陈珂
- 作品数：13 被引量：16H指数：2
- 供职机构：上海海洋大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市自然科学基金海洋赤潮灾害立体监测技术与应用国家海洋局重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术农业科学生物学哲学宗教更多>>
- 厚壳贻贝MyD88-4基因的生物学特性及其对沙氏弧菌的免疫应答被引量：6
- 2019年
- 为理解髓样分化因子88(myeloid differentiation factor 88,MyD88)基因的生物学特性以及对细菌胁迫的响应,本研究克隆了厚壳贻贝MyD88基因(命名为McMyD88-4)cDNA全长序列,其全长3 930 bp,开放阅读框2 607 bp,编码868个氨基酸。其中,13~109位的氨基酸序列为死亡结构域(death domain,DD),347~481位的氨基酸序列为TIR(toll/interleukin-1 receptor)结构域,TIR结构域包含3个高度保守的区域Box1、Box2和Box3;McMyD88-4蛋白的空间结构包含6个α螺旋(α-helix)和4个β折叠(β-sheet)。同源性分析显示,McMyD88-4蛋白序列与长牡蛎MyD88最相似,其一致性和相似性分别为60%和77%;其次,与虾夷扇贝、海湾扇贝和菲律宾蛤仔相似度较高,其一致性和相似性分别为40%~51%和58%~67%。系统进化树结果显示,McMyD88-4先与长牡蛎和扇贝聚为一支,然后与黑腹果蝇聚为一支,脊椎动物单独聚为一支。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测发现,McMyD88-4基因在厚壳贻贝各组织和器官中均有表达,其中在外套膜和鳃中的表达量最高,而血细胞中表达量最低。厚壳贻贝经沙氏弧菌感染后,McMyD88-4基因表达量在免疫相关组织中急剧上升,分别在感染后3和6 h达到峰值,且在消化腺中的上调水平显著高于鳃和外套膜。研究表明,McMyD88-4在厚壳贻贝抵御外界病原体侵染过程中,尤其是弧菌感染方面发挥重要作用。
- 梁箫刘钰珠陈珂李一峰李一峰
- 关键词：厚壳贻贝弧菌感染
- 一种深海芽孢杆菌及其在诱导厚壳贻贝稚贝附着中的应用
- 一种深海芽孢杆菌，保藏编号为：CCTCC M 2018065，分类命名：芽孢杆菌Bacillus sp.。该细菌形成的微生物被膜对厚壳贻贝稚贝的附着具有相对较高的诱导活性。还涉及一种深海芽孢杆菌在诱导厚壳贻贝稚贝附着中的...
- 杨金龙梁箫彭莉华陈珂魏玉利方家松
- 文献传递
- 利用空间抽样理论的遥感影像分类结果精度评价方法被引量：8
- 2016年
- 遥感影像分类结果的准确性对于遥感信息的应用分析有着重要的影响。传统抽样方式下的遥感影像分类结果精度评价方法受样本量及空间布局的影响,存在效率低和信息冗余等问题。利用空间数据的相关性,将空间抽样理论应用于遥感影像分类结果的精度评价,通过与传统抽样方法比较,发现空间抽样方法应用于遥感影像分类结果的精度评价不仅降低了数据冗余,同时提高了精度评价的检验效率和准确性。
- 黄冬梅陈珂王振华刘爽
- 关键词：遥感分类抽样理论
- α2肾上腺素受体和五羟色胺2A受体在厚壳贻贝变态中的作用
- 肾上腺素和五羟色胺作为重要的神经递质,广泛分布在生物体内,在神经元、感受器间的化学突触中发挥着重要的信使作用,参与各种复杂的生命活动,在调节内环境稳态等方面发挥着重要的作用。在以往的研究中发现肾上腺素和五羟色胺可以诱导多...
- 陈珂
- 关键词：厚壳贻贝蛋白质组肾上腺素受体
- 文献传递
- 考虑空间相关性的数据空间特征提取方法被引量：1
- 2014年
- 针对具有空间分布特性的时空数据,首先考虑数据的空间相关性对数据进行空间系统抽样,形成灾害数据空间分布样本;然后考虑样本数据的时间维度,运用粗糙集数据约简方法提取数据的空间特征。空间抽样方法能保证抽样精度、提高抽样效率;基于样本数据的约简技术能在保证数据主要传达信息不丢失的前提下对数据进行有效压缩、极大降低数据量,是解决海洋灾害数据监测花费巨大、数据分析繁杂的一种客观方法。最后,以某浅滩某次海洋灾害时空数据进行仿真,验证了数据简约方法的优良性。
- 肖启华陈珂黄冬梅
- 关键词：时空数据数据约简
- 基于空间抽样的遥感影像分类结果精度检验方法
- 本发明涉及一种基于空间抽样的遥感影像分类结果精度检验方法，包括针对所研究区域内遥感影像分类结果的精度检验，设计一种优化方法选择空间上的最佳样本点，该方法充分考虑遥感数据之间的空间相关性，采用Moran’s I量化遥感数据...
- 黄冬梅王振华刘爽陈珂徐首珏
- 文献传递
- 厚壳贻贝5-羟色胺2A受体(5-HT2AR)基因克隆和时空表达被引量：1
- 2018年
- 为探究5-羟色胺2A受体(5-HT 2A receptor, 5-HT2AR)基因在海水贝类生长发育中的作用,本研究通过RACE技术和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)克隆了厚壳贻贝5-HT2AR基因的cDNA全长,并分析该基因的时空表达。结果显示,5-HT2AR基因全长2 636 bp,开放阅读框(ORF)2 124 bp,共编码707个氨基酸。序列分析结果显示该序列与人、小鼠、斑马鱼、长牡蛎和虾夷扇贝等物种分别具有45%、45%、48%、49%和67%的同源性。厚壳贻贝雌雄成体各组织和器官中均有5-HT2AR基因表达,雄性中的鳃表达量最高,而在雌性鳃、外套膜和性腺中的表达稍高于其他组织和器官;推测该基因可能与厚壳贻贝的摄食、对外界环境的感知及促进卵母细胞成熟有关。5-HT2AR基因在厚壳贻贝各发育阶段均有表达,且稚贝的表达量为眼点幼虫的1.4倍,推测5-HT2AR基因可能参与了调控厚壳贻贝幼虫的生长发育过程。本研究为进一步了解5-HT基因家族在双壳贝类中的功能奠定了基础。
- 梁箫陈珂陈艳文刘钰珠李一峰李一峰
- 关键词：厚壳贻贝基因克隆
- 一种厚壳贻贝眼点幼虫的电穿孔转染方法
- 本发明属于水产生物基因工程领域，公开了一种厚壳贻贝眼点幼虫的电穿孔转染方法，根据克隆得到厚壳贻贝甲状腺素受体基因全长序列设计siRNA，采用不同参数设置分析不同脉冲模式对甲状腺素受体基因的敲减情况；收集电穿孔转染后96h...
- 李一峰梁箫程之扬陈珂竹攸汀杨金龙
- 文献传递
- 一种厚壳贻贝眼点幼虫的电穿孔转染方法
- 本发明属于水产生物基因工程领域，公开了一种厚壳贻贝眼点幼虫的电穿孔转染方法，根据克隆得到厚壳贻贝甲状腺素受体基因全长序列设计siRNA，采用不同参数设置分析不同脉冲模式对甲状腺素受体基因的敲减情况；收集电穿孔转染后96h...
- 李一峰梁箫程之扬陈珂竹攸汀杨金龙
- 文献传递
- 融合scSE和Mask R-CNN网络的海洋锋检测方法
- 本发明涉及一种融合scSE和Mask R‑CNN网络的海洋锋检测方法，包括：对收集的海洋锋SST影像数据进行数据增强和扩充处理，建立样本数据集；将标注的样本数据集分为训练数据集与测试数据集；选用浅层的Resnet‑50网...
- 徐慧芳黄冬梅贺琪杜艳玲陈括覃学标陈珂
