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运用计算机软件预测木质部寄生属信号肽: 2017年; 利用已经公布的木质部寄生属(Xylella fastidiosa)2 766个基因组数据信息,运用在线计算机预测软件,分析了木质部寄生属(Xylella fastidiosa)的分泌蛋白组。运用Signal P version 2.0预测得到204个开放阅读框架具有编码蛋白质的N-端信号肽;运用TMHMM、GPI-anchored预测具有非跨膜蛋白(或者在N-端信号肽只有1个跨膜区),不具有锚定位点的173个,运用Target P预测除去分泌到线粒体以及位置不确定的分泌蛋白,最终得到X.fastidiosa的分泌蛋白为149个。分泌类信号肽(Sec-type)114个和具双精氨酸结构的信号肽(RR-motif)32个,分别占分泌蛋白的76.5%和21.5%,脂蛋白信号肽3个,仅占2%,没有预测到类前菌毛信号肽和细菌素及外激素信号肽。; 张志超黄勇徐可成宋红杨俊誉张彧黄琼; 关键词：分泌蛋白信号肽

马铃薯青枯菌Po82菌株质粒基因组分泌蛋白信号肽的分析被引量：3: 2016年; 应用计算机技术和生物信息学的方法,采用Signal P4.0、Lipo P1.0、Target P1.0.1、TMHMM2.0蛋白质分析软件对植物病原细菌Ralstonia solanacearum Po82质粒基因组的1680个ORFs编码的分泌蛋白信号肽氨基酸序列进行预测分析。结果表明,质粒基因组的1680个ORFs中有102个ORFs所编码的蛋白质具有N-端信号肽序列,包括85个Ⅰ型信号肽,1个Ⅱ型信号肽,15个Prepilin-like信号肽和1个细菌素和信息素信号肽,所有的分泌蛋白中具有RR-motif信号肽结构的有14个,且均为Ⅰ型信号肽。在102个具有可切割信号肽的分泌蛋白中,有50.98%的蛋白质为胞外分泌型(S型),33.33%为线粒体分泌型(M型),6.87%为叶绿体分泌型(C型),8.82%为其他类型的分泌蛋白。信号肽切割位点的氨基酸组成中非极性氨基酸为53.27%,极性氨基酸为18.79%,带负电荷的酸性氨基酸为19.12%,带正电荷的碱性氨基酸为8.82%。比较R.solanacearum GMI1000和R.solanacearum Po82质粒基因组信号肽类型的区别,发现这2种菌在信号肽类型上存在很大差异。文章通过对R.solanacearum Po82质粒基因组信号肽分泌蛋白的研究,揭示了该病原菌与寄主互作的致病机制在长期进化中的独特地位。; 杨俊誉张志超韩永花李婕张彧黄琼; 关键词：生物信息学青枯病

一种甘薯新病害的初步研究: 2016年; 对山东鲁东南地区窖藏的甘薯种薯进行调查时发现,每个窖的甘薯发病率均在50%左右。其典型症状表现为甘薯表面有黑色凹陷的病斑,并随着窖藏时间的延长,其病斑面积不断扩大,严重时不能食用。对坏死的病斑组织进行病原物分离,纯化培养后,按照柯赫氏法则进行接种试验,将病原鉴定为链格孢菌(Alternaria sp.)。该文对其病害的症状、病原形态、发病情况等进行研究,确定为甘薯的一种新病害。; 宋红张志超杨俊誉徐可成黄琼; 关键词：甘薯链格孢属

中国发现甘薯长喙壳菌引起枣子果实腐烂（英文）被引量：1: 2015年; 2013年8月,在中国昆明发现一种枣子果实的腐烂病。通过致病性测试,证明从发病组织分离出的病菌能引起枣子果实腐烂。经过形态学和分子鉴定,确定该病原菌为甘薯长喙壳菌。这是在中国首次报道由甘薯长喙壳菌引起的枣子果实腐烂病。; 韩永花李晓杨俊誉李婕徐可成张彧黄琼; 关键词：果实腐烂甘薯长喙壳

水稻白叶枯病植株内生细菌的分离及其拮抗功能被引量：3: 2017年; 从云南省感染水稻白叶枯病的病株和健康植株上共分离得到475株植株内生细菌,从中筛选出167株对水稻白叶枯病病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,简称Xoo)有拮抗作用的内生细菌。病株体内拮抗内生细菌的菌株数量多于健康植株,病株和健康植株根、茎、叶中的内生细菌菌株数量略有不同,从病株根、茎、叶中分离出的拮抗内生细菌对水稻白叶枯病病菌的抑制作用差异不显著;而从健康植株的茎部和叶部分离出的拮抗菌对水稻白叶枯病病菌的抑制作用显著高于根部拮抗菌(P<0.05)。采用对峙培养方法测定并比较分离菌株的抑菌能力,得到30株对白叶枯病菌抑菌能力较强的菌株,并对其进行5种病菌的抑菌谱测定。结果显示,30株菌株对5种水稻病害的病原菌均有抑制作用。通过16S rDNA序列分析发现,水稻内生拮抗细菌分别与GenBank序列数据库中17个属的细菌相似性较高,其中,农杆菌属(Agrobacterium)、短状杆菌属(Brachybacterium)、克雷伯菌属(Klebsiella)、鞘氨醇杆菌属(Sphingobacterium)和葡萄球菌属(Staphylococcus)为发病植株特有的拮抗细菌属,而节杆菌属(Arthrobacter)和考克斯菌属(Kocuria)仅存在于对照植株中。; 杨俊誉陈小龙高玲玲黄琼; 关键词：内生细菌拮抗细菌抑菌谱 RDNA 种群结构

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杨俊誉