赵秀琴
- 作品数：6 被引量：18H指数：3
- 供职机构：中国疾病预防控制中心传染病预防控制所更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项国家自然科学基金安徽省卫生厅科学研究基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 5个VNTR位点用于我国三省65株结核分支杆菌菌株基因分型的研究被引量：5
- 2004年
- 目的初步探讨我国结核分支杆菌的数目可变串联重复位点 (VariableNumberofTandemRepeat ,VNTR)的分布特征及其在基因分型中的应用。方法 选取结核分支杆菌基因组中的 5个VNTR位点 ,采用PCR和琼脂糖凝胶电泳技术 ,并应用BioNumerics(Version3.0 )软件进行处理 ,分析结核分支杆菌DNA中VNTR分布多态性。结果 检测分析的 6 5株结核分支杆菌具有明显的多态性 ,共分成 12个不同的型别 ,其中大部分菌株属于一个型 ,占 6 4 .6 % ,其他菌株呈散在分布。结论 我国结核分支杆菌的VNTR具有明显的多态性。VNTR分型技术具有简便、快速、特异、重复性好等优点 ,可广泛用于结核病的分子流行病学研究。
- 刘敬华万康林刘志广张媛媛赵秀琴王庆谭云洪许卫国
- 关键词：VNTR位点结核分支杆菌菌株基因分型
- 228株结核分枝杆菌MLVA分型研究被引量：1
- 2010年
- 目的:通过多位点可变数目串联重复序列(MLVA)分型,了解甘肃省临床分离结核分枝杆菌菌株基因型情况。方法:选择标化的15个VNTR位点,对临床分离菌株DNA进行检测,DNA指纹图谱使用BioNumerics4.5软件进行统计分析,得出聚类分析结果。结果:228株结核分枝杆菌被分为4大基因群,7个主要基因型,分别包含13(5.7%)、3(1.3%)、7(3.1%)、1(0.4%)、171(75.0%)、31(13.6%)、2(0.9%)个菌株;在株水平基因分型上,93(40.8%)株为独立基因型;其余菌株基因型分别包含2～10株结核分枝杆菌,共构成132个基因簇。结论:甘肃省临床分离结核分枝杆菌菌株存在丰富的基因多态性,MLVA方法具有较高的基因分型能力,可以满足结核分枝杆菌株水平DNA分型的需要。甘肃省临床分离结核分枝杆菌菌株主要为北京家族基因型菌株。
- 同重湘赵秀琴马建军刘志广曹文静杨永红吕冰姜元万康林
- 关键词：结核分枝杆菌基因分型
- DNA数目可变串联重复序列用于结核分枝杆菌分型研究被引量：8
- 2005年
- 目的 采用数目可变串联重复序列 (VNTR)分型方法对安徽省的 5 2株结核分枝杆菌进行分子分型研究 ,探讨该方法用于结核分枝杆菌分型的作用。方法 设计引物 ,采用PCR和琼脂糖凝胶电泳技术对结核分枝杆菌 13个VNTR位点进行检测 ,并通过BioNumerics 3 0软件进行DNA指纹图谱多态性分析。结果 5 2株结核分枝杆菌可分 4个类别 ,其中 88. 5 %菌株属于一个型 ,其他 3个型所占比例很小 ,分别为 5 . 8%、3 .8%和 1 .9%。结论 来自安徽的结核分枝杆菌存在主要的流行型 ,VNTR分型技术简便、快速 ,是较好的结核分枝杆菌分型方法。
- 阚晓宏万康林金玉莲刘敬华杨建安刘志广丁虹赵秀琴王庆唐婧
- 关键词：结核分枝杆菌数目可变串联重复序列基因分型
- IS6110-PCR分型方法用于安徽、湖南、江苏三省结核病分子流行病学的初步研究被引量：4
- 2005年
- 目的了解安徽、湖南、江苏省结核分支杆菌的基因型状况及其分子流行病学规律。方法以结核分枝杆菌插入序列IS6110序列为模板,设计一对特异外向引物,建立一种结核分枝杆菌的快速分子生物学分型方法——IS6110PCR分型方法,进行三省结核病分子流行病学研究。结果根据IS6110PCR指纹图谱,191株安徽、湖南和江苏三省的结核分枝杆菌菌株可被分成6个主要的基因型(Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ,Ⅴ和Ⅵ),江苏省的主要基因型为I和V型,安徽省的主要基因型为III型,湖南省的主要基因型为I和II型,V型菌株全部为江苏省菌株,IV型菌株全部为湖南省菌株。结论三省之间结核分支杆菌的基因型存在明显的差异,各自存在着独立的流行菌型,其真实原因有待进一步研究。
- 陈立新谭云洪王庆许卫国刘志广高源赵秀琴阳波阚晓宏万康林
- 关键词：结核分枝杆菌聚合酶链反应指纹图谱分子流行病学
- 卡介苗中PE和PPE家族蛋白B细胞抗原表位多态性研究被引量：1
- 2016年
- 目的了解13株卡介苗(bacille calmette-guérin,BCG)基因组中由PE/PPE基因家族编码的B细胞抗原表位分布情况,分析其对BCG免疫保护力的潜在影响。方法从国际免疫表位数据库(Immune Epitope Data base,IEDB)中检索结核分枝杆菌B细胞抗原表位,与结核分枝杆菌参考菌株H37Rv的蛋白质组进行序列比对,确定PE/PPE基因家族编码B细胞抗原表位序列;并与13株BCG基因组进行序列比对,提取表位编码序列,分析其在BCG中的分布与变异。结果 6个PE/PPE基因家族的基因编码28个B细胞抗原表位,21个B细胞抗原表位在13株BCG中高度保守,7个B细胞抗原表位在BCG中发生基因变异,变异表位分别产生于BCG的不同形成期。结论 PE/PPE基因家族所表达的蛋白大多为细菌表面蛋白,PE/PPE蛋白家族中B细胞抗原表位的变化可能对BCG的保护力产生影响,应继续开展基于B细胞表位的BCG遗传特征研究。
- 李马超刘海灿赵秀琴万康林
- 关键词：卡介苗抗原表位
- 甘肃省228株结核分枝杆菌临床分离株Spoligotyping分型研究被引量：1
- 2010年
- 目的利用间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)方法对甘肃省结核分枝杆菌流行株进行分型研究,了解目前甘肃省结核分枝杆菌流行株基因型的基本情况,为甘肃省结核病防控提供分子流行病学依据。方法采用Spoligo-typing对甘肃省228株临床分离结核分枝杆菌进行基因分型,结果使用Bionumerics-5.01软件统计、分析,并与SpolDB4数据库进行比对,得出菌株分型结果。结果228株结核分枝杆菌被分为北京家族(Beijingfamily)和非北京家族(Non-Beijingfamily)2大基因群,其中北京家族基因群占88.6%(202/228)。非北京家族基因群为11.4%(26/228),228株结核分枝杆菌构成23个基因簇,其中独立基因型12个。结论北京家族基因群菌株在甘肃省结核分枝杆菌流行株中占据绝对优势地位,对该基因群菌株引发的结核病应给予密切关注并应加强对北京家族基因型菌株生物学特性研究。
- 同重湘刘志广马建军赵秀琴曹文静杨永红吕冰姜元万康林
- 关键词：结核分枝杆菌基因分型
