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刘晨晨
作品数:
8
被引量:4
H指数:1
供职机构:
中国农业科学院麻类研究所
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发文基金:
湖南省自然科学基金
国家自然科学基金
国家科技支撑计划
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相关领域:
农业科学
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合作作者
王晓飞
中国农业科学院麻类研究所
陈建华
中国农业科学院麻类研究所
栾明宝
中国农业科学院麻类研究所
许英
中国农业科学院麻类研究所
孙志民
中国农业科学院麻类研究所
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作者
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孙志民
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栾明宝
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陈建华
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王晓飞
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刘晨晨
传媒
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中国麻业科学
年份
2篇
2016
4篇
2015
2篇
2014
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8
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苎麻Genomic-SSR与EST-SSR分子标记遗传差异性分析
被引量:4
2015年
为了明确苎麻不同SSR的遗传差异性,利用Genomic-SSR与EST-SSR两种SSR标记对19个苎麻核心种质的遗传多样性进行分析。根据统计结果,Genomic-SSR平均检测到的观测等位基因数为3.4643、有效等位基因数为2.1982、Shannon多样性指数为0.8864、观测杂合度为0.5254、期望杂合度为0.5172;EST-SSR平均检测到的观测等位基因数为2.3333、有效等位基因数为1.9438、Shannon多样性指数为0.7120、观测杂合度为0.5128、期望杂合度为0.4778。Genomic-SSR和EST-SSR两种引物的有效等位基因数(Ne)和观测杂合度(Ho)差异不显著,Genomic-SSR的Shannon指数显著高于EST-SSR。研究结果表明,在标记多态性及基因型鉴别等方面,Genomic-SSR与EST-SSR均具有显著的遗传差异性,但是两种标记都能有效的鉴别不同基因型个体。Genomic-SSR可优先用于分子身份证、高密度遗传连锁图谱的构建和遗传多样性分析;EST-SSR用来研究苎麻近缘种间的遗传多样性、进化分析、连锁图谱和比较基因组学更有优越性。
刘晨晨
栾明宝
陈建华
王晓飞
许英
孙志民
关键词:
苎麻
分子标记
GENOMIC-SSR
EST-SSR
与苎麻纤维强度紧密连锁的分子标记、获得方法及用途
本发明公开了与苎麻纤维强度紧密连锁的分子标记。还公开了与苎麻纤维强度紧密连锁的分子标记的获得方法,包括:步骤一、获得苎麻种质SSR标记基因型;步骤二、分析SSR标记基因型计算出K矩阵图;步骤三、利用SSR标记基因型生成Q...
王晓飞
陈建华
栾明宝
刘晨晨
许英
孙志民
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与苎麻纤维细度紧密连锁的分子标记、获得方法及用途
本发明公开了与苎麻纤维细度紧密连锁的分子标记。还公开了与苎麻纤维细度紧密连锁的分子标记的获得方法,包括:一、获得苎麻种质SSR标记基因型;二、分析SSR标记基因型算出K矩阵图;三、利用SSR标记基因型生成Q值矩阵;四、以...
栾明宝
陈建华
刘晨晨
王晓飞
许英
孙志民
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苎麻中控制纤维细度的主效数量性状位点、方法及用途
本发明公开了苎麻中控制纤维细度的主效数量性状位点SSR标记RAM0298。还公开了获得苎麻中控制纤维细度的主效数量性状位点的方法,包括:一、获得苎麻SSR标记基因型;二、分析SSR标记基因型,计算K矩阵图;三、利用SSR...
陈建华
栾明宝
刘晨晨
王晓飞
许英
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一种大批量开发苎麻基因组SNP标记的方法及其开发的引物
本发明公开了一种大批量开发苎麻基因组SNP的方法及其开发的引物;具体包括如下步骤:(1)提取2个苎麻品种的DNA;(2)利用RsaI酶对2个苎麻品种基因组进行酶切,获得214‑314bp的小片段;(3)对酶切获取的小片段...
陈建华
栾明宝
王晓飞
许英
孙志民
刘晨晨
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一种大批量开发苎麻基因组SSR标记的方法及其开发的引物
本发明提供了一种大批量开发苎麻基因组SSR的方法及其开发的引物;具体包括如下步骤:(1)提取苎麻的DNA;(2)利用RsaI酶对苎麻基因组进行酶切,获得214-314bp的小片段;(3)对酶切获取的小片段进行测序,获得S...
栾明宝
刘晨晨
陈建华
王晓飞
许英
孙志民
文献传递
一种大批量开发苎麻基因组SNP标记的方法及其开发的引物
本发明公开了一种大批量开发苎麻基因组SNP的方法及其开发的引物;具体包括如下步骤:(1)提取2个苎麻品种的DNA;(2)利用RsaI酶对2个苎麻品种基因组进行酶切,获得214-314bp的小片段;(3)对酶切获取的小片段...
陈建华
栾明宝
王晓飞
许英
孙志民
刘晨晨
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一种大批量开发苎麻基因组SSR标记的方法及其开发的引物
本发明提供了一种大批量开发苎麻基因组SSR的方法及其开发的引物;具体包括如下步骤:(1)提取苎麻的DNA;(2)利用RsaI酶对苎麻基因组进行酶切,获得214‑314bp的小片段;(3)对酶切获取的小片段进行测序,获得S...
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