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唐昌伟
作品数:
2
被引量:2
H指数:1
供职机构:
宜宾市第二人民医院
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相关领域:
医药卫生
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合作作者
聂滨
宜宾市第二人民医院
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聂滨
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唐昌伟
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年份
2篇
2011
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2
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用生物信息学方法确定HIV-1M组基因分型的最佳区域
被引量:2
2011年
目的为确定HIV-1M组基因分型的最佳区域。方法从Genbank中筛选出对各成熟肽区域有注释来源,来自于不同国家地区的104条HIV-1M组全基因组序列。对序列的结构区域gag区,pol区及env区分别建NJ系统进化树。结果 pol区没能把D亚型和B亚型分开;gag区未把K亚型和F亚型分开;env区能对HIV-1M组正确分型。结论用生物学方法,env区最能代表全基因组序列的分型。
聂滨
唐昌伟
逯心敏
雷开健
鲁卫平
关键词:
HIV
基因型
生物信息学
NJ
用ENV区确定HIV-1M组基因分型最佳建树方法
被引量:1
2011年
目的:寻找HIV-1M组基因最佳构建进化树的分型方法。方法:从Genbank中筛选出对各成熟肽区域有注释来源,来自于不同国家地区的104条HIV-1M组全基因组序列。对序列的结构区域ENV区分别建ML、MP、NJ系统进化树。结果:ML、MP、NJ能对HIV-1M组正确分型。结论:ML、MP、NJ能对HIV-1M组正确分型,但因NJ操作简便快捷,推荐为HIV-1M组分型最佳方法。
聂滨
唐昌伟
逯心敏
雷开健
鲁卫平
关键词:
HIV
生物信息学
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