吴欣 作品数:9 被引量:18 H指数:3 供职机构: 上海海洋大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 轻工技术与工程 生物学 更多>>
瘤背石磺表皮生长因子基因的克隆、结构及进化分析 被引量:2 2017年 首次在瘤背石磺(Onchidium struma)中克隆得到一种新的表皮生长因子(EGF)的cDNA序列全长。EGF基因cDNA的全长为1158bp,命名为Os-egf1,其中开放阅读框长度为846 bp,编码一条包含281个氨基酸残基的多肽链。根据氨基酸序列比对和结构域分析结果发现其含有2个保守的EGF结构域和1个EGF-like结构域,每个结构域中均包含至少6个半胱氨酸残基,且形成CX7 CX4-5 CX10-13CXCX8 C结构,其结构域由C1~C3、C2~C4和C5~C6之间形成的3个二硫键维持,符合表皮生长因子家族及其相关蛋白的特征结构域,但其余氨基酸序列与现有相关基因差异较大,推测可能是一种新的EGF-like基因。利用MEGA6.0软件构建Os-egf1与EGF家族相关蛋白的系统进化树,表明EGF家族蛋白具有一定的物种特异性。 杨铁柱 沈和定 史艳梅 刘欣 吴欣 李杰关键词:EGF 基于Illumina HiseqTM 2000高通量转录组测序的里氏拟石磺SSR标记开发 被引量:2 2015年 为给石磺科贝类系统进化研究和资源保育工作提供更有效的分子标记,使用Illumina Hiseq TM2000高通量测序技术对里氏拟石磺进行转录组测序,以所得的拼接序列为基础,利用MISA和SSR Hunter1.3软件进行微卫星序列的查找,对选出的51个微卫星位点进行引物设计,经PCR扩增得到单一清晰扩增条带的位点24个,研究湛江里氏拟石磺群体扩增。结果表明,其中14个位点表现多态性。14个多态性位点得到的等位基因数为2~4,其中观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0.031 3~0.714 3和0.031 3~0.708 4,多态性信息含量(PIC)为0.089 5~0.640 5,14个位点中的2个位点表现为高度多态性(PIC〉0.5),10个位点表现为中度多态性(0.5〉PIC〉0.25),另外2个位点表现为低度多态性(PIC〈0.25)。经Sequential Bonferroni校正的Hardy-Weinberg平衡检验,9个位点不偏离平衡(P〉0.05)。开发的SSR标记可用于里氏拟石磺群体遗传学和石磺科贝类间的系统发生研究,并为里氏拟石磺的群体种质保护提供数据支持。 吴欣 沈和定 王冬凤 刘宸 杨铁柱 刁亚关键词:转录组 微卫星标记 响应面法优化胃蛋白酶酶解瘤背石磺肌肉蛋白工艺参数 被引量:4 2015年 为了优化胃蛋白酶酶解瘤背石磺肌肉工艺参数,以温度、p H、时间和液固比为试验因子,以水解度为响应值,在单因素试验的基础上,根据Box-Behnken中心组合设计试验原理,采用4因素3水平的响应面试验设计确定最佳工艺条件。结果表明,最佳酶解工艺参数为温度35℃,p H 1.5,时间2 h,液固比93 m L·g-1。经过验证,实际水解度为11.38%,与理论值的RSD为0.26%。 刁亚 沈和定 程知庆 姚理想 吴欣 杜文俊关键词:瘤背石磺 胃蛋白酶 响应面 紫色疣石磺微卫星标记及筛选方法 本发明公开了一种紫色疣石磺微卫星标记及筛选方法;包括:构建紫色疣石磺转录组测序文库,进行Illumina HiseqTM2000双末端测序;基于测序获得的序列,经MISA对微卫星位点进行分析、筛选;利用SSRHunter... 史艳梅 顾冰宁 许国绿 吴欣 沈和定文献传递 瘤背石磺肌肉粗蛋白的提取方法 本发明公开了一种瘤背石磺肌肉粗蛋白的提取方法,具体如下:将瘤背石磺解剖后取出内脏,洗净剩余肌肉并搅碎,用石油醚去脂,并用无水乙醇去除石油醚,过滤后烘干至干粉状,称取一定量的干粉,按照一定的固液比加入蒸馏水,调整pH和温度... 刁亚 沈和定 朱敏 史艳梅 刘阿娜 李杰 刘欣 李柏航 杨铁柱 李炼星 程知庆 姚理想 吴欣 杜文俊瘤背石磺肌肉粗蛋白的提取方法 本发明公开了一种瘤背石磺肌肉粗蛋白的提取方法,具体如下:将瘤背石磺解剖后取出内脏,洗净剩余肌肉并搅碎,用石油醚去脂,并用无水乙醇去除石油醚,过滤后烘干至干粉状,称取一定量的干粉,按照一定的固液比加入蒸馏水,调整pH和温度... 刁亚 沈和定 朱敏 史艳梅 刘阿娜 李杰 刘欣 李柏航 杨铁柱 李炼星 程知庆 姚理想 吴欣 杜文俊文献传递 基于转录组测序的石磺科贝类SSR和SNP两种分子标记的开发 石磺科贝类属于软体动物门,肺螺亚纲,缩眼目,石磺超科。在我国主要有5属6种,目前研究比较多的主要有4种:紫色疣石磺(Peronia verruculata)、里氏拟石磺(Paraoncidium reevesii)、瘤背... 吴欣关键词:石磺 转录组 微卫星 响应面法优化碱性蛋白酶提取瘤背石磺肌肉蛋白 被引量:3 2015年 以瘤背石磺肌肉为原料,蛋白提取率为指标,采用碱性蛋白酶提取瘤背石磺肌肉中的蛋白。在单因素实验的基础上,通过响应面法考察温度、p H、时间和液固比对蛋白提取率的影响,优化碱性蛋白酶酶解反应的工艺条件。结果表明,响应面法得到的最佳工艺条件合理可行,最佳工艺条件为温度56℃,p H12.6,时间3.2 h,液固比93 m L/g。在上述条件下,蛋白提取率的预测值为18.36%,实际值为18.30%,两者相对误差0.34%,表明此模型合理可行。 刁亚 沈和定 程知庆 姚理想 吴欣 杜文俊关键词:瘤背石磺 碱性蛋白酶 响应面 石磺科3种贝类皮肤显微结构比较 被引量:5 2015年 应用石蜡切片和H.E染色技术,对石磺科(Onchidiidae)3个属的代表物种:瘤背石磺(Onchidium struma)、平疣桑椹石磺(Platevindex mortoni)和里氏拟石磺(Paraoncidium reevesii)的皮肤进行了组织学观察及参数测量比较。结果表明,3种石磺的皮肤虽然厚度不一,但基本结构相似,均由角质膜、表皮和真皮构成。角质膜是一层覆盖于表皮角质层上的蛋白质薄膜;表皮由多层上皮细胞构成,包括角质层、颗粒层和生发层;真皮包括疏松层和致密层,疏松层中嵌有颗粒腺和黏液腺两种腺体。3种石磺的皮肤厚度、各组织相对厚度及腺体数量等均存在差异。将结构差异与石磺的栖息环境进行比较分析后得到:陆栖为主的瘤背石磺皮肤表皮角质化程度高,颗粒腺发达;以水栖为主的里氏拟石磺表皮角质化程度相对低,黏液腺发达;而水陆两栖的平疣桑椹石磺,皮肤角质化程度介于前述二者之间,颗粒腺与黏液腺均不发达。研究结果体现了三者不同的生态适应特征,也为深入探讨海洋无脊椎动物从海洋向陆地进化的研究提供形态学依据。 王冬凤 沈和定 吴欣关键词:皮肤 显微结构 环境适应 进化