曾珍
- 作品数:4 被引量:11H指数:2
- 供职机构:上海海洋大学水产与生命学院水产种质资源发掘与利用省部共建教育部重点实验室更多>>
- 发文基金:上海市科技兴农推广项目上海市教育委员会重点学科基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 松江鲈不同种群间的分子标记和遗传多样性分析
- 一个物种遗传多样性的高低与其对环境适应能力、生存能力和进化潜能紧密相联。因此,了解已是濒危物种的松江鲈群体遗传多样性,对其保护与管理策略的制定具有重要意义。现有报道尚难以全面、客观地反映中国现有松江鲈的遗传多样性现状。本...
- 曾珍
- 关键词:松江鲈种质资源保护种群鉴别
- 文献传递
- 松江鲈鱼野生群体间遗传多样性的RAPD分析和SCAR标记的转化
- 松江鲈鱼隶属于鲉形目杜父鱼科、松江鲈鱼属,是一种降海溯河洄游性鱼类。本研究应用RAPD-SCAR分析方法,既从核基因组角度分析松江妒鱼的群体遗传多样性,又力求寻找地理群体间的分子标记,为松江鲈鱼种质资源的保护与利用、种群...
- 曾珍刘至治潘连德唐文乔王茜耿云皓
- 关键词:松江鲈鱼种质资源分子标记
- 文献传递
- 松江鲈鱼野生群体遗传多样性的RAPD分析和SCAR标记的转化被引量:9
- 2012年
- 首先, 从294条10个碱基随机引物中, 筛选出32条多态性引物, 对富春江、黄河、滦河和鸭绿江等4个松江鲈鱼 (Trachidermus fasciatus)野生群体共120尾个体进行RAPD分析。结果表明, 松江鲈鱼野生群体的遗传多样性较丰富,其主要表现在:① 在扩增得到的591个位点中, 有515个(87.14%)位点呈现多态性,群体间多态位点比率(P)的大小顺序为:富春江群体89.17%〉黄河群体87.99%〉鸭绿江群体86.63%〉滦河群体83.25%。② 松江鲈鱼群体间的Shannon信息指数(IT)和Nei’s遗传多样性指数(HT)分别在0.3393~0.3566和0.2157~0.2279间, 滦河群体的值较其他3群体稍低;若作为一个整体, 则总的 Shannon信息指数(IT)和Nei’s遗传多样性指数(HT)分别为0.3710±0.2153和0.2336±0.1643。③ 虽然群体间基因流值(Nm)在5.76103~19.84497间, 显示各地理群体间存在程度不同的基因交流, 但分子方差分析(AMOVA)结果却表明, 各群体间存在显著(P〈0.05)或极显著(P〈0.01)的遗传分化。④ 聚类分析表明, 鸭绿江群体首先与黄河群体聚为一支, 再与富春江群体相聚, 最后与单独一支的滦河群体聚类, 表明鸭绿江、黄河、富春江等3群体间的遗传距离与彼此间的地理距离远近密切相关, 而滦河群体与它们的遗传距离较远。其次, 从获得的S1225525 bp、S1225605 bp、S1225841 bp、S1345695 bp、S1345825 bp 等5个特异RAPD条带中, 成功地由S1225605 bp、S1225841 bp条带分别转化出SCAR01560 bp、SCAR02443 bp的SCAR标记。这两个标记的出现频率, 在鸭绿江群体最高(96.67%和93.33%)、富春江群体其次(83.33%和90%)、黄河群体再其次(56.67%和66.67%)、滦河群体最低(13.33%和20%)。因此, SCAR01560 bp、SCAR02443 bp可作为鉴别松江鲈鱼滦河群体与其他3群体的分子标记。
- 曾珍刘至治潘连德唐文乔王茜耿云皓
- 关键词:松江鲈鱼RAPDSCAR标记
- 松江鲈野生种群间两个新的RAPD-SCAR标记
- 2014年
- 为寻找松江鲈(Trachidermus fasciatus)鸭绿江种群(YL)、黄河种群(YR)和富春江种群(FR)间的分子标记,从120条10 bp随机引物中,筛选出多态性引物54条进行RAPD扩增。克隆获得了S2069680 bp、S2082331 bp、S2105782 bp与S2111400 bp等4个清晰的RAPD特异性标记,并成功将RAPD标记S2082331 bp与S2105782 bp转化成SCAR03260 bp和SCAR04710 bp的SCAR标记。经每群体30尾样本验证,发现SCAR03260 bp在YL、YR和FR种群中出现的频率依次为13.33%、93.33%、86.67%,可作为鉴别鸭绿江种群与其它两种群的分子标记;相反,SCAR04710 bp在YL、YR种群的出现频率较高(86.67%、83.33%),而在FR种群的出现频率却很低(16.67%),可作为鉴别富春江种群与其它两种群的分子标记。
- 李强刘至治曾珍潘连德汪婉桐
- 关键词:RAPD标记SCAR标记