汪宇
- 作品数:3 被引量:7H指数:2
- 供职机构:西南林业大学更多>>
- 发文基金:国家林业公益性行业科研专项国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学医药卫生建筑科学更多>>
- 基于反向化学生态学筛选影响云南切梢小蠹行为的潜在活性挥发物
- 云南切梢小蠹Tomius yunnanensis为危害云南松的重要蛀干害虫,其防治主要以化学防治和营林措施为主,虽经多年高强度的防治,仍然危害严重并造成重大经济损失。为寻找新的途径对该害虫进行有效防治,本研究基于反向化学...
- 朱家颖汪宇杨斌
- 关键词:气味结合蛋白同源模建云南切梢小蠹
- 云南切梢小蠹气味结合蛋白的分子对接被引量:2
- 2015年
- 为研究云南切梢小蠹(Tomicus yunnanensis)气味结合蛋白(odorant binding proteins,OBPs)参与其嗅觉识别过程的机理,基于气味结合蛋白、绿叶挥发性物质的三维结构,采用分子对接方法对云南切梢小蠹OBP与3个绿叶挥发性物质可能的结合方式和结合能力进行模拟,结果表明,(E)-2-己烯醇较其他2个小分子而言更容易与云南切梢小蠹OBP结合,形成稳定的氢键。(E)-2-己烯醇与Tyun OBP2结合能最低,更容易与Tyun OBP2结合,Tyun OBP2与小分子物质的结合,可能通过占有该蛋白与寄主气味结合的空间或者通过改变Tyun OBP2三维结构,导致Tyun OBP2难以识别寄主松树散发的气味。
- 汪宇孙浩朱家颖赵宁杨斌
- 关键词:气味结合蛋白分子对接云南切梢小蠹挥发性物质
- 云南切梢小蠹气味结合蛋白的同源模建被引量:5
- 2015年
- 【目的】为了研究云南切梢小蠹Tomicus yunnanensis气味结合蛋白(Odorant binding proteins,OBPs)参与其嗅觉识别过程的机理奠定基础,本文对云南切梢小蠹OBP进行了同源模建及评价分析。【方法】采用同源模建方法构建了云南切梢小蠹OBP的三维结构,并利用Procheck、Verify_3D和ERRAT等方法评估了构建模型的可靠性。【结果】对优化后的模建蛋白的结果分析发现,序列中有6个保守的半胱氨酸位点,具有气味结合蛋白的典型特征,并且Procheck、Verify_3D和ERRAT对模型的评价分数较高,结构具有很高的可能性。【结论】基于已知的同源蛋白结构信息和模建蛋白的一级序列信息,预测序列已知但结构未知的蛋白空间结构,为今后研究该云南切梢小蠹气味结合蛋白的功能结构域奠定基础。
- 汪宇孙浩朱家颖赵宁杨斌
- 关键词:气味结合蛋白同源模建云南切梢小蠹