- 靶向流感病毒H7N9基因片段的人编码microRNA的生物信息学分析
- 2015年
- 目的 生物信息学预测靶向流感病毒H7N9基因片段的人编码microRNA （miRNA）.方法 基于流感病毒H7N9基因片段（HA、NA、PB2、PA和PB1-F2）的保守区,利用miRNA预测软件（FindTar3）,筛选出靶点落在保守区的miRNA,通过在线数据库（microRNA.org）分析其在肺组织细胞A549中的表达丰度,综合评估表达丰度及靶点自由能,预测调控流感病毒H7N9基因片段的最佳人编码miRNA.结果 靶点分析得到种子区域匹配基因落在H7N9各基因片段保守区域的miRNA,分别是HA 51条、NA 37条、PB2 29条、PA 19条和PB1-F2 26条;经miRNA在肺组织细胞A549中的表达丰度分析,得到相对高表达、自由能小的miRNA,即调控流感病毒H7N9基因片段的最佳人编码miRNA,分别是hsa-miR-16调控HA和PB2片段、hsa-miR-21调控NA片段、hsa-miR-9调控PA片段和hsa-miR-193b调控PB1-F2片段.结论 合理利用生物信息学在特定的组织细胞中预测靶向病毒基因片段的miRNA,可以为实验室的基础研究及临床治疗提供较可靠的靶miRNA.
- 张少波顾大勇谢伟东张雅鸥林裕龙
- 关键词：基因计算生物学
- microRNA作为传染性疾病标志物的研究进展
- 2015年
- 传染性疾病往往具有较大的传染性,易于大面积流行,且难以控制,严重危害人们生命健康,快速准确的筛查成为预防及控制其传播的重要手段之一。Micro RNA(mi RNA)是一类长度仅有约22nt的非编码单链微小RNA,广泛存在于动植物真核细胞中,主要通过与靶m RNA分子的3'端非编码区域(3'-untranslated region,3'UTR)完全或不完全互补配对,调控该m RNA分子的表达或转录后翻译;在细胞生长、发育、凋亡,肿瘤形成,病毒感染等多种生理病理过程中起重要作用。在病毒感染时,mi RNA调控病毒与宿主之间的相互作用,影响病毒感染的进程与结局;感兴趣的是,mi RNA其自身的表达对病毒感染具有一定的特异性。因此,mi RNA有望成为筛查病毒传染性疾病的临床标志物,目前已成为一热点研究领域。本文主要从循环体液中mi RNA的稳定性,mi RNA在病毒感染中的特异性表达,以及mi RNA检测技术方面做简要综述,并对mi RNA作为传染病一种新型检测标志物的可行性进行了初步的分析。
- 张少波谢伟东顾大勇林裕龙许乃寒张雅鸥
- 关键词：MICRORNA传染性疾病病毒标志物
- 常见肝炎病毒感染性疾病相关miRNA功能研究进展被引量：3
- 2016年
- 病毒感染引发的疾病一直威胁着人类健康。Mi RNA是真核生物表达的一类重要的小分子RNA,可特异性的调节基因与蛋白的表达。mi RNA的研究为病毒性疾病的发生发展提供了新思路,为目前热点研究领域。随着mi RNA的研究深入,一些病毒感染中相关mi RNA的功能也被相继报道,如有些mi RNA具有抑制病毒感染宿主细胞的功能,有些mi RNA则可促进病毒在宿主细胞中的复制,有些mi RNA却参与病毒相关疾病的发生,还有些mi RNA则可作为病毒感染性疾病的特异性生物标志物。本文主要以两种常见肝炎病毒:HBV、HCV为例来系统阐述mi RNA在病毒感染中的相关功能。
- 欧阳晓希顾大勇张少波田彩明蒋鑫谢伟东
- 关键词：病毒乙型肝炎病毒丙型肝炎病毒
- 病毒传染性疾病中miRNA的调控功能及诊断效能的研究
- 本研究分为以下三个章节: 第一章 H7N9编码HA蛋白诱导的病理反应及miRNA介导的稳态反应 目的：研究功能性蛋白HA对机体的病理作用，并进一步在细胞水平检测Let-7e的表达和分析Let-7e的调控功能。 方法...
- 张少波
- 关键词：微小核糖核酸
- 文献传递
