熊超
- 作品数：21 被引量：136H指数：7
- 供职机构：中国中医科学院中医药信息研究所更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 蜜紫菀饮片标准汤剂制备及质量评价方法研究被引量：7
- 2018年
- 目的:建立蜜紫菀饮片标准汤剂质量评价标准,为以蜜紫菀为原料的相关制剂质量标准制定提供参考。方法:收集14批蜜紫菀饮片,制备标准汤剂,测定蜜紫菀标准汤剂出膏率和pH值,并建立HPLC指纹图谱分析方法。结果:14批蜜紫菀标准汤剂出膏率范围为45.8%～61.4%;pH值范围为4.50～4.81;采用"中药色谱指纹图谱相似度评价系统(2012版)"进行指纹图谱分析,相似度均大于0.899,确定12个共有峰,指认其中3个并对其进行简易定量分析,探讨适合标准汤剂定量的指标成分。结论:蜜紫菀标准汤剂研究可为以蜜紫菀为原料的相关制剂质量控制提供参考,因标准汤剂中紫菀酮转移率极低,可选择槲皮素等作为其定量指标成分。
- 张开雪马伟熊超孙伟李西文邬兰
- 关键词：指纹图谱出膏率
- 基于转录组数据对七叶树中三萜皂苷合成途径的研究被引量：15
- 2019年
- 七叶树是七叶树科七叶树属高大乔木,集药用与观赏于一身。七叶树种子是其主要的药用部位,主要有效成分为齐墩果烷型三萜皂苷类化合物七叶皂苷。为了解七叶树三萜化合物生物合成的分子基础,该研究采用Illumina Hi Seq 2000高通量测序获得七叶树种子与花的转录组数据,并对其代谢途径相关基因进行挖掘;使用Trinity软件实现unigene的de novo拼接;并将转录组的测序结果运用KEGG数据库进行注释,从而预测七叶树三萜代谢的具体途径。结果显示七叶树转录组共有2个三萜代谢途径相关数据集,分别为萜类物质前体代谢途径(途径编号为ko00900)和倍半萜与三萜代谢途径(途径编号为ko00909),对应的基因分别有47,27条。进一步根据催化酶与活性产物的总结比较分析发现萜类物质前体代谢途径相关酶共有8种,三萜代谢途径相关酶有3种。该研究首次在七叶树中解析出5条与三萜环化酶对应的基因,它们可能参与β-香树精合成进而形成七叶皂苷。通过种子与花的转录组表达差异分析显示,ko00900和ko00909途径相关的差异基因有33个;相对于花器官,种子中有17个unigenes表达量上调,16个unigenes表达量下调。该研究运用qRT-PCR实验对SQE(Unigene25806),HMGS(Unigene36710),β-AS(Unigene33291) 3个差异显著的关键酶基因的表达进行了试验验证,实验结果qRT-PCR结果与转录组数据一致。该研究所发现的七叶树的三萜皂苷合成相关候选基因能对七叶树三萜代谢合成与调控方面提供理论依据。
- 魏一丁熊超熊超高翰尹青岗姚辉姚辉孙伟陈士林
- 关键词：七叶树转录组QRT-PCR
- 基于DNA条形码技术对23种未知黎药进行物种鉴定被引量：7
- 2019年
- 该研究利用DNA条形码技术对23种未知黎药进行物种鉴定。采用试剂盒法提取了23种药材的总DNA,并利用PCR技术扩增其ITS2,psbA-trnH序列并双向测序,利用Codon Code Aligner v7. 0. 1软件对测序峰图进行正反向序列拼接,去除引物区及低质量序列获得ITS2,psbA-trnH序列,并将其输入到中药材DNA条形码数据库和NCBI Gen Bank数据库中进行检索,尝试对这23种药材进行物种鉴定。并以鉴定结果的相似度≥97%即确定到物种水平;介于97%和90%即确定为属级水平;低于90%即确定到科级水平这一原则作为鉴定标准,有17种药材可以鉴定到物种水平,5种药材可以鉴定到属级水平,1种可以确定到科级水平。由此可见DNA条形码技术可以快速、准确的鉴别无背景信息的未知药材。
- 崔馨云孙伟熊超孟祥宵师玉华邬兰程丽丽李伟杰郑希龙
- 关键词：黎药DNA条形码ITS2PSBA-TRNH
- 基于ITS2序列鉴定谷物芽类药材及其混伪品被引量：5
- 2014年
- 目的:应用ITS2序列对2010版《中国药典》谷物芽类药材稻芽、谷芽、麦芽及其混伪品进行分子鉴定,以保证药材质量和临床疗效。方法:提取稻芽、谷芽和麦芽药材DNA,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增其ITS2序列并双向测序,应用Codon Code Aligner软件对测序峰图进行校对拼接,并去除低质量序列及引物区,得到ITS2序列。用MEGA6.0软件对所有10个物种74条序列计算种内和种间K2P(Kimura 2-Parameter)遗传距离,分析变异位点并构建邻接(NJ)树。结果:稻芽、谷芽和麦芽的基原植物稻、粟和大麦的种内最大K2P遗传距离均远小于其与混伪品之间的种间最小K2P遗传遗传距离;NJ树结果显示稻、粟和大麦各自聚为一支,均与混伪品明显区分开,各混伪品物种也单独聚为一支。结论:ITS2序列能准确鉴别稻芽、谷芽、麦芽药材及其混伪品,该研究为保障谷物芽类药材临床准确用药提供了新的技术手段。
- 熊超周红贺海波胡志刚刘合刚
- 关键词：混伪品
- DNA条形码技术在动物类药材熊胆粉及其混伪品鉴定中的应用被引量：16
- 2018年
- 应用DNA条形码技术对名贵中药材熊胆粉及混伪品进行DNA条形码鉴定研究，并建立其标准实验流程，以保障熊胆粉的安全有效利用。对收集到的12份熊胆粉样品进行DNA提取、PCR（聚合酶链式反应）扩增并双向测序、运用CodonCodeAlignerV7．0．1进行序列剪切去除引物区得到CO／序列，同时与GenBank中得到棕熊及混伪品COI序列，运用MEGA7．0对研究的5个物种50条序列比对分析，计算变异位点及种内和种问K2P（Kimura2-Parameter）遗传距离并构建邻接（NJ）树。黑熊、棕熊的种内最大K2P遗传距离远小于其混伪品间最小K2P遗传距离；NJ树结果显示黑熊、棕熊各聚为一支，均可以与混伪品明显区分开。DNA条形码技术为一种安全便捷可靠的物种鉴定技术，建立动物类药材COI序列标准话流程，在中药研究领域具有重要的作用。
- 许亚春熊超姜春丽段永波孙伟刘绍勇薛东升薛建平
- 关键词：熊胆粉COI序列DNA条形码技术分子鉴定
- 催化β-香树脂醇21位羟基化的CYP450酶蛋白及编码基因与应用
- 本发明公开了催化β‑香树脂醇21位羟基化的CYP450酶蛋白及编码基因与应用。该蛋白为如下a)或b)的蛋白质：a)由序列表中序列2所示的氨基酸序列组成的蛋白质；b)将序列表中序列2所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基...
- 万会花孙伟熊超孟祥霄曹雪王思凡陈伟强徐志超陈士林尹青岗
- 基于HRM的常见伞形科香辛料快速鉴定被引量：4
- 2018年
- 目的：4种香辛料小茴香、孜然、葛缕子、莳萝子与其混伪品蛇床子、防风子因外形特征相似,易混淆使用,带来安全隐患。针对鉴别困难的问题,建立高分辨率熔解曲线（HRM）分析法,以实现简便、快速鉴别的目的。方法：收集这4种香辛料及常见混伪品蛇床子、防风子共23份样本,作为参照样本,提取总DNA,基于内转录间隔区2（ITS2）序列通过聚合酶链式反应（PCR）进一步确定物种,并应用HRM技术建立检测方法和熔解曲线模型。香辛料市场收集这4种香辛料共17份样本,作为市场样本,通过HRM技术鉴定物种是否与标签相符。结果：小茴香、孜然、葛缕子、莳萝子、蛇床子、防风子的熔解曲线均表现出良好差异性,能明显区分开;17份市场样本中,编号N1和N3样品熔解曲线与标签显示的莳萝子熔解曲线具有明显差异,进一步测序结果显示二者均为毒芹子。结论：HRM技术能实现小茴香等伞形科香辛料及其混伪品间的可视化鉴别,可作为DNA条形码技术的有力补充,在中药资源鉴定中应用前景广阔。
- 张梦婷孙伟师玉华邬兰熊超王彩霞王彩霞
- 关键词：伞形科香辛料高分辨率熔解曲线DNA条形码
- 七叶树2,3-氧化鲨烯环化酶及其编码基因与应用
- 本发明公开了七叶树2,3‑氧化鲨烯环化酶及其编码基因与应用。该蛋白为如下a)或b)的蛋白质：a)由序列表中序列2所示的氨基酸序列组成的蛋白质；b)将序列表中序列2所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和...
- 陈伟强孙伟万会花熊超孟祥霄曹雪王思凡徐志超陈士林尹青岗
- 高分辨率熔解曲线技术在多基原药材升麻鉴定中的应用被引量：6
- 2016年
- 高分辨率熔解曲线(HRM)分析是一种实时定量PCR技术,在核苷酸差异检测中具有快速、灵敏和准确等突出的优点,近几年来在基因突变、基因分型和遗传多样性等研究中发展迅速,但目前该技术应用于中药材鉴定的相关报道较少。本研究选取多基原药材升麻作为研究对象,广泛收集其主产区药材基原及其常见混伪品共41个样品,基于植物DNA条形码ITS2序列,通过对HRM反应体系和反应条件的优化,建立检测升麻及其混伪品的核酸荧光定量Bar-HRM方法,实现对升麻药材及其混伪品的鉴定,从而确保用药安全。该方法的特异性和灵敏性研究结果显示,升麻3个基原的各单倍型均能很好地表现出差异性,升麻及其混伪品均表现出良好单系性,能明显区分开。本研究证明HRM技术对升麻药材及其混伪品的鉴定能力强,在方法通用性和数据可视化方面具有优势,应用前景广阔。
- 孙伟熊超李景剑刘合刚胡志刚刘迪任伟超陈士林
- 关键词：升麻高分辨率熔解曲线中药鉴定ITS2
- DNA条形码及高分辨率熔解曲线在种子类和谷物芽类药材鉴定中的应用
- 种子是大部分药用植物的主要繁殖器官，也是中药材一个重要的组成部分，在中医防治疾病的过程中发挥着重要作用。种子类药材因其体积小、肉眼难以分辨，市场上掺伪和来源不明等问题时有发生，严重影响临床用药安全和疗效发挥;谷物芽类药材...
- 熊超
- 关键词：药用植物药材鉴定DNA条形码熔解曲线
