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王寒冬: 作品数：21 被引量：73H指数：4; 供职机构：中国科学院西北高原生物研究所更多>>; 发文基金：中国科学院西部之光基金青海省自然科学基金国家自然科学基金更多>>; 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>

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大麦全基因组WRKY基因家族生物信息学分析被引量：3: 2019年; WRKY基因家族是一类含有WRKY保守结构域的转录因子,参与植物众多生理生化过程,在植物生长发育、代谢以及胁迫应答等过程中发挥重要作用。目前,已在多种植物中对WRKY转录因子进行了系统鉴定和分析,但是还未见有大麦WRKY基因家族系统筛选和鉴定的报道。本研究利用最新的大麦基因组数据,经生物信息学鉴定共得到98条大麦WRKY转录因子,其编码蛋白质序列长度为117~676 aa。有91条可以定位到大麦7条染色体上并呈不均匀分布,3H染色体上分布最多达25条,6H上最少仅有5条。通过系统进化分析,大麦98个WRKY转录因子根据其保守结构域可分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ组,各组分别有10个、52个和36个成员,其中Ⅱ组可进一步分成Ⅱ-a、Ⅱ-b、Ⅱ-c、Ⅱ-d和Ⅱ-e 5个亚组。保守基序分析表明,大麦的20个保守基序中,有6个为WRKY结构域的保守基序,各组内部成员拥有一致的保守基序。本研究可为进一步开展大麦WRKY基因的发掘与功能验证提供科学依据。; 毛成志王蕾孔豆豆王寒冬张怀刚沈裕虎徐金青; 关键词：转录因子进化分析

大麦HvENOD93基因家族的鉴定及表达特征被引量：1: 2022年; 早期结瘤素93(ENOD93)蛋白在植物根瘤形成初期扮演着重要的角色.基于大麦基因组信息鉴定大麦ENOD93基因家族成员,分析其理化特性、进化关系、基因结构、蛋白质结构和启动子顺式作用元件;并分析ENOD93家族在不同组织和不同基因型(籽粒大小)的表达情况.结果显示,大麦ENOD93基因家族有16个成员,均含有ENOD93基因家族特有的保守结构域;编码区长度在207-627 bp之间,外显子数量有1-4个,平均2.75个,且大部分位于细胞膜上;进化树结果表明与水稻、小麦和玉米等禾本科植物ENOD93基因的亲缘关系较近;启动子顺式元件主要有植物生长发育响应元件、胁迫响应元件以及激素响应元件;大部分HvENOD93基因在灌浆期籽粒和大粒材料中表达量较高.推测大麦HvENOD93基因在籽粒大小形成中起关键性作用;另外,结合其他物种相关基因研究结果,共筛选出3个同源基因.(图4表2参45); 边海燕张永兰王蕾徐金青王寒冬陈同睿尤恩李晓兰邓超沈裕虎; 关键词：大麦籽粒大小

不同栽培措施对青海东部山旱地饲用燕麦干草产量的影响被引量：4: 2022年; 为探讨青海东部山旱地饲用燕麦(Avena sativa L.)的高产栽培措施,以‘加燕2号’燕麦为研究材料,采用4个因素、3个水平的正交试验设计,探讨不同播期、行距、播量、施肥量对其干草产量的影响.结果表明:播期、行距、播量和施肥量对燕麦干草产量均有影响,播期影响最大,在3年试验及3年平均中均达到极显著水平(P<0.01),其次是施肥量和行距(P<0.05),播量对燕麦干草产量的影响相对较小(P>0.05).主成分分析结果表明,播期对燕麦干草产量贡献率最大,其次是播量和施肥量,行距贡献率最小.从各主成分综合得分及排名可以看出,早播处理组合优于晚播处理组合,最优处理组合为处理3(即早播、行距20 cm、播量240 kg/hm^(2)、施肥量150 kg/hm^(2) N_(2)O和300 kg/hm^(2) P_(2)O_(5)),综合得分2.533.处理3和处理1(即早播、行距10 cm、播量120 kg/hm^(2)、施肥量37.5 kg/hm^(2) N2O和75 kg/hm^(2) P_(2)O_(5))的燕麦干草产量始终排在前两位,其3个年度的平均干草产量分别为7942.21 kg/hm^(2)和7321.61 kg/hm^(2),且经多重测验干草产量差异不显著.综合考虑,青海东部山旱地种植饲用燕麦时,以适时早播(4月中上旬)、行距20 cm、播量240 kg/hm^(2)、施肥量150 kg/hm^(2) N_(2)O和300 kg/hm^(2) P_(2)O_(5)为最佳.(表9参26); 王寒冬张永兰王蕾徐金青陈同睿沈裕虎; 关键词：饲用燕麦播量干草产量

青稞驯化与育种过程中基因组选择事件的解析及其功能注释: 沈裕虎王蕾白生贵徐金青夏腾飞刘宝龙宋远方王寒冬张怀刚刘登才熊斌张发梅曹占英; 该项目利用1398个多态性DArT标记对681份青藏高原野生大麦、青稞地方品种和育成品种进行基因分型的基础上，在基因组层面上估测了青藏高原青稞遗传多样性、群体结构和基因组连锁不平衡性，认为在青藏高原野生大麦、青稞地方品种...; 关键词：; 关键词：青稞

利用SNP标记鉴定青稞种质资源: 2024年; 近年来,青稞(Hordeum vulgare var.nudum Hook.f.)育种速度逐步加快,青稞品种的类别和数量日渐增多,形成了丰富的青稞品种资源。然而,在青稞资源的大量引种和品种资源交换过程中,造成了同名异物、同物异名的现象,因而建立高效、准确的青稞品种鉴定技术体系和数据系统迫在眉睫。为基于青稞品种基本信息实现青稞品种的快速和准确鉴定,本研究利用简化基因组(GBS)测序获得的青稞基因组高通量SNP基因分型数据,对314份青稞种质资源进行群体结构分析;根据SNP注释结果,筛选获得位于外显子区的SNP并计算其杂合率和遗传多态性指数;用Genstat的去冗余(IRREDUNDANT)指令通过顺序算法(sequential algorithm)获得能够区分参试青稞种质资源的核心SNP位点组合,并构建DNA指纹图谱,结合参试材料地理来源等基本信息构建青稞品种的分子身份证。结果表明,群体遗传结构分析可将314份参试青稞材料划分为3个类群,类群划分与其材料类型密切相关。从4954个位于外显子区域的高质量SNP位点中筛选出14个多态性高且能完全区分青稞种质资源的SNP位点,称其为核心SNP;由14个核心SNP组成青稞种质资源DNA指纹图谱,同时结合种质资源地理来源等的基本信息进行数字编码,最终构建了每份青稞品种资源由17位数字组成的具有唯一标识的分子身份证,并生成相应的条形码和二维码。本研究构建的青稞种质资源DNA指纹图谱和分子身份证,可为青稞品种真实性和纯度鉴定、种质管理及知识产权保护等提供参考。; 陈同睿王蕾王寒冬尤恩邓超边海燕沈裕虎徐金青; 关键词：青稞种质资源指纹图谱分子身份证

与青稞株高主效QTL紧密连锁的KASP分子标记及其引物和应用: 本发明提供了一种与青稞株高主效QTL紧密连锁的KASP分子标记PH_K02，所述PH_K02的第225位，即青稞3号染色体全长序列的第464680174位存在A/G突变。表现为变异位点G与矮秆性状紧密连锁，A与高秆性状紧...; 王寒冬沈裕虎王蕾徐金青陈同睿邓超尤恩边海燕

脂肪酸延长酶缺陷对酵母细胞脂质代谢及油酸胁迫响应的影响被引量：3: 2018年; 生物医学证据表明,过量的油脂特别是脂肪酸(fatty acids,FA)在非脂肪组织累积会引起脂代谢障碍,引起细胞功能紊乱或坏死。脂肪酸延长酶家族参与脂肪酸代谢,具有真核生物的高度保守性,且与膜脂的代谢密切相关。但脂肪酸延长酶与细胞脂毒效应的关系并不清楚。该文利用模式生物酿酒酵母在脂类代谢研究中性状易于表征、遗传操作便利的优势,通过对比脂肪酸延长酶缺陷型elo1Δ、elo2Δ和elo3Δ与野生型酵母(wild-type,WT)对不同脂肪酸胁迫的响应,发现极长链脂肪酸延长酶基因ELO2和ELO3缺陷后对油酸(oleic acid,OLA)高度敏感;细胞脂滴及中性脂质的代谢对维持细胞脂类平衡起关键作用。研究结果显示,长链脂肪酸的合成缺陷或油酸处理均促进细胞脂滴的形成,同时显著提高细胞中性油脂(TAG)和甾醇酯(SE)合成;采用气相色谱–质谱联用技术分析脂肪酸组成,结果显示,ELO3缺陷,C_(26)脂肪酸基本检测不到,而C_(20)与C_(22)脂肪酸会累积;ELO2缺失后,C_(26)脂肪酸的含量也明显降低。而油酸的处理会增加BY4741胞内总的极长链脂肪酸的比例;elo2Δ和elo3Δ的不饱和脂肪酸与饱和脂肪酸的比例增大;相反,过表达脂肪酸延长酶基因,与野生型菌株相比能显著降低细胞油酸的含量。模式生物脂肪酸延长酶对细胞脂质代谢及油酸胁迫响应的研究,为医学脂代谢障碍及细胞脂毒效应研究提供了基础数据。; 程迅杜秀秀王寒冬黄志伟邓云霞沈裕虎; 关键词：脂代谢

大麦基因组GRAS基因家族的全基因组鉴定与表达分析被引量：7: 2021年; GRAS基因家族是一类仅存在于植物并广泛参与其生长发育调控的转录因子,根据其序列结构和系统发育树分化特征,GRAS转录因子包含PATI, DELLA, HAM, SCR, SHR等多个亚家族成员。本研究利用大麦最新的基因组数据库,采用生物信息学的方法筛选鉴定出41条GRAS基因序列,其中有34条序列具有完整的GRAS家族蛋白特有的GRAS结构域,可定位到大麦7条染色体上且呈不均匀分布。与拟南芥和水稻GRAS蛋白进行的系统发育分析,可将大麦GRAS家族蛋白进一步划分为10个亚家族。本研究对大麦GRAS基因的表达丰度分析,发现部分基因在发育阶段高表达,这可能暗示着这些基因在相应发育阶段起到重要作用。本研究结果可为后续挖掘和验证大麦GRAS基因提供参考。; 孔豆豆毛成志王蕾王蕾王寒冬张怀刚沈裕虎; 关键词：系统发育分析表达谱分析

267份青藏高原青稞种质材料的表型多样性分析被引量：25: 2018年; 为了解青藏高原地区青稞种质材料的表型变异和遗传多样性,为育种亲本选配提供参考,对267份青稞种质的10个质量性状和9个数量性状,采用模糊数学的方法进行数量遗传和群体遗传学分析。结果表明:10个质量性状的Shannon-weaver多样性指数变幅为0.03~1.41,平均值为0.54,粒色和穗密度多样性较为丰富;9个数量性状在品种间的遗传差异均达到极显著水平,变异系数为2.84%~42.22%,多样性指数变幅为1.84~2.09,平均值为2.03,表型多样性十分丰富。9个数量性状的相关性分析显示,大多数性状间存在显著或极显著正相关或负相关关系。经主成分分析将相关变量转化为穗粒数因子、粒质量因子、分蘖和穗长因子、株高因子和籽粒体积质量因子等5个特征根,代表全部9个考察性状的89.05%的表型变异;聚类分析可将供试材料划分为4个类群,第Ⅰ类群多为青稞育成品系,主要为矮秆、高分蘖和密穗型材料。第Ⅱ类群主要是青稞地方品种,主要为中高秆、多分蘖和小穗型材料,其产量较低。第Ⅲ类群主要为高秆、分蘖力适中,中穗大粒型材料,产量适中。第Ⅳ类群主要为中高秆、低分蘖、大穗多粒型品种,产量较高。研究认为青藏高原青稞种质资源具有丰富的遗传多样性,尤其是地方品种可作为宝贵的遗传资源在今后的育种工作中加以利用。; 夏腾飞王蕾徐金青王寒冬张怀刚刘登才沈裕虎昌西; 关键词：青稞表型性状主成分分析

一种检测青稞籽粒蛋白的试剂盒和方法: 本发明公开了一种检测青稞低籽粒蛋白质含量的试剂盒，它包括任选的用于检测HvNAM1基因上第+234bp和+1433bp位点处变异的试剂。本发明一种检测青稞低籽粒蛋白质含量的方法。本发明试剂盒可以准确预测青稞品种的籽粒蛋白...; 王蕾沈裕虎王寒冬毛成志孔豆豆; 文献传递

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