陈丽萍
- 作品数：7 被引量：57H指数：4
- 供职机构：宁波大学海洋学院更多>>
- 发文基金：宁波市科技局资助项目浙江省科技攻关计划公益性行业科研专项更多>>
- 相关领域：环境科学与工程轻工技术与工程生物学更多>>
- 宁波沿海陆源排污口拟杆菌(Bacteroidetes)分布的特点被引量：9
- 2014年
- 采用高通量454焦磷酸测序方法对宁波沿海2个重点排污口、8个一般排污口的20个站位水样进行分析,得到2011年3月、5月、8月、10月份各排污口总体微生物以及拟杆菌纲的分布情况。通过对454测序结果分析,共成功鉴定24个门,主要包括变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和后壁菌门(Firmicutes)等。其中拟杆菌门的变化趋势与梭杆菌门(Fusobacteria)相似,均为随月份的增加而递增的趋势。在拟杆菌门下,共鉴定出3个纲3个目9个科27个属,4个采样月份大部分站点的优势属为黄杆菌纲(Flavobacteria),其次为拟杆菌纲(Bacteroidetes)、鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria),通过聚类分析发现,拟杆菌门分布规律主要与排污口类型和季节有一定的关系。通过454测序检测到了极难培养的寡营养细菌鞘脂杆菌,也说明了454测序较传统微生物生态学研究方法的优势,同时针对普雷沃菌属(Prevotella sp.)及黄杆菌属(Flavobacterium sp.)两种具有代表性的属的分布情况进行了分析。
- 王中华徐茂琴谢利张迪骏周君何伟娜陈丽萍童茜茜张春丹苏秀榕
- 关键词：黄杆菌
- 可口革囊星虫(Phascolosoma esculenta)酵母双杂交文库和铁结合蛋白真核表达载体的构建被引量：1
- 2013年
- 构建了可口革囊星虫(Phascolosoma esculenta)的酵母双杂文库,总克隆数为6.09×106CFU,重组率100%,平均插入片段长度>1kb。随机挑取200个克隆子测序,结果 1个空载,67个无法对应的基因类型,已知的132个基因中线粒体蛋白占29.54%,蚯蚓血红蛋白15.9%,核糖体蛋白10.6%,铁结合蛋白8.3%,肌动蛋白6.1%,其它基因29.56%。这些基因分别为:5-氨基乙酰丙酸合成酶、类博莱霉素水解酶、纤溶蛋白、谷氨酰胺合成酶、热休克蛋白、非特性类碱性磷酸酶、脂肪酶、金属蛋白、线粒体、硫氧还蛋白、蛋白磷酸酶、肌钙蛋白C、泛素。根据已获得的可口革囊星虫铁结合蛋白基因,以EcoRⅠ和KpnⅠ为双酶切位点设计引物,构建了可口革囊星虫铁结合蛋白真核表达载体pPink-HC-fer,经PCR及测序检验,序列完全正确,然后电转化至酵母细胞中诱导表达,经SDS-PAGE检验其融合蛋白分子量大小约为23kDa。
- 张云云周君李晔张春丹蔡江佳陈丽萍李太武苏秀榕
- 关键词：可口革囊星虫铁结合蛋白真核表达
- 基于蛋白组学和代谢组学技术解析腐败希瓦氏菌净化水产品加工废水的生物学机制被引量：4
- 2016年
- 目的:利用蛋白组学、代谢组学和实时荧光定量PCR技术研究腐败希瓦氏菌净化水产品加工废水的生物学机制,挖掘相关功能蛋白,为食品加工废水治理提供理论依据。方法:以淡水培养为对照,宁波象山石浦水产品加工园区排污口处废水培养为试验组,应用双向电泳(2-DE)技术筛选2种培养的腐败希瓦氏菌功能蛋白;利用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)技术验证基因表达情况;核磁共振(NMR)技术鉴定菌体胞内代谢产物。结果:双向电泳筛选出31个差异蛋白,表达差异1.5倍以上的蛋白22个,最大差异比率为12.1。采用MALDITOF-MS-MS技术进行蛋白定性,GO和KEGG分析,其差异蛋白涉及铁代谢、ABC转运系统、抗生素合成、硫代谢、谷胱甘肽合成等。选取11个基因进行q RT-PCR,7个基因与蛋白表达水平一致,4个基因呈现负相关。NMR检出10类59种胞内代谢产物,其中腐胺、乙酸盐等8种代谢物的表达差异较大。结论:与净化水产品加工废水相关的功能蛋白2个,即半胱氨酸合酶和异柠檬酸脱氢酶。这两种酶在降解无机硫、重金属解毒、清除自由基,抵御氧化性损伤等方面发挥关键的作用,有望将其应用于废水治理。
- 何伟娜王中华张迪骏陈丽萍周君苏秀榕
- 关键词：蛋白组学代谢组学实时荧光定量PCR水产加工废水
- 应用PEN3型电子鼻传感器快速检测食源性致病菌被引量：26
- 2014年
- 为研究化学传感器在食源性致病菌快速检测中的应用,利用基于金属氧化物传感元件阵列的PEN3型电子鼻传感器,根据其对不同食源性致病菌产生代谢产物的差异响应。对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、粪链球菌、单增李斯特菌这4种常见食源性致病菌在培养2、4、6、8、10 h以及稀释103、105、107倍后进行PEN3化学传感器响应实验,建立指纹图谱。通过聚类分析、主成分分析(principal component analysis,PCA)、线性判别式分析(linear di scriminant analysis,LDA)等方法,确定化学传感器对不同培养时间、不同浓度细菌是否产生有效响应。结果表明,PCA和LDA这两种模式识别方法能够很好地将不同培养时间的细菌培养液区分开来,使组间变异和组内变异的比率达到最大,并在较低浓度条件下,4种食源性致病菌仍有较高的区分度,这表明化学传感器技术检测低浓度致病菌具有一定可行性。
- 陈丽萍徐茂琴何红萍李晔
- 关键词：食源性致病菌主成分分析
- 基于454测序技术研究宁波沿海陆源排污口希瓦氏菌属的时空分布被引量：2
- 2014年
- 基于454测序对宁波沿海10个陆源排污口在2011年的3月、5月、8月、10月四个月份的希瓦氏菌的分布进行了测定。结果表明:象山爵溪东塘排污口在3、8月份,象山西周工业园区综合排污口在5月份,距象山爵溪东塘排污口50 m以外的海域在5月份,象山墙头综合排污口、宁海颜公河入海排污口在8月份、象山石浦水产加工园区排污口在10月份均无希瓦氏菌属检出;而希瓦氏菌检出频数最高的是3月份的象山石浦水产加工园区工业排污口,出现频数为1 084次,其中已鉴定出的种有波罗的海希瓦氏菌Shewanella baltica(51)次,太平洋希瓦氏菌S.pacifica(46)次,希瓦氏菌ANA-3(1)次。从总体趋势来看,排污口处希瓦氏菌检出频数大于距排污口50 m以外的海域。
- 何伟娜王中华张迪骏童茜茜陈丽萍周君张春丹苏秀榕
- 宁波沿海陆源排污口假单胞菌属(Pseudomonas)分布特点被引量：13
- 2013年
- 采用高通量454焦磷酸测序方法对宁波沿海2个重点排污口、8个一般排污口的20个站位水样进行分析,得到2011年3月、5月、8月、10月份各排污口假单胞菌属的分布情况。结果表明,宁波沿海陆源排污口中存在较多的假单胞菌属。在检出的假单胞菌属中,维罗纳假单胞菌(Pseudomonas veronii)和莓实假单胞菌(Pseudomonas fragi)的含量相对较多,分别占56.72%、13.904%;排污口中假单胞菌属的数量存在季节性差异,3月份、5月份假单胞菌的数量相对较多,8月份和10月份较少,推测与季节性温度变化有关;假单胞菌属的含量与排污口的主要污染物有关,氨氮含量较高的排污口假单胞菌属的含量更高。
- 陈丽萍侯付景张迪骏何伟娜周君张春丹童茜茜王中华李太武苏秀榕
- 关键词：假单胞菌属聚类分析
- 可口革囊星虫(Phascolosoma esculenta)重组铁蛋白富集Pb^(2+)等重金属特性和功能研究被引量：5
- 2015年
- 利用可口革囊星虫重组铁蛋白富集Pb^(2+)、Fe^(3+)、Cd^(2+)、Cr^(3+)、Cu^(2+)、Mn^(2+)、Sn^(2+)和Zn^(2+)等8种重金属离子后,通过透射显微镜和傅里叶红外光谱测定蛋白的超微结构变化和内部基团特性。以天然的马脾铁蛋白为对照,观察重组铁蛋白与天然铁蛋白的差别。结果显示,重组铁蛋白富集Pb2+和其它7种重金属离子后蛋白体积大小与重金属离子种类直接相关。重组铁蛋白相对天然铁蛋白来说在富集不同种类重金属离子后,除了非特异性酰胺特征峰和蛋白特征峰外,还出现一些专门富集某些重金属离子的特异基团,如:-CH_3、-CH_2-、-CH-、-NH-、-SO_3-、-COOH、-S=S-和-C-S-C等。通过细胞实验进一步验证了铁结合蛋白能够通过富集重金属离子Pb2+来保护小鼠成骨前体细胞MRC3T3-E1,使细胞的死亡率明显降低(P<0.05)。
- 初双双张云云苏倡王颖陈丽萍周君张迪骏司开学苏秀榕
- 关键词：可口革囊星虫超微结构
