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赵秀芹: 作品数：119 被引量：545H指数：14; 供职机构：中国疾病预防控制中心传染病预防控制所更多>>; 发文基金：国家科技重大专项国家自然科学基金艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>; 相关领域：医药卫生生物学更多>>

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新疆出血热病毒分子特征研究及诊断方法建立被引量：4: 2006年; 唐青杭长寿冯崇慧赵秀芹司马义巴吾东张玉贞李凡陈化新; 关键词：新疆出血热病毒分子生物学研究虫媒病毒病病原学研究克里米亚

间隔区寡核苷酸分型和多位点可变数量串联重复序列分析在结核分枝杆菌基因分型中的应用被引量：4: 2007年; 目的评价间隔区寡核苷酸分型（Spoligotyping）及多位点可变数量串联重复序列分析（MLVA）方法在结核分枝杆菌基因分型研究中的应用。方法收集224株结核分枝杆菌临床分离株，分别采用Spoligotyping及MLVA方法进行基因分型，比较两种方法的分型效果，评价两种方法在结核分枝杆菌基因分型中的应用。结果使用Spoligotyping方法，224株结核分枝杆菌呈现出55种基因型，39株具有独特的基因型，其余185株菌呈现出16种基因型；使用MLVA方法时，224株结核分枝杆菌呈现出160种基因型，132株具有独特的基因型，余下的92株菌呈现出28种基因型；当两种方法联合使用时，224株结核分枝杆菌呈现出179种基因型，159株结核分枝杆菌具有独特的基因型，余下的65株菌表现为20种基因型。湖南省和安徽省的菌株中北京家族菌株所占的比例差异有统计学意义（P〈0．001），安徽省北京家族菌株所占的比例明显高于湖南省。结论MLVA在结核分枝杆菌株水平的鉴定方面，其分辨能力高于Spoligotyping，但是Spoligotyping在鉴定北京家族菌株和M.bovis方面有一定的优势。将Spoligotyping方法作为一线分型技术，MLVA作为二线分型技术联合应用时，将提高结核病的流行病学调查和病原学监测效果。不同地区的菌株有不同的特点。; 董海燕刘志广赵秀芹阳波万康林; 关键词：结核分枝杆菌间隔区寡核苷酸分型基因分型

微孔板Alamar blue显色法检测结核分枝杆菌氧氟沙星耐药性的研究被引量：1: 2015年; 目的评价微孔板Alamar blue显色法检测结核分枝杆菌氧氟沙星耐药性的可行性。方法用微孔板Alamar blue显色法对78株结核分枝杆菌检测氧氟沙星的最小抑菌浓度,记录获得结果时间,利用ROC曲线确定氧氟沙星的最佳耐药阈值,并和传统的药物敏感性实验罗氏培养基比例法进行比较。结果微孔板Alamar blue显色法获得结果平均时间为8d,氧氟沙星的最佳耐药阈值为2μg/mL,以罗氏培养基比例法为金标准,氧氟沙星的灵敏度和特异度分别为88.6%和94.1%。结论微孔板Alamar blue显色法是一种简便、敏感、快速的药物敏感性检测方法,可用于结核分枝杆菌氧氟沙星耐药性的快速检测。; 郑玉红郭倩李超魏剑浩赵丽丽蒋毅赵秀芹万康林李桂莲; 关键词：结核分枝杆菌氧氟沙星耐药性

Spoligotyping结合多位点PCR用于牛分枝杆菌卡介苗的快速鉴定被引量：2: 2011年; 目的鉴别分枝杆菌临床分离菌株中的牛分枝杆菌卡介苗,为临床确诊提供依据。方法采用PNB/TCH鉴别培养基和分子生物学技术(间隔寡核苷酸分型Spoligotyping和多位点PCR)对从一例疑似牛分枝杆菌卡介苗感染的结核病患者分离的菌株(FJ07111)进行鉴定。结果临床分离分枝杆菌菌株FJ07111具有与牛分枝杆菌93006一致的生长特性,Spoli-gotyping和多位点PCR结果与注射用BCG完全一致。结论 Spoligotyping和多位点PCR方法可简便、快速、准确鉴定牛分枝杆菌卡介苗。; 张媛媛黄明翔赵秀芹张丽水刘志广万康林; 关键词：菌种鉴定

异烟肼诱导致单耐异烟肼结核分枝杆菌假定药物外排泵基因表达量变化的初步研究被引量：3: 2013年; 目的检测单耐异烟肼结核分枝杆菌经异烟肼诱导培养前后假定药物外排泵基因表达量的变化，探讨可能导致结核分枝杆菌对异烟肼耐药的外排泵基因及导致基因高表达的原因。方法选取35株单耐异烟肼结核分枝杆菌临床分离株、10株全敏结核分枝杆菌临床分离株和H37Rv（标准对照），对各菌株进行无异烟肼和亚抑菌异烟肼浓度（1／4MIC）的7H9液体培养基诱导培养，提取RNA后反转录并采用real—timePCR技术分别检测27个假定外排泵基因表达量的变化，用公式2^-△△CT计算每个假定基因相对表达量的差异倍数。结果耐药株中27个假定外排泵基因有13个基因高表达，高表达RV1258c基因的菌株数最多为6株，其次是高表达RV2265和RV0849的菌株各有5株。35株菌中14株菌（40．00％）有高表达的外排泵基因，6株（17．14％）菌株均只有1个假定外排泵基因高表达；8株（22．86％）菌株有两种及以上基因高表达，其中4、2、1、1株菌株分别有2、4、5、7个基因高表达；10株全敏菌株和H37Rv 27个假定外排泵基因均无高表达。结论Rv1258c、Rv2265和Rv0849等基因可能是导致结核分枝杆菌对异烟肼耐药的外排泵基因，异烟肼可能为结核分枝杆菌部分假定外排泵基因的诱导物而导致其激活并高表达。; 张敬蕊李桂莲赵秀芹万康林吕建新; 关键词：结核分枝杆菌异烟肼

福建省耐多药结核分枝杆菌耐药相关基因突变特征被引量：4: 2011年; 目的初步分析福建耐多药结核病(multi-resistant tuberculosis,MDR-TB)临床分离结核分枝杆菌利福平和异烟肼的耐药相关基因突变情况。方法自福建福州肺科医院收集耐多药结核分枝杆菌临床分离菌株,采用PCR测序技术测定利福平和异烟肼耐药相关基因,包括rpoB、katG、inhA和mabA-inhA,并与标准菌株基因序列比对,分析基因突变特点。结果共对67株MDR-TB菌株进行了分析,91.04%的菌株在rpoB81 bp RRDR区发生突变,其中,88.06%(59/67)的MDR-TB菌株在rpoB531、526和516位发生突变;79.10%的菌株在katG、inhA或mabA-inhA上发生突变,59.70%(40/67)的菌株在katG315或者mabA-inhA(-15)位发生突变,没有检测到同时在inhA结构基因和基因调节区发生突变的菌株。结论 PCR-DNA测序分析技术可以用于检测MDR-TB临床分离菌株对RFP和INH的药物敏感性。; 张媛媛黄明翔赵秀芹潘爱珍张丽水万康林; 关键词：耐多药结核病结核分枝杆菌耐药相关基因利福平异烟肼

4种药物外排泵抑制剂对异烟肼抗结核分枝杆菌最低抑菌浓度的影响研究被引量：5: 2013年; 目的研究4种药物外排泵抑制剂对异烟肼抗结核分枝杆菌的最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)的影响。方法纳入37株单耐异烟肼和10株全敏的结核菌临床分离株以及H37Rv,应用微孔板Alamar blue显色法检测以上菌株分别加入维拉帕米(verapamil,VP)、氯丙嗪(chlorpromazine,CPZ)、硫利哒嗪(thioridazine,TZ)和羰基氰氯苯腙(carbonyl cyanide m-chlorophenyl hydrazone,CCCP)4种外排泵抑制剂前后异烟肼抗结核菌的MIC的变化情况,并用配对χ2检验比较不同抑制剂对异烟肼MIC的影响程度。结果 37株单耐异烟肼结核菌中,分别有64.86%(24/37)、48.65%(18/37)、43.24%(16/37)和37.84%(14/37)的菌株被VP、CPZ、TZ和CCCP降低异烟肼MIC,且均以降低2倍为主,VP致异烟肼MIC降低2倍及以上的菌株数均高于TZ和CCCP,P值均<0.05。6/10的全敏结核菌以及H37Rv的异烟肼MIC被VP降低2倍及以上。结论 4种药物外排泵抑制剂对异烟肼抗结核菌存在不同程度的影响,VP降低异烟肼MIC的作用较强。; 李桂莲张敬蕊赵秀芹蒋毅万康林; 关键词：结核分枝杆菌异烟肼最小抑菌浓度外排泵抑制剂

自贡市非结核分枝杆菌临床分离株的菌种鉴定结果分析被引量：3: 2017年; 目的对自贡市35株疑似非结核分枝杆菌(NTM)临床分离株进行菌种鉴定。方法从自贡市各区(县)及市结核病防治获得的临床分枝杆菌分离株,通过罗氏培养基(L-J)、对硝基苯甲酸(PNB)和噻吩-2-羧酸肼(TCH)鉴别培养基初步鉴定为NTM,再经多位点PCR方法确定为NTM后,对rpo B、hsp64及its基因进行测序及分析鉴定。结果 35株疑似NTM临床分离株,通过初步鉴别,多位点PCR,rpo B、hsp64及its基因测序及分析鉴别出32株NTM,分别为脓肿分枝杆菌(M.abscessus)11株、胞内分枝杆菌(M.intracellulare)7株、堪萨斯分枝杆菌(M.kansasii)5株、鸟分枝杆菌(M.avium)3株、脓毒分枝杆菌(M.septicum)1株、马赛分枝杆菌(M.masseillense)1株、戈登分枝杆菌(M.gordonae)2株、副瘰疬分枝杆菌(M.parascrofulaceum)1株和Mycobacterium peregrinum 1株。结论抗酸染色阳性、PNB/TCH鉴定为NTM的临床分离株中包含不同种类的NTM,自贡市NTM肺病的病原种类较多,以快生长脓肿分枝杆菌为主,其次为慢生长不产色菌的胞内分枝杆菌和缓慢生长光产色菌的堪萨斯分枝杆菌。实验室应开展进一步菌种鉴定,以指导临床正确诊断和合理治疗。; 邓建平刘海灿王斌张红梅张正东宁柱赵秀芹李群万康林; 关键词：非结核分枝杆菌菌种鉴定基因测序

IS6110限制性片段多态性分析标准方法的建立及其在结核分枝杆菌分子分型中的应用被引量：5: 2008年; 目的建立IS6110限制性片段多态性分析（IS6110一RFLP）标准方法并评价该方法的分型能力。方法采用核酸提取、PCR、限制性内切酶分析、Southern杂交、琼脂糖凝胶电泳等技术，结合Gel—Proanalyzer3．1和BioNumerics（Version5．0）软件，对78株结核分枝杆菌插入序列IS6110-RFLP进行分析。结果确定标准化的IS6110-RFLP技术，包括核酸提取、PCR、限制性内切酶分析、Southern杂交、琼脂糖凝胶电泳等实验步骤及标化参数的相关数据分析软件的使用；采用该技术，将78株结核分枝杆菌分为75个不同的基因型，分别归属于11个基因簇，其中有52株归属于同一个基因簇，占菌株总数的66．7％（52／78）。结论建立标准化的IS6110-RFLP技术方案，该方法具有很强的基因分型和株水平鉴定能力，可用于结核病的病原学监测。; 刘敬华Kristin KremerChristine PourcelArnout Mulder刘志广赵秀芹万康林; 关键词：结核分枝杆菌

TaqMan-MGB荧光定量PCR快速检测结核分枝杆菌katG基因突变被引量：2: 2012年; 目的建立一种特异、灵敏、快速检测结核分枝杆菌katG基因突变的TaqMan-MGB荧光定量PCR方法。方法根据结核分枝杆菌katG基因315位点突变的特点,设计一对特异性TaqMan-MGB探针和引物,通过反应条件优化,建立荧光定量PCR方法;用克隆到PMD18-T载体上katG基因阳性标准品及不同菌株来评价该方法的特异性、敏感性和重复性。结果灵敏度高,检测目的基因的最低检测下限10copies/μL,比常规PCR灵敏高100倍;特异性高,检测16株非结核分枝杆菌标准株和7种常见呼吸道感染细菌的标准株均为阴性;与测序法相比,野生型和突变型探针的敏感性和特异性均为100%。重复性好,批内批间CT值变异系数均小于1%。结论 TaqMan-MGB荧光定量PCR的方法能特异、灵敏、快速检测结核杆菌菌株katG315位点突变。; 潘爱珍赵秀芹张媛媛王晓萌柳正卫万康林; 关键词：结核分枝杆菌 KATG基因

赵秀芹

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