万方
- 作品数：13 被引量：22H指数：3
- 供职机构：扬州大学动物科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技支撑计划江苏省“六大人才高峰”高层次人才项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 不同鸡种对白痢沙门菌的定植与免疫反应差异分析
- 本研究对狼山鸡和罗斯鸡肠道内的白痢沙门菌含量及相关免疫指标进行检测,探讨白痢沙门菌在鸡肠道内定植及其对鸡免疫性能的影响.选取狼山鸡、罗斯鸡各40只,分为攻毒组(30只),空白组(10只),攻毒组口服灌注0.5ml白痢沙门...
- 王洪志马腾徐璐陈静翟飞李志腾郭晓敏万方常国斌陈国宏
- 关键词：狼山鸡免疫性能
- 文献传递
- 中国部分鸡种B-G基因SNP和Indel被引量：5
- 2016年
- 鸡的MHC基因家族中B-G基因与鸡抗病性有关,通过研究与抗病有关的B-G基因的多态性可以从根本上提高鸡抵抗疾病的能力,进而为抗病育种奠定基础。试验对25个鸡种基因组DNA进行目标捕获测序,以NCBI中Gallus gallus的B-G基因序列为参考,利用MEGA6软件进行不同鸡种基因序列比对,分析B-G基因外显子和内含子中的SNPs和Indels以及氨基酸的变化,最后制作进化树。结果表明,25个鸡种中外显子存在8个SNPs、19个Indels,内含子有67个SNPs、327个Indels;同时氨基酸序列也呈现出相应的多态性,中国地方鸡种也表现出丰富的遗传多样性。来航鸡、仙居鸡、隐性白羽鸡的B-G基因存在丰富的多态性;来航鸡在进化树上单独为一类,藏鸡、文昌鸡由于地理位置因素也分别为单独一类;现代肉鸡中罗斯与隐性白羽鸡聚为一类;不同类型的中国地方鸡种间同源性较小。中国地方鸡种B-G基因存在多源性进化以及丰富的遗传多样性,进而产生抗病性差异。
- 吴允毕榆林张扬郭晓敏李志腾万方朱鹏飞徐璐常国斌徐琪陈国宏
- 关键词：SNPSINDELS进化树
- 不同鸡品种NFKB1基因SNPs筛选与进化分析被引量：2
- 2016年
- 以27个鸡品种为试验材料,通过目标捕获测序技术检测NFKB1基因SNPs位点多态性,分析鸡NFKB1基因的遗传效应;通过最大简约法进行系统进化树构建,探讨NFKB1基因的多态性与不同鸡品种的关系。结果表明:27个鸡品种的NFKB1基因上共存在233个突变位点,其中外显子存在6个突变位点,显示出丰富的基因多态性;外显子14上的SNPs位点特异性存在于隐性白羽鸡和AA鸡,并引起了相应的氨基酸变化,该位点可作为这一基因的特异性候选位点。同时,NFKB1基因在外来鸡品种与地方鸡品种、蛋用型与肉用型鸡品种间存在差异,为进一步研究不同鸡品种间的差异提供参考资料。
- 毕瑜林王洪志徐璐王莎莎李志腾郭晓敏万方刘向萍张亚妮张扬徐琪常国斌陈国宏
- 雪山鸡A-FABP基因编码区SNPs与肌内脂肪酸含量关联分析被引量：2
- 2014年
- 本研究利用MALDI-TOF-MS技术对67只雪山鸡A-FABP基因编码区候选单核苷酸多态性(SNPs)位点进行扫描,进一步验证SNPs是否存在,并且与脂肪性状进行关联分析。结果表明:A-FABP基因在外显子1中存在同义突变:即T/C突变,得到3种基因型,T、C等位基因频率分别为0.239和0.761,并处于遗传平衡状态;TT型个体的腿肌中C16∶0脂肪酸含量显著高于CT和CC型个体(P<0.05)。初步认为A-FABP基因应是肌肉脂肪酸性状的候选标记。
- 郭晓敏王伟马腾李志腾万方张康宁袁青妍许盛海常国斌陈国宏
- 关键词：A-FABP基因SNPS
- 不同鸡种TAP1基因SNPs和INDEL比对分析被引量：2
- 2020年
- 为探究抗原加工相关转运体1(TAP1)基因在不同鸡种中的遗传多样性及其进化机制,采用目标序列捕获测序技术对29个不同鸡种TAP1基因的序列进行比对分析。结果显示:在29个鸡种中共有270个单核苷酸多态性(SNPs),其中TAP1基因外显子中共有116个SNPs,主要发生在外显子9和外显子1上,分别占突变核苷酸总数的25%和24%;引起非同义突变的SNPs共有82个,突变最多的是A/G,氨基酸同源性高于核苷酸;所有29个鸡种中都存在SNPs,快大型青脚麻鸡和红色原鸡在外显子上具有最多的SNPs,发生碱基缺失的鸡种包括固始鸡、安卡鸡、斗鸡罗斯鸡杂交品种、绿壳蛋鸡、来航鸡,其中固始鸡缺失片段最长。TAP1基因在不同鸡种中存在高度变异性,说明这种多样性对于鸡抗病性具有重要作用,研究结果也为鸡的抗病育种提供了参考。
- 陈博雯仇玲玲万方王洪志张扬王志秀陈国宏常国斌
- 关键词：SNPSINDEL
- 鸡NLRC5基因启动子多态性分析被引量：2
- 2015年
- 为了研究NLRC5基因启动子区的SNP及其对启动子功能元件的影响,采用目标捕获测序和PCR产物直接测序的方法对27个鸡品种和2种细胞的NLRC5基因启动子区进行SNP检测,总共检测到37个SNP位点,其中斗鸡未发现SNP存在,SNP9存在于除斗鸡以外的其他鸡种和细胞。生物信息学软件预测得到NLRC5基因启动子区转录因子结合位点和CpG岛,SNP位点对转录因子结合位点和CpG岛大小均有影响,表明NLRC5启动子区SNP可能通过不同方式影响基因表达调控。
- 郭晓敏刘向萍常国斌徐璐马腾王洪志李志腾陈静万方徐琪陈国宏
- 关键词：启动子SNP
- 雪山鸡GARS-GART-AIRS基因候选SNPs及其与IMP含量的关联分析被引量：3
- 2015年
- 以雪山鸡为试验材料,通过MALDI-TOF-MS技术检测雪山鸡GARS-GART-AIRS基因候选SNPs位点多态性,分析GARS-GART-AIRS基因的遗传效应,并对其与肌苷酸含量进行关联分析。结果表明:GARS-GART-AIRS基因SNP1、SNP2与胸肌肌苷酸含量呈显著相关,SNP1中CC型个体胸肌肌苷酸含量显著高于AC型和AA型个体,AC型与AA型个体差异不显著;SNP2中TT型个体胸肌肌苷酸含量极显著高于CT型和CC型个体,CT型与CC型个体差异不显著。腿肌肌苷酸含量与胸肌肌苷酸含量变化趋势一致,初步认为这些SNPs应是肌肉肌苷酸含量的主效QTL。
- 徐璐马腾夏明秀翟飞陈静王洪志刘璐李志腾郭晓敏万方常国斌
- 关键词：肌苷酸
- 雪山鸡THRSPα基因5'-侧翼区SNPs与肌肉品质关联分析
- 通过MALDI-TOF-MS技术对雪山鸡THRSPα基因5'-侧翼区候选SNPs位点进行扫描,对SNPs的存在与否进行进一步验证,并且与肌肉品质进行关联分析.结果表明:雪山鸡THRSPα基因5'-侧翼区中存在G637A突...
- 万方郭晓敏马腾王洪志陈静徐璐李志腾张康宁袁青妍常国斌陈国宏
- 关键词：雪山鸡肌肉品质
- 文献传递
- 雪山鸡THRSPα基因5′-侧翼区SNPs与肌肉品质关联性被引量：3
- 2015年
- 通过MALDI-TOF-MS技术对雪山鸡甲状腺激素应答蛋白Spot 14(THRSP)α基因5′-侧翼区候选SNPs位点进行扫描,对SNPs的存在与否进行进一步验证,并对其与肌肉品质进行关联分析。结果表明:雪山鸡THRSPα基因5′-侧翼区中存在G637A突变,得到3种基因型,G、A等位基因频率分别为0.567和0.433,适合性检验处于遗传平衡状态;不同基因型个体间在pH值、肉色和嫩度等常规肉品质指标并无显著差异;但GA型个体胸肌肌内脂肪含量显著高于GG和AA型的个体(P<0.05)。GA个体腿肌的C16∶0含量、C18∶1n9c含量、C18∶2n6c含量均显著高于GG和AA型的个体(P<0.05),GG和AA型个体之间差异不显著。初步可以认为THRSPα基因应是肌肉脂肪性状含量的候选标记。
- 万方郭晓敏马腾王洪志陈静徐璐李志腾程立力张康宁袁青妍许盛海常国斌陈国宏
- 关键词：THRSPΑ基因SNPS
- 不同品种鸡TAPBP基因序列分析被引量：1
- 2016年
- TAPBP是抗原呈递相关转运体(TAP)相关蛋白,在先天性和适应性免疫反应中均发挥着重要作用,与多种疾病的抗性或易感性相关。对25个不同品种鸡TAPBP基因序列进行目标捕获测序,利用MEGA软件对不同品种鸡序列进行比对分析,筛选不同品种鸡TAPBP基因上的SNPs及Indel位点,并根据基因序列进行系统进化树的构建。结果表明:TAPBP基因存在较多的SNPs和Indels位点,有着丰富的遗传多样性。不同地方鸡品种相对外来鸡品种呈现出高度多态性,可能与抗病性存在密切联系。青脚麻鸡、太湖鸡、如皋草鸡等抗性较好的鸡品种在系统进化树中拥有较高的亲缘系数。此外,固始鸡、如皋草鸡、安卡鸡等品种在第8外显子上存在特异性的插入缺失,且引起氨基酸变化,可作为鸡抗性研究的候选分子标记。
- 朱鹏飞毕榆林张扬郭晓敏李志腾万方徐璐仇玲玲鲁伟任立辰吴允常国斌徐琪陈国宏
- 关键词：SNP位点
