薛宇
- 作品数:35 被引量:5H指数:1
- 供职机构:华中科技大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学文化科学轻工技术与工程更多>>
- 细胞表型图像定量分析的高通量功能基因筛选方法及系统
- 本发明公开了细胞表型图像定量分析的高通量功能基因筛选方法及系统,属于基因筛选技术领域。利用全自动荧光显微镜拍取得到有待筛选表型和无待筛选表型的细胞图像;分别转化成有待筛选表型和无待筛选表型的黑白二值图像;再分割成包含单个...
- 薛宇宁万山郭亚萍
- 文献传递
- 中国在翻译后修饰的生物信息学研究领域的进展与前瞻被引量:5
- 2015年
- 翻译后修饰在调控蛋白质构象变化、活性以及功能方面具有重要作用,并参与了几乎所有细胞通路和过程。蛋白质翻译后修饰的鉴定是阐明细胞内分子机理的基础。相对于劳动密集的、耗费时间的实验工作,利用各种生物信息学方法开展翻译后修饰预测,能够提供准确、简便和快速的研究方案,并产生有价值的信息为进一步实验研究提供参考。文章主要综述了中国生物信息学者在翻译后修饰生物信息学领域所取得的研究进展,包括修饰底物与位点预测的计算方法学设计与完善、在线或本地化工具的设计与维护、修饰相关数据库及数据资源的构建及基于修饰蛋白质组学数据的生物信息学分析。通过比较国内外的同类研究,发现优势和不足,并对未来的研究作出前瞻。
- 刘泽先蔡煜东郭雪江李骜李婷婷邱建丁任间施绍萍宋江宁王明会谢鹭薛宇张子丁赵兴明
- 关键词:翻译后修饰共价修饰磷酸化
- 蛋白质编码方法及蛋白质翻译后修饰位点预测方法及系统
- 本发明公开了蛋白质编码方法及蛋白质翻译后修饰位点预测方法及系统,属于生物信息学领域。所述蛋白质编码方法包括收集修饰位点信息、位置权重训练和待编码肽段的编码。蛋白质翻译后修饰位点预测方法包括收集修饰位点信息、特征编码、模型...
- 薛宇宁万山许浩东邓万锟郭亚萍
- 文献传递
- Reconstruction of rice phosphorylation networks through a phosphoproteome-based prediction of site-specific kinase-substrate relations
- Background: As one of the most important and ubiquitous post-translational modifications(PTMs),the reversible ...
- 程涵邓万锟王勇博刘泽先潘智城薛宇
- 关键词:PHOSPHORYLATION
- 基于病人检测信息对潜在治疗方案治愈概率打分的方法
- 本发明属于深度学习分析领域,公开了一种基于病人检测信息对潜在治疗方案治愈概率打分的方法,该方法包括以下步骤:(S1)收集训练用数据;(S2)建立逻辑回归模型并训练;(S3)分别建立unet模型和三维卷积神经网络模型并训练...
- 薛宇苟宇杰宁万山
- 文献传递
- WERAM:关于真核生物中组蛋白乙酰化和甲基化修饰酶,去修饰酶和识别蛋白的数据库
- 在本工作中,我们针对组蛋白乙酰转移酶,组蛋白去乙酰酶,组蛋白甲基转移酶,组蛋白去甲基酶及两种修饰的识别蛋白建立了一个综合型的数据库:WERAM。组蛋白修饰转移酶,去修饰酶,和修饰识别蛋白协同作用,决定了生物体的组蛋白密码...
- 徐阳张爽林少峰郭亚萍邓万锟张颖薛宇
- 一种鉴定调控细胞自噬的功能激酶的方法
- 本发明公开了一种鉴定调控细胞自噬的功能激酶的方法,属于生物信息技术领域。包括以下步骤:对自噬诱导剂处理前后的细胞样本进行转录组、蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析,获取自噬诱导剂处理前后的细胞样本的基因表达数据、蛋白质表达数据...
- 薛宇彭迪阮晨王晨玮
- 文献传递
- 基于自编码解码器的医学影像分型方法及系统
- 本发明属于肿瘤医学影像分析领域,具体公开了一种基于自编码解码器的医学影像分型方法及系统,其中方法包括训练阶段和检测阶段,训练阶段包括:(1)医学影像数据的预处理;(2)自编码‑解码器模型的建立与训练;检测阶段包括:(S1...
- 薛宇张玮之林少峰
- 一种用于判断待处理多肽与阳性数据集肽段相似度的方法
- 本发明公开了一种用于判断待处理多肽与阳性数据集肽段相似度的方法,包括以下步骤:(1)收集修饰位点信息;(2)位置权重训练与矩阵突变训练;(3)数据质量权重的训练;(4)实际测试。本发明通过对判断方法整体处理流程的设计、以...
- 薛宇蒋沛然宁万山傅振远郭亚萍谭潇丹
- 文献传递
- 一种细胞及区域层次的病理图自动分类方法及系统
- 本发明属于图像分析领域,公开了一种细胞及区域层次的病理图自动分类方法及系统,该方法包括以下步骤:(1)将初始病理图切割成小图,并绘制细胞掩膜图;(2)对小图进行图像分割得到细胞坐标;(3)将初始病理图切割为单个细胞小图,...
- 薛宇苟宇杰宁万山彭迪付珊珊刘丹
- 文献传递