刘彬
- 作品数：26 被引量：108H指数：6
- 供职机构：贵州大学动物科学学院更多>>
- 发文基金：贵州省农业科技攻关项目贵州省重大科技专项计划项目贵州省科学技术基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程医药卫生更多>>
- 贵州白山羊DQB1基因外显子3的多态性及生物信息学分析被引量：1
- 2015年
- 为筛选贵州白山羊DQB1基因外显子3序列的SNPs位点,并进一步研究MHC基因多态性与山羊免疫性状的相关性奠定基础,以贵州白山羊为研究对象,采用混合DNA池与直接测序相结合对DQB1基因外显子3多态性及生物信息学进行分析。结果表明:贵州白山羊DQB1基因外显子3中有17个SNPs位点,其中,G+115A(Arg→Gln)、C+156T(Leu→Phe)、G+206A(Met→Ile)、G+238A(Arg→His)和T+270A(Ser→Thr)位点为错义突变;C+20T位点具有最小的自由能,其RNA二级结构最为稳定;各基因型蛋白质二级结构均由β折叠和无规则卷曲构成且比例相近,易于抗原决定簇的形成;参考序列与错义突变5种基因型均存在5段抗原决定簇,且均具有较高的平均抗原倾向性。
- 宋海涛杜典策袁珍军刘彬罗卫星
- 关键词：生物信息学贵州白山羊
- 贵州地方山羊品种H-FABP基因第3外显子SNP研究被引量：5
- 2015年
- [目的]研究3种贵州地方山羊品种H-FABP基因第3外显子的多态性以及进行该基因多态性生物信息学分析,以期筛选出适合的突变位点,研究其与山羊生长性状关联性影响。[方法]以3种贵州地方山羊品种为试验材料构建DNA池,结合直接测序技术筛选H-FABP基因SNPs,并利用在线软件分析H-FABP基因RNA二级结构及其蛋白二、三级结构。[结果]仅在黔北麻羊和贵州白山羊H-FABP基因第3外显子处分别筛选到T120A和G152C两个SNPs,其中exon3-T120A为导致编码氨基酸发生的Phe→Ile改变的错义突变,而exon3-G152C为苏氨酸(Thr)的同义突变。[结论]exon3-T120A位点影响黔北麻羊H-FABP基因RNA二级结构,最小自由能由-189.40 kcal/mol变为-190.00 kcal/mol,其蛋白二级结构无规则卷曲由49变为48,延伸链由36变为37,exon3-G152C位点仅影响贵州白山羊RNA二级结构,最小自由能变为-185.40 kcal/mol。
- 钱成罗卫星孙岩岩黄兰刘彬蔡惠芬
- 关键词：SNPS生物信息学错义突变
- 贵州山羊品种DQA1基因第3外显子遗传变异分析被引量：4
- 2014年
- 目的:通过筛选3个贵州地方山羊种DQA1基因Exon3的SNPs位点并做相应的遗传变异分析,为今后山羊抗病育种及地方山羊品种的选育提供理论依据。方法:采用构建品种DNA池与直接测序的方法,对三个贵州地方山羊种群共514只个体的DQA1基因外显子3进行遗传变异分析。结果:在3个山羊品种中共筛选得到4个SNPs,G71A(同义突变)、T100C(Asn→Ser)、G202A(Pro→Leu)、A223G(Met→Thr)。生物信息学分析发现,G202A位点变异虽未引起mRNA二级结构的变化,但最小自由能降低,结构稳定性增强;DQA1基因Exon3的不同基因型的蛋白质二级结构中均不含有α螺旋。结论:三个贵州地方山羊种DQA1基因外显子3中含有较丰富的多态性,G202A位点变异在mRNA二级结构及蛋白质二级结构中与其他基因型具有较明显的差异。
- 刘彬蔡惠芬张依裕刘若余罗卫星
- 关键词：SNPS生物信息学
- 贵州白山羊的体尺与体重及其相关性被引量：16
- 2015年
- 为贵州白山羊的品种选择和育种提供理论依据,对选自贵州省沿河县新景乡贵州白山羊保种区(贵州白山羊中心产区)的415只贵州白山羊,其中,育成羊194只(公羊59只、母羊100只和羯羊35只),成年羊221只(公羊13只、母羊122只和羯羊86只),测定其体重(y)、体高(x1)、体斜长(x2)、胸围(x3)和管围(x4),进行相关性分析和通径分析,并建立最优回归方程。结果表明:胸围是影响贵州白山羊体重最主要的体尺指标,胸围对体重的直接作用较大,通径系数为0.593;体高、体斜长和管围对贵州白山羊体重的直接作用较小;体高对体重的间接作用最大,通径系数为0.656。贵州白山羊体尺-体重的最优回归方程为y=-55.358+0.127x1+0.429x2+0.651x3+0.644x4,R2=0.831。
- 康建兵蔡惠芬罗卫星王锋曾浩苏娜芬黄兰钱成刘彬孙岩岩
- 关键词：贵州白山羊体尺体重
- 高效液相色谱法同时测定甘蔗及土壤中莠灭净与敌草隆的残留被引量：14
- 2010年
- 建立了用高效液相色谱法同时测定甘蔗及土壤中莠灭净与敌草隆的残留分析方法。样品经甲醇提取,二氯甲烷萃取和中性氧化铝柱层析净化,HPLC法测定,方法最小检出量莠灭净为1.2×10-9 g,敌草隆为1.5×10-9 g。莠灭净在土壤和甘蔗中的最低检出质量分数分别为0.015、0.02 mg/kg,方法添加回收率分别为82.12%~90.97%、85.89%~92.26%,相对标准偏差分别为1.70%~5.73%、0.40%~5.78%;敌草隆在土壤和甘蔗中的最低检出质量分数分别为0.01、0.02 mg/kg,方法添加回收率分别为80.93%~82.19%、81.81%~87.81%,相对标准偏差分别为2.34%~8.60%、0.35%~6.20%。
- 刘彬蔡凯胡德禹黄荣茂卢平薛伟
- 关键词：莠灭净敌草隆农药残留高效液相色谱
- 19%噁霉灵·络氨铜水剂中噁霉灵在烟草上的残留消解动态被引量：2
- 2010年
- 采用衍生气相色谱法测定噁霉灵·络氨铜水剂中噁霉灵在烟草上残留消解动态和最终残留量。样品经丙酮-水(体积比9∶1)超声振荡提取,乙醚萃取,经O,O-二乙基硫代磷酰氯衍生化后,用带火焰光度检测器气相色谱仪进行测定。其结果表明:检出限为0.015mg/kg,定量限为0.049mg/kg,在0.05、0.5、1.0mg/kg添加水平下,添加回收率为83.60%～90.50%,变异系数为5.5%～7.9%。噁霉灵在烟草上半衰期为2.7～3.2d,施药剂量为高剂量1125ga.i./hm2条件下,施药4次,最后1次施药距采收间隔期为21d时,噁霉灵在烟草中的残留量低于0.050mg/kg。
- 金林红何寿明胡德禹张钰萍黄荣茂蔡凯刘彬
- 关键词：噁霉灵烟草消解动态
- miR-7和miR-30-5p抑制CTSK表达对贵州黑山羊繁殖基因的影响
- 2024年
- 为验证miR-7和miR-30-5p对贵州黑山羊CTSK基因的调控效率及其对产羔基因的影响,通过生物软件筛选出调控CTSK效率最高的2条miRNAs:miR-7和miR-30-5p;将2条miRNAs转染至卵巢颗粒细胞,并于转染后24 h和48 h分别提取细胞总RNA,采用qRT-PCR法分别检测2条miRNAs在转染24 h和48 h的表达效率;同时检测miR-7和miR-30-5p过表达对CTSK基因及产羔相关基因FSHβ、GDF9、BMP15和BMPR-1B表达水平的影响。实验结果表明:转染miR-7和miR-30-5p至卵巢颗粒细胞24 h后,2条miRNAs的表达水平均极显著高于对照组(NC组);转染48 h后,miR-30-5p表达水平极显著低于NC组,而miR-7与NC组相比无显著性差异。此外,过表达2条miRNAs对CTSK基因和繁殖相关基因的影响发现,与NC组相比,转染miR-7 24 h后能极显著抑制CTSK的表达,且上调产羔基因FSHβ、GDF9、BMP15的表达;而转染miR-30-5p对CTSK的表达无明显抑制作用,但极显著上调了产羔基因FSHβ、GDF9、BMP15和BMPR-1B的表达。综上可见,与miR-30-5p相比,miR-7更有可能通过抑制CTSK表达来促进产羔相关基因的表达,进而影响贵州黑山羊繁殖性能。本研究结果为后续研究miR-7和miR-30-5p影响贵州黑山羊繁殖性状的分子机制奠定了基础。
- 杨永鲜陆情梅冉铭刘彬刘彬温晓艳赵佳福
- 关键词：贵州黑山羊MIRNA卵巢颗粒细胞
- H-FABP基因在临床医学和畜牧生产上应用研究进展被引量：2
- 2015年
- 心脏型脂肪酸结合蛋白是一种可溶性的小分子细胞内非酶蛋白质,对生物多项功能有着十分重要的调控作用,因此成为了临床医学和畜牧生产两大领域的研究热点。本文综述了近年来H-FABP基因作为实用型特异性心肌损伤标志物在治疗多种心血管疾病中发挥其重要作用的研究实例,同时介绍了其在畜牧生产方面的相关研究,并探讨了作为影响畜禽生长性能和提高其肉质性质的候选基因的实际意义。
- 钱成罗卫星黄兰孙岩岩刘彬蔡惠芬
- 关键词：H-FABP畜牧生产候选基因
- 山羊GHSR基因多态性及其与体重和体尺性状的相关性研究被引量：7
- 2013年
- 本研究旨在探讨GHSR基因SNP与山羊体重和体尺性状的关联性。试验以贵州白山羊和黔北麻羊为研究对象,采用DNA池结合PCR产物直接测序及PCR-SSCP技术检测GHSR基因的单核苷酸多态性。结果发现,在贵州白山羊和黔北麻羊GHSR基因外显子2和3′UTR区检测到2个SNPs位点G996A和T1424C,其中G996A位点为同义突变,表现为3种基因型,分别命名为GG、GA和AA,而在外显子1和5′UTR区未发现多态位点。基因型与体重体尺性状关联分析显示,黔北麻羊GG和GA基因型个体的体重显著高于AA基因型个体,胸深小于AA基因型个体(P<0.05),其余5个指标均差异不显著(P>0.05);在贵州白山羊中,GG基因型个体的体重、体斜长和管围均显著高于AA基因型个体(P<0.05)。研究结果提示:GHSR基因可能是影响山羊体重的主效基因或与主效基因连锁,G996A位点可望作为提高山羊个体体重的分子遗传标记。
- 宋桃伟罗卫星蔡惠芬刘彬孙岩岩
- 关键词：山羊单核苷酸多态性体尺性状
- 调控CTSK基因的候选miRNA在单羔、多羔贵州黑山羊卵巢和子宫体的表达分析
- 2023年
- 以贵州黑山羊为研究对象,通过生物在线软件预测调控CTSK基因表达的候选miRNAs,采用荧光定量PCR法检测CTSK及其候选miRNAs在贵州黑山羊单、多羔性腺轴下丘脑、垂体、卵巢、输卵管、子宫体及子宫角6种组织中的表达量。结果:CTSK在单、多羔贵州黑山羊的6个组织中均有表达,在单羔组中表达量依次为子宫角>输卵管>卵巢>子宫体>垂体>下丘脑,其中在子宫角中的表达量显著高于其他组织(P<0.05),在多羔组中,其表达量依次为子宫体>输卵管>子宫角>卵巢>垂体>下丘脑,其中子宫体的表达量显著高于其他组织(P<0.05);组间比较可知,CTSK基因在多羔组子宫体中的表达量极显著高于单羔组(P<0.01),卵巢中的表达量极显著低于单羔组(P<0.01)。在线软件预测结果表明:miR-122、miR-205、miR-7、miR-30-5p和miR-124为调控CTSK表达评分最高的5条miRNAs。qPCR结果表明:5条miRNAs在子宫体和卵巢中均有表达,在子宫体中,单羔组和多羔组的表达量均依次为miR-122>miR-30-5p>miR-205>miR-7>miR-124,其中miR-122的表达量显著高于其他miRNAs(P<0.05);组间比较显示,单羔组中miR-122、miR-30-5p、miR-205和miR-124表达量极显著高于多羔组(P<0.01),而miR-7表达量显著高于多羔组(P<0.05)。在卵巢组织中,5条miRNAs在单羔组中的表达量依次为miR-30-5p>miR-122>miR-205>miR-7>miR-124,其中miR-30-5p的表达量显著高于其他miRNAs(P<0.05),在多羔组中,其表达量依次为miR-122>miR-30-5p>miR-7>miR-205>miR-124,其中miR-122的表达量显著高于其他miRNAs(P<0.05),而miR-124表达量最低;组间比较可知,miR-7在多羔组中极显著高于单羔组(P<0.01),而miR-30-5p在多羔组中极显著低于单羔组(P<0.01)。本研究解析了CTSK基因在贵州黑山羊性腺轴上的表达情况,筛选到5条调控CTSK表达的候选miRNAs,弄清了5条miRNAs在贵州黑山羊子宫体和卵巢组织上的表达谱,为进一步阐明miRNA调控CTSK基因影响山羊繁殖率的分子�
- 陆情梅杨永鲜冉铭刘彬刘彬温晓艳赵佳福
- 关键词：贵州黑山羊MICRORNA特异性表达
