- 一组鉴别诊断甲状腺滤泡性肿瘤良恶性的标志物及其应用
- 本发明公开了一组用于鉴别诊断和/或预测甲状腺滤泡性肿瘤良恶性的甲基化标志物；进一步本发明提供所述甲基化标志物在制备甲状腺滤泡性肿瘤良恶性的鉴别诊断工具中的应用。本发明利用128甲状腺滤泡性病变的石蜡组织标本，发现70个甲...
- 梁智勇张卉吴焕文任新瑜高洁陆俊良
- 文献传递
- 联合检测CK5/6、CK14和表皮生长因子受体对基底样三阴乳腺癌的诊断价值被引量：10
- 2017年
- 目的探讨联合检测CK5/6、CK14和表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)对基底样三阴乳腺癌的诊断价值。方法北京协和医院2000年1月至2011年12月经组织病理学证实的115例三阴乳腺癌患者,收集其临床及病理资料。应用免疫组织化学法检测所有石蜡标本中CK5/6,CK14和EGFR的表达,以此判定是否为基底样三阴乳腺癌。以三者联合检测结果作为金标准,计算CK5/6,CK14和EGFR单独检测、两两联合检测的敏感性和特异性。进一步分析基底样三阴乳腺癌和非基底样三阴乳腺癌在年龄、肿瘤大小、组织学类型等临床及病理特征方面的差异。结果115例三阴乳腺癌患者平均患病年龄为(50.7±13.6)岁。免疫组织化学结果显示,单独检测CK5/6,基底样三阴乳腺癌阳性率为29.6%(34/115),CK14为21.7%(18/83),EGFR为60.9%(70/115)。CK14,CK5/6和EGFR三者联合检测阳性率为67.8%(78/115)。将三者联合检测的阳性例数作为金标准,则EGFR与CK5/6联合检测敏感性及特异性分别可达98.7%及100%。基底样三阴乳腺癌与非基底样三阴乳腺癌在组织学类型、分级,淋巴结转移情况,死亡率方面差异有统计学意义(P均<0.05),基底样三阴乳腺癌总生存期显著缩短(HR=0.363,95%CI:0.139~0.947)。结论 CK14、CK5/6和EGFR联合检测能够标识出最多数量的基底样三阴乳腺癌。基底样三阴乳腺癌预后比非基底样三阴乳腺癌预后更差,病理识别很重要。
- 任新瑜袁礼沈松杰吴焕文陆俊良梁智勇
- 关键词：三阴乳腺癌CK5/6
- 362例胰腺导管腺癌NTRK、ALK及错配修复蛋白表达谱研究及文献回顾
- 2021年
- 目的探究胰腺导管腺癌(PDAC)NTRK、ALK及错配修复(mismatch repair,MMR)蛋白表达谱并回顾相关文献,深入探究PDAC的分子特点。方法回顾性收集北京协和医院2008-09—2014-07胰腺导管腺癌手术标本制作组织芯片(tissue microarray,TMA),并收集相应临床病理资料和预后数据;采用免疫组织化学染色检测NTRK、ALK及4种MMR蛋白(MLH1、PMS2、MSH2和MSH6的表达),并回顾TCGA数据库及既往相关文献报道。结果本研究中共纳入362例PDAC病例,中位年龄61岁,男性208例(57.5%),女性154例(42.5%),以Ⅰ-Ⅱ期病例为主(92.5%)。其中我们检测到1例NTRK阳性(0.3%)病例,总生存期(OS)为12个月,其组织学表现为经典型胰腺导管腺癌形态,未发现ALK阳性病例。TCGA数据库和既往文献报道在胰腺癌中NTRK及ALK阳性率均在1%以下。本研究病例均表达MMR蛋白,既往研究中MMR蛋白缺失病例比例在0~22%不等。结论通过免疫组织化学检测NTRK在胰腺导管腺癌中表达率低于1%,与既往研究结果类似,未发现ALK阳性病例及错配修复蛋白缺失(deficient MMR,d MMR)病例。本研究为首次基于较大样本量的中国PDAC队列中报道NTRK、ALK和MMR蛋白表达情况。
- 刘笑玎陆俊良庞钧译陈龙云梁小龙吴焕文梁智勇
- 关键词：分子病理靶向治疗
- 胃肠道间质瘤c-KIT,PDGFRA基因突变及CD117,DOG-1蛋白的表达情况被引量：12
- 2018年
- 目的:回顾性研究分析133例胃肠道间质瘤(gastrointestinal stromal tumor,GIST)患者中c-KIT及PDGFRA基因突变情况及其中94例的CD117,DOG-1蛋白表达情况。方法:用下一代测序(next generation sequencing,NGS)及免疫组织化学方法分别检测以甲醛固定石蜡包埋的标本中c-KIT,PDGFRA基因突变及CD117,DOG-1蛋白表达情况,探讨不同基因突变形式与病变原发部位的相关性,并分析基因突变与蛋白表达之间的相关性。结果:133例GIST患者中男74例,女59例,发病年龄以40岁以上为主。原发于胃的57例,小肠59例,腹腔8例,直肠5例,肠系膜2例,盆腔2例。97例(72.9%)检测到c-KIT突变,其中79例(59.4%)存在11号外显子突变,13例(9.8%)9号外显子突变,4例(3.0%)13号外显子突变,5例(3.8%)17号外显子突变,全为双突变。9号外显子插入突变主要见于小肠;11号外显子W557_K558缺失突变主要见于胃。11例(8.3%)检测到PDGFRA突变,其中8例(6.0%)为18号外显子突变,3例(2.3%)为12号外显子突变。PDGFRA突变病例均为胃原发。94例GIST患者中,89例(94.7%)CD117阳性,92例(97.9%)DOG-1阳性;双阳性表达88例(74例c-KIT突变,4例PDGFRA突变),CD117单独阳性1例(野生型),DOG-1单独阳性4例(1例c-KIT突变,3例PDGFRA突变),双阴性1例(c-KIT突变)。CD117与DOG-1蛋白表达之间呈显著相关,差异有统计学意义(P<0.01)。结论:GIST中c-KIT,PDGFRA基因突变率高。c-KIT及PDGFRA基因突变形式与GIST原发部位有关。绝大多数GIST病例CD117与DOG-1双表达,CD117与DOG-1双阴性及CD117单阳性GIST病例均十分罕见,DOG-1单阳性表达病例主要见于PDGFRA突变。对于单阳性及双阴性病例的确诊,依赖于基因检测。
- 陈净慈吴焕文陆俊良周炜洵梁智勇
- 关键词：胃肠道间质瘤C-KITPDGFRACD117
- 甲状腺癌RAS/BRAF/TERT基因突变与临床病理特征的关系被引量：10
- 2020年
- 目的研究甲状腺癌5种驱动基因RAS(KRAS,NRAS,HRAS)、BRAF和TERT突变与临床病理特征的关系,以期细化甲状腺癌主要驱动基因突变的人群特征,在临床实践中为患者提供更精准的分子分型检测指导。方法回顾性收集319例甲状腺癌患者的临床病理特征和5种基因突变状态资料,分析各基因突变状态与患者年龄、性别、病理类型的相关性。结果 319例患者的RAS(KRAS,NRAS,HRAS)、BRAF和TERT突变频率分别为5. 3%、45. 1%和12. 9%。其中37例患者检出双基因突变(11. 6%);BRAF和TERT共突变发生频率最高,为9. 4%;其次为NRAS/TERT共突变4例。RAS和BRAF的突变状态与患者病理类型显著相关(均P<0. 01);RAS突变在滤泡性癌中比例高;BRAF突变主要见于乳头状癌,滤泡性癌中少见;TERT突变在乳头及滤泡性癌中均可见,在滤泡性癌中比例增高,但无统计学意义。此外,RAS/BRAF/TERT基因突变患者的平均年龄分别为52. 5岁、44. 6岁和59. 5岁,均显著高于总体平均年龄(40岁)(P <0. 01);而<19岁的青少年患者(31例)仅1例检出BRAF基因突变;所有病例其他驱动基因均为阴性。结论甲状腺癌RAS(KRAS,NRAS,HRAS)、BRAF和TERT驱动基因突变与患者的病理分型及年龄相关。青少年甲状腺癌患者RAS(KRAS,NRAS,HRAS)、BRAF和TERT驱动基因突变发生频率极低,在临床实践中需有针对性的设计基因检测方案。
- 鲁涛高洁周良锐陆俊良林岩松吴焕文
- 关键词：甲状腺癌RASBRAFTERT
- 非V600E BRAF突变结直肠癌突变形式及临床病理特征
- 2022年
- 目的 探讨BRAF非V600E突变结直肠癌突变形式及临床病理特征。方法 对827例结直肠癌标本行NGS检测,筛选BRAF非V600E突变病例,分析突变形式,比较其与V600E突变病例的临床病理特征差异。结果 检出BRAF突变58例,其中20例为非V600E突变。热点突变15例,罕见点突变1例;串联重复区域单核苷酸缺失(移码)突变1例,双核苷酸插入(剪切区域)突变1例;BRAF基因融合2例。与V600E突变相比,非V600E突变病例原发于右半结肠比例显著偏低(49%vs 80%,P=0.021),中位发病年龄更大(60岁vs 68岁,P=0.021)。有2例非V600E病例表现为错配修复缺陷(dMMR),突变形式均为串联重复区域插入/缺失突变。结论 非V600E突变在BRAF突变结直肠癌中占相当比例,突变形式丰富多样,与V600E突变患者具有不同的临床病理特征。
- 韩文祺陆俊良王婧吴焕文梁智勇
- 关键词：BRAF结直肠癌临床病理特征
- 一组鉴别诊断甲状腺滤泡性肿瘤良恶性的标志物及其应用
- 本发明公开了一组用于鉴别诊断和/或预测甲状腺滤泡性肿瘤良恶性的甲基化标志物；进一步本发明提供所述甲基化标志物在制备甲状腺滤泡性肿瘤良恶性的鉴别诊断工具中的应用。本发明利用128甲状腺滤泡性病变的石蜡组织标本，发现70个甲...
- 梁智勇张卉吴焕文任新瑜高洁陆俊良
- 文献传递
- 靶向新一代测序技术在甲醛固定石蜡包埋结直肠癌组织RAS突变检测中的应用与验证：对比Sanger测序与ARMS实时PCR技术被引量：2
- 2016年
- 目的通过与Sanger测序与扩增阻滞突变系统（ARMS）技术对比，验证靶向新一代测序平台Ion TorrentPGM在甲醛固定石蜡包埋（FFPE）结直肠癌组织标本KRAS2号外显子及扩展RAS突变检测中的应用。研究地点中国北京。研究对象随机选取51例中国北京协和医院病理科存档的FFPE结直肠癌标本（36例男性，15例女性）。在检测前，这些标本的病理诊断及肿瘤组织含量均经资深病理医师确认。方法分别利用PGM平台、Sanger测序技术以及Therascreen KRAS突变检测试剂盒检测51例FFPE结直肠癌标本中RAS突变情况，评估3种方法之间的一致性，进而通过检测梯度稀释的FFPE细胞系（突变状态已知）来探讨PGM平台的检测敏感性。结果应用PGM平台，51例标本中13例（25．5％）检出了KRAS2号外显子突变。针对KRAS2号外显子突变检测，PGM平台与Sanger测序之间的一致性达100％（51／511[κ=1．000，95％可信区间（C／）：1～1]；PGM平台与Therascreen检测试剂盒之间的一致性为98．04％（50／51）（κ=0．947，95％CI：0．844～1），仅有1例不一致的病例，其KRAS2号外显子突变为c．37G〉T突变，该突变未被Therascreen检测试剂盒覆盖。梯度稀释实验结果显示，PGM平台能够检出突变频率低至1％的KRAS突变。重要的是，在51例标本中，PGM平台还检出了10例KRAS2号外显子以外区域的RAS突变。此外，PGM平台还能够同时检出RAS以外的其他结直肠癌相关基因的突变。结论靶向新一代测序平台兼具特异性与敏感性，适合应用于KRAS2号外显子突变的临床常规检测。此外，该平台节省样本与时间、性价比高，在FFPE结直肠癌标本的扩展RAS突变检测以及其他结直肠癌相关基因突变检测方面具有重要的临床应用前景。
- 高洁吴焕文汪莉张卉段焕利陆俊良梁智勇
- 关键词：突变检测
- 滤泡细胞来源的甲状腺癌的分子改变被引量：1
- 2014年
- 甲状腺癌是最常见的内分泌恶性肿瘤。按组织形态特点，主要分为甲状腺乳头状癌、甲状腺滤泡癌、甲状腺髓样癌、低分化以及未分化癌，其中除了甲状腺髓样癌起源于神经嵴衍化的滤泡旁C细胞外，其余四者都来源于甲状腺滤泡细胞。甲状腺乳头状癌在上述五种甲状腺癌中最为常见，约占甲状腺癌人群的87．3％，其后为甲状腺滤泡癌，约占8．4％，未分化癌和髓样癌则分别占所有甲状腺癌的0．9％和1．8％。近年来有关甲状腺癌的分子改变的研究很多，甲状腺癌中常见的信号通路中分子的改变包括RAF基因点突变，RET／PTC基因重排，RAS基因、PAX8／PPARγ基因重排， PI3KCA和CTNNB1的基因改变，以及NTRK、TP53、PTEN，还有IDH－1和TERT启动子的点突变等。我们针对以上分子改变在滤泡细胞来源的甲状腺癌中的作用机制作一概述。
- 陆俊良梁智勇
- 关键词：甲状腺滤泡癌甲状腺癌细胞来源甲状腺滤泡细胞基因点突变
- 伴或不伴印戒细胞成分的结直肠黏液腺癌的临床病理特征及基因突变谱分析被引量：6
- 2019年
- 目的探讨结直肠黏液腺癌的临床病理特征及基因突变。方法收集101例结直肠黏液腺癌的病理资料,采用二代测序法对石蜡包埋样本中31个热点基因进行分析,并比较结直肠黏液腺癌伴和不伴印戒细胞分化的临床病理特征和基因突变谱的差异。结果101例患者中,有15例(14.9%)有印戒细胞分化,86例(85.1%)无印戒细胞成分。两组男性均多于女性(黏液腺癌伴和不伴印戒细胞分化中男性分别为60.0%、58.1%),晚期疾病比例较高(Ⅲ、Ⅳ期疾病分别占57.1%、57.6%)。伴印戒细胞分化的肿瘤体积较小,年龄较小,好发于近端结肠,分期较高。伴与不伴印戒细胞分化的结直肠黏液腺癌,与患者年龄和肿瘤大小差异有统计学意义(P<0.05)。无印戒细胞分化的结肠癌KRAS突变频率明显高于有印戒细胞分化者(P=0.001)。结论黏液腺癌的伴戒细胞分化与不伴印戒细胞分化相比,具有不同的临床病理特征和分子基础。
- 周良锐陆俊良吴焕文吴焕文鲁涛鲁涛鲁涛高洁梁智勇
- 关键词：结直肠肿瘤黏液腺癌KRAS临床病理特征
