郑建波
- 作品数:3 被引量:22H指数:2
- 供职机构:浙江大学生命科学学院更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 草鱼cadm2b基因的克隆及在成体组织中的表达分析
- 2017年
- 为研究CADMs(Cell adhesion molecules)在草鱼构建抵御病害感染的第一道防线中发挥的作用,用RTPCR和RACE方法结合测序分析,在草鱼脑组织中检测到了该基因家族成员cadm2b基因的4条不同的c DNA全长序列。序列比对结果表明这4条全长c DNA在5′端的序列完全相同,在3′端的3个局部区域有不同片段的缺失。因此,可以确定这4条不同的m RNA是cadm2b的不同剪接体。这4条不同的剪接体被分别命名为cadm2b、cadm2b X2、cadm2b X3和cadm2b X6。cadm2b的c DNA序列全长1669 bp,开放阅读框(ORF)1203 bp,编码400个氨基酸。cadm2b X2的c DNA序列全长2783 bp,开放阅读框长1323 bp,编码440个氨基酸;cadm2b X3的c DNA序列全长2755 bp,开放阅读框1296 bp,编码431个氨基酸;cadm2b X6基因的c DNA序列全长2649 bp,开放阅读框1161 bp,编码386个氨基酸。根据碱基序列所进行的氨基酸序列和蛋白结构预测显示这4个CADM2b蛋白亚型都具有CADM家族保守的4个功能区,但其C端的蛋白结合位点存在差异。CADM2b具有近膜4.1蛋白结合位点和Ⅱ型PDZ蛋白结合位点,CADM2b X2、X3缺失了PDZ蛋白结合位点,而CADM2b X6则同时缺失4.1蛋白和PDZ蛋白的结合位点。实时定量RT-PCR检测结果显示cadm2b剪接突变体是该基因m RNA的主要形式。半定量RT-PCR和套式PCR实验检测结果表明cadm2b基因在草鱼成体脑中高水平表达,在肝、肾、心脏和肌肉组织中有微量表达。这种表达模式提示草鱼中CADM2b主要是由非免疫细胞,而不是由免疫肥大细胞合成分泌的细胞黏附因子,可能通过介导免疫肥大细胞与病原靶细胞的黏附而起非特异性抵御病害感染的作用。
- 梁健嘉张琼宇李恒郑建波罗琛
- 关键词:草鱼基因克隆
- 生长发育正常的无肌间刺草鱼突变体被引量:11
- 2015年
- 通过人工诱导雌核发育纯合二倍体使突变基因的性状得以表现,筛选到无肌间刺草鱼突变体.无肌间刺草鱼突变体的脊椎、附肢和整个形体都正常,生长和运动也未见异常.这些结果证明:(ⅰ)肌间刺并不是草鱼身体支撑和运动所必需的;(ⅱ)肌间刺的发育有不同于脊椎骨和附肢骨的发育遗传调控机制;(ⅲ)用现代生物技术可以人工培育淡水主养鱼类的无肌间刺品种.统计分析结果表明,在雌核发育草鱼群体中无肌间刺草鱼突变体的比例极低,提示草鱼肌间刺的发育可能受多个基因控制,其调控机制及其复杂.无肌间刺草鱼突变体为寻找和确定特异性调控鱼类肌间刺发育的关键基因提供了难得的实验材料.
- 徐晓锋郑建波钱叶青罗琛
- 关键词:草鱼突变体雌核发育
- 翘嘴红鲌雌雄基因组差异及太湖野生群体遗传多样性现状的AFLP分析被引量:11
- 2017年
- 为发展翘嘴红鲌Erythroculter ilishaeformis(Bleeker)性别控制育种和单性养殖技术,利用AFLP技术对翘嘴红鲌太湖野生群体中雌、雄各20个个体的基因组进行了遗传多样性和雌雄差异分析。用筛选出的8对AFLP多态性引物在太湖野生群体基因组中共检测到319个位点,其中多态性位点185个。通过对所有多态性位点在个体中的分布进行分析,发现一个只在雄性个体中稳定存在、在雌性个体中缺失的差异位点。在人工雌核发育翘嘴红鲌群体只有雌性个体,其基因组中也检测不到该差异位点的存在。这些结果表明翘嘴红鲌性别分化可能受到严格的遗传调控,该差异位点是雄性特有的性别分子标记。翘嘴红鲌太湖野生群体目前的多态位点比率P=57.99%,观测等位基因数N_a=1.5799±0.4943,有效等位基因数N_e=1.3859±0.3971,Shannon’s信息指数I=0.3221±0.2987。这些统计分析结果与10年前对该群体的AFLP研究结果(P=51.21%,Na=1.512±0.500,Ne=1.252±0.371,I=0.218±0.275)相比没有显著差别(P>0.05),说明该群体目前还具有适度的遗传多样性。
- 刘祥芳郑建波贾永义顾志敏罗琛
- 关键词:翘嘴红鲌基因组分析雌雄差异