性、抗原性及与流感疫苗组分株的匹配性。方法:采集2021-2022年流感监测季流感样病例(influenza like-illness, ILI)咽拭子样本经MDCK和鸡胚培养分离流感病毒,提取病毒核酸后测序。应用MEGA5.0进行病毒HA基因的核苷酸和氨基酸变异,采用maximum likelihood方法构建HA基因的遗传进化树,在线预测N-糖基化位点。SWISS-MODEL同源建模,建立BV毒株HA的蛋白质三维空间模拟图。通过血凝抑制(hemagglutination inhibition, HI)试验,进行毒株的抗原性分析。结果:共收集402株BV毒株,选取58株测序获得HA基因全长序列,与本年度的疫苗组分BV株(B/Washington/02/2019)HA基因相比较显示,有27个氨基酸位点发生变异,其中11个变异位点位于4个不同的抗原决定簇。遗传进化树分析显示:3个进化分支的毒株共同流行,其中54株(54/58,93.10%)HA基因位于Clade 1A.3a2分支,2株(2/58,3.45%)位于Clade 1A.3a1分支上,2株(2/58,3.45%)与2021-2022年度疫苗组分BV株在同一分支Clade 1A.3。其中2株相对于疫苗组分BV株增加一个197位糖基化位点,其余56株的糖基化位点未发现变化。抗原性分析结果显示:35株为疫苗组分BV株的类似株(35/58, 60.34%),23株为低反应株(23/58,39.66%)。结论:2021-2022流感监测季有3个进化分支的BV毒株在北京市人群中共同流行,其中Clade 1A.3a2毒株为优势株(93.10%),且与疫苗组分BV株进化距离有一定的偏离;占比近四成(39.66%)的毒株为疫苗低反应株。本研究结果提示,持续监测流感流行毒株的变异,及时为疫苗组分株筛选提供实验室依据,是应对流感大流行的基本技术保证。
- 卢桂兰崔淑娟赵佳琛刘医萌石伟先冯兆民潘阳张代涛杨鹏王全意彭晓旻
- 关键词：乙型流感病毒HA基因抗原性分析
- 孩子发热、出疹, 当心猩红热
- 2023年
- 一位妈妈带着宝宝来到医院,向医生描述:“最近半个月,幼儿园里有小朋友发热请假,具体原因不清楚。3天前,我家宝宝出现发热、咽痛,身上还出了很多红色疹子,您快给看看到底是什么原因呀?”医生检查后发现,宝宝精神较差,来就诊前已服用退热药,但是体温仍有38.7C;咽部明显充血水肿,有脓性分泌物附着;全身可见弥漫性充血皮疹,按压可褪色;舌头可见白苔覆盖,舌乳头红肿凸出,典型的“草莓舌”体征;血常规检查提示,白细胞偏高。结合患儿临床表现、各项检查结果,医生综合诊断为猩红热。
- 赵佳琛
- 关键词：白苔脓性分泌物血常规检查舌乳头
- 北京市2021年乙型Victoria系流感病毒流行特征与血凝素基因变异分析被引量：6
- 2022年
- 目的掌握2021年北京市流感流行特征及乙型Victoria系(简称BV)流感病毒血凝素(hemagglutinin, HA)基因、抗原性变异情况, 为北京市流感防控提供科学依据。方法对北京市2021年1—11月流感病原学监测结果进行统计分析, 并随机抽取15株BV流感病毒, 通过HA基因扩增测序, 分析其基因变异和进化特征。结果研究期间共收集流感样病例样本16 097份, 其中核酸检测阳性208份, 经型别鉴定BV流感病毒205份(98.56%)、乙型Yamagata(简称BY)系流感病毒3份(1.44%)。15株BV流感病毒HA基因序列与疫苗株B/Washington/02/2019相比, 核苷酸相似度为98.39%~98.75%, 氨基酸相似度为97.86%~98.40%。基因进化分析显示15株BV流感病毒均分布于Clade1A.3a2分支, 与疫苗株相比存在多位点变异。15株BV流感病毒有11个糖基化位点。1株(6.6%)为疫苗株的低反应株。结论 2021年北京市监测到的流感病毒中BV流感病毒占绝对优势, 其HA基因位点多处发生变异, 提示对该亚型变异的持续监测至关重要, 为制定流感防控策略提供科学依据。
- 赵佳琛卢桂兰马春娜刘医萌彭晓旻崔淑娟吴双胜王全意杨鹏石伟先
- 关键词：乙型流感病毒基因变异进化分析抗原性疫苗株
- 检测基因及样本类型对人感染H7N9禽流感病毒实验室检测结果的影响被引量：2
- 2015年
- 目的 检测北京市H7N9禽流感病毒感染病例及密切接触者样本中H7N9流感病毒相关基因,分析不同靶基因、不同类型样本对检测结果的影响。方法 收集2013年4月～7月北京市人感染H7N9禽流感病例及密切接触者咽拭子、痰、气管灌洗液、血清样本,提取病毒RNA,检测甲型流感病毒基质蛋白（influenza A matrixprotein,Am）基因、血凝素-7（hemagglutinin7,H7）基因和神经氨酸酶-9（neuraminidase9,N9）基因,并对结果进行统计分析。结果 H7N9禽流感确诊病例样本中Am基因、H7基因和N9基因的检测阳性率分别为68.3%、66.0%和41.5%,N9基因阳性率低于前两者。在定量检测中,Am基因、H7基因和N9基因的定量限分别为10copies/ml、10copies/ml和100copies/ml。在各类型检测样本中,气管灌洗液样本的病毒核酸检出率较高,未在血清和结膜分泌物样本中检出病毒核酸。结论 在人感染H7N9禽流感检测中,应尽量使用气管灌洗液等下呼吸道样本,综合判定检测结果,为临床治疗提供参考依据。
- 石伟先潘阳赵佳琛彭晓旻崔淑娟卢桂兰张代涛刘医萌王全意
- 关键词：禽流感流行病学
- 2011-2014年北京地区儿童咽扁桃体炎感染病例A组链球菌emm分型研究被引量：7
- 2015年
- 目的了解2011-2014年北京市儿童咽扁桃体炎感染病例A组链球菌(group A streptococcus,GAS)emm基因型别分布情况。方法采集2011 2014年北京地区36家医院儿科门、急诊咽扁桃体炎感染病例咽拭子标本,分离GAS菌株,用聚合酶链反应(PCR)方法扩增emm基因进行测序和分型,分析不同人群,和临床诊断结果的emm型别特征。结果共有739个病例纳入研究,检测到10种emm基因型和32种emm基因亚型。主要基因型为emm12和emm1,分别占所有型别比例的62.2%和35.0%;主要基因亚型为emm12.00和emm1.00,分别占所有亚型的比例为53.2%和31.9%;发现两种新的emm亚型,分别为st1258和st485。基因型emm12 GAS感染人群主要分布在中心城区,占59.8%;基因型emm1 GAS感染人群主要分布在北部郊区,占49.4%。这两种基因型的地区分布,时间分布和感染人群的平均年龄差异均有明显的统计学意义,人群性别构成差异无统计学意义。结论北京地区儿童GAS咽扁桃体炎感染病例emm基因优势型别为emm12和emm1,这两种型别在不同地区和年龄人群中的分布存在明显差异。
- 张代涛杨鹏吴双胜赵佳琛卢桂兰郭婧王全意彭晓旻
- 关键词：A组链球菌
- 一种快速核酸提取试剂在流感病毒检测中的应用评价被引量：6
- 2016年
- 目的探讨一种快速核酸提取试剂在流感病毒检测中的适用性及有效性。方法选取流感病毒H3亚型、乙型Yamagata系细胞株和甲型H1N1型鸡胚株各1株,对其倍比稀释液及2015年北京市流感病原学监测阳性的67份咽拭子样本,同时采用快速提取法及离心柱提取法提取病毒核酸,经实时荧光PCR法进行定性、定量检测,检测结果采用SPSS19.0软件进行统计分析。结果快速提取法提取细胞培养液、鸡胚培养液中流感病毒核酸的最低检测限高于离心柱法10倍,咽拭子样本则高100倍;快速提取法提取核酸后检测到的病毒载量均低于离心柱法,其中对含有病毒量较高的毒株检测到的病毒载量低于离心柱法10倍,而对病毒量较少的咽拭子样本,则低100倍;快速提取法稳定性优于离心柱法;提取后的核酸-80℃保存10 d后冻融复测,快速提取法核酸损失量大于离心柱法。67份离心柱提取法检测阳性咽拭子样本使用快速提取法提取核酸后检测,两种方法阳性符合率总计为92.54%,其中10~102拷贝/ml组,阳性符合率为76.92%,102~103拷贝/ml组,阳性符合率为92.59%,〉103拷贝/ml组,阳性符合率为100%。结论快速提取法具有稳定性高、易于操作、不易污染的优势,适用于细胞培养液、鸡胚培养液等病毒含量较高的大量样本中流感病毒核酸提取,适于检测样本量大、人手不足、设备欠缺的基层实验室使用;但-80℃冻融后核酸损失量较大,不宜反复冻融后使用;传统的离心柱法对于病毒含量较少的咽拭子样本及核酸需被反复冻融使用时具有优势。
- 石伟先张靖孙瑛刘医萌潘阳赵佳琛张代涛崔淑娟彭晓旻卢桂兰陈丽娟王全意杨鹏
- 北京市106名儿童A组链球菌感染临床特征及药敏分析被引量：1
- 2020年
- 目的了解北京市A组链球菌(GAS)感染儿童的临床症状,分析GAS分离株对抗菌药物的耐药性,为GAS的诊断和用药提供依据。方法将2015年5月-2018年7月在北京市36家医院经实验室分离培养确诊的106例儿童GAS菌株为研究对象,收录感染儿童的临床症状,采用VITEK-2全自动微生物分析系统和GPS-67药敏卡测定分离株对抗菌药物的最低抑菌浓度,依据CLSI 2015年的M100-S22判定标准判断其对抗菌药物的敏感性。结果临床诊断为猩红热或咽部感染且GAS阳性的儿童均出现体温升高,58.42%的最高体温超过38.5℃,55.45%有咽峡炎、68.32%有扁桃体炎、50.50%有口腔黏膜充血的症状。咽峡炎、扁桃体炎和口腔黏膜充血在临床诊断为猩红热和咽部感染的儿童间差异无统计学意义(P>0.05)。分离的106株A组链球菌对克林霉素、红霉素、四环素的耐药率分别为100.00%、99.06%和97.17%,临床诊断为猩红热和咽部感染的儿童所分离的菌株对红霉素和四环素的耐药性差异无统计学意义(P>0.05)。结论咽峡炎、扁桃体炎和口腔黏膜充血不能用于临床中猩红热和咽部感染儿童的鉴别诊断,青霉素、氨苄青霉素、左旋氧氟沙星、链阳霉素、利奈唑铵、替加环素均可用于治疗GAS感染,而克林霉素、红霉素、四环素则谨慎使用。
- 刘医萌马春娜潘阳赵佳琛卢桂兰张代涛彭晓旻杨鹏王全意
- 关键词：A组链球菌耐药性临床症状猩红热
- 北京市儿童A族链球菌emm基因型别及药敏特征变化分析
- 2022年
- 目的了解北京市儿童A族链球菌(GAS)M蛋白基因(emm基因)型别及药敏特征变化。方法回顾性研究。收集2018年、2019年、2021年北京市16区猩红热病原学监测哨点医院儿童临床诊断猩红热及咽部感染病例咽拭子样本分离的GAS菌株。采用PCR扩增及测序进行emm基因分型,采用微量肉汤稀释法测定10种抗生素最低抑菌浓度(MIC)。采用χ^(2)检验和Fisher′s确切概率法进行组间比较。结果共收集GAS菌株557株,检测到11种emm基因型(emm1、emm3、emm4、emm6、emm11、emm12、emm22、emm75、emm89、emm128、emm212)。其中emm1型42.73%(238/557株),emm12型48.65%(271/557株),其他emm型8.62%(48/557株)。emm1、emm12、其他emm型2018年分别为37.50%(105/280株)、57.14%(160/280株)、5.36%(15/280株);2019年分别为49.05%(129/263株)、39.54%(104/263株)、11.41%(30/263株);2021年分别为28.57%(4/14株)、50.00%(7/14株)、21.43%(3/14株)。2018年和2019年≤6岁儿童组中感染emm12型的构成比均高于>6岁儿童组(62.50%比46.88%,46.36%比30.36%),差异均有统计学意义(χ^(2)=7.182、6.973,均P<0.05)。选取225株GAS进行药敏检测,结果对青霉素、左氧氟沙星、美罗培南、利奈唑胺、头孢噻肟、头孢吡肟、万古霉素7种抗生素敏感率均为100.00%,对红霉素、四环素、克林霉素的耐药率分别为:2018年88.57%(93/105株)、87.62%(92/105株)、86.67%(91/105株);2019年94.34%(100/106株)、94.34%(100/106株)、87.74%(93/106株);2021年3种抗生素耐药率100.00%(14/14株)。2018年青霉素MIC_(50)、MIC_(90)均为0.03 mg/L;2019年分别为0.03 mg/L、0.06 mg/L;2021年均为0.06 mg/L。225株GAS中207株存在耐药,且均为联合耐药,红霉素-四环素-克林霉素三重耐药占94.69%(196/207株),红霉素-克林霉素双重耐药占4.35%(9/207株),红霉素-四环素双重耐药占0.97%(2/207株)。结论北京市2018年、2019年、2021年儿童GAS的emm基因型别多样,优势基因型为emm12与emm1,以emm12为主导流行型别。GAS菌�
- 赵佳琛刘医萌彭晓旻崔淑娟卢桂兰石伟先马春娜李夫张代涛王全意杨鹏
- 关键词：A族链球菌药敏试验儿童
- 一种检测新型冠状病毒的变异位点的引物组合物
- 本发明涉及分子生物学检测技术领域，具体提供了一种检测新型冠状病毒的变异位点的引物组合物及其应用。本发明还提供了一种SARS‑CoV‑2的变异位点的检测方法，所述的检测方法将特异性引物组合物、单碱基延伸反应以及基质辅助激光...
- 张代涛黄瑛张新沈玲羽潘阳梁志超冯兆民李夫吕冰崔淑娟刘医萌赵佳琛彭晓旻卢桂兰石伟先杨鹏王全意
