李春香
- 作品数：18 被引量：72H指数：6
- 供职机构：盐城市妇幼保健院更多>>
- 发文基金：盐城市医学科技发展计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 盐城市流感样病例核酸阴性标本中肠道病毒病原谱及VP1基因特征被引量：2
- 2021年
- 目的研究盐城市流感样病例(influenza-like illness,ILI)核酸阴性标本中肠道病毒病原谱构成,以及不同基因型肠道病毒的分子进化特征。方法采集2017年9月—2018年1月盐城市ILI咽拭子559份进行流感病毒核酸检测,采用半巢式PCR扩增进行肠道病毒检测,扩增PCR产物经电泳确认后测序,拼接序列与GenBank数据库中的序列BLAST比对进行肠道病毒的分型,采用一步法RT-PCR方法扩增不同基因型肠道病毒的VP1基因并进行测序分析,采用生物信息软件分析不同血清型肠道病毒核苷酸和氨基酸同源性以及基因分子进化特征。结果559份ILI咽拭子中流感病毒核酸阳性率为11.45%;495份流感病毒核酸阴性标本中,肠道病毒核酸阳性检出率7.88%(39份),有CVA2、CVA5、CVA10等3个血清型,以CVA2型为优势血清型(占82.05%)。分子进化分析显示:CVA2型肠道病毒盐城株聚集成簇单独构成一传播分支,位于分支Lineage2基因群,与我国香港重组株431306株(JX867333)不在同一进化分支;CVA5型肠道病毒盐城株聚集成簇,与浙江温州代表株(KP289362)位于同一进化分支;CVA10型肠道病毒盐城株和盐城市2016—2017年手足口病代表株聚集成簇,与国内主流代表株亲缘关系相近,位于进化分支Lineage2基因群。结论盐城市流感流行高峰期流感病毒阴性标本中肠道病毒感染占一定比例,应加强动态监测、完善病毒谱,并重点关注能引起呼吸道重症的血清型。
- 陈国清陈嘉欣李春香徐丹徐士林李长城王海燕
- 关键词：流感样病例肠道病毒VP1基因
- 2016年盐城地区非EV71非CVA16其他肠道病毒分子分型及肠道病毒CVA6型VP1基因特征分析被引量：7
- 2018年
- 目的了解2016年盐城地区手足口病非肠道病毒71型(enterovirus,EV71)非柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CVA16)其他肠道病毒病原谱分布情况,并对鉴定为肠道病毒CVA6型VP1基因进行分子流行病学研究。方法对分子分型鉴定为CVA6型的肠道病毒,通过反转录聚合酶链式反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)的方法扩增VP1基因全长编码区,扩增产物经纯化测序,采用相应的生物信息软件进行核苷酸及氨基酸序列比对及基因种系进化特征分析。结果 EV71、CVA16与非EV71非CVA16三者核酸阳性率差异有统计学意义(x^2=87.72,P<0.001)。非EV71非CVA16其他肠道病毒基因定型结果显示分属7个基因型CVA4、CVA6、CVA10、埃可病毒3(echovirus 3,E-3)、E-9、E-13、CVB4,分属肠道病毒A、B两组。遗传进化树分析显示,盐城56株CVA6型肠道病毒分属D大分支D3、D4进化分支。其中,54株毒株属D4分支,为国内主流优势流行分支,在D4分支内又聚类成众多细小分支,远离原型株Gdula。结论 2016年盐城市手足病流行的病原谱呈现多样性,有多种基因型的肠道病毒共同流行,CVA6是优势病原体,D4分支的毒株为优势进化分支,形成多条传播链。
- 陈国清李春香邵荣标王瑶李峰徐士林李长城
- 关键词：柯萨奇病毒感染
- 盐城地区300对自然流产夫妇染色体核型分析
- 2013年
- 目的探讨染色体畸变与自然流产的关系。方法对300对自然流产夫妇,采用外周血淋巴细胞培养及G显带技术进行染色体核型分析。结果检出异常核型20例,占全部被检者3.33%。其中平衡易位9例、臂间倒位8例、罗伯逊易位3例。检出多态性变异22例,占全部被检者3.67%。结论染色体核型异常是造成流产、死胎的重要因素之一,对反复自然流产患者应进行必要的细胞遗传学检查。
- 李春香陈国清
- 关键词：流产染色体核型分析
- 2018年盐城市CVA6型肠道病毒全基因组分子特征分析
- 2024年
- 目的掌握盐城市肠道病毒CVA6型基因进化特征。方法对盐城市鉴定为CVA6型的肠道病毒,通过反转录聚合酶链式反应的方法扩增全基因组序列,扩增产物经纯化测序,采用相应的生物信息软件进行核苷酸及氨基酸序列比对、分子进化树构建以及重组分析。结果盐城市2018年共检测疑似疱疹性咽峡炎病例107例,肠道病毒核酸阳性率73.83%,其中CVA6、CVA16、其他肠道病毒分别占50.63%、5.06%、44.30%,未检出EV71。选取3株2018年疱疹性咽峡炎、3株2018年手足口病(流行月峰前、峰中、峰后)、1株2017年手足口病CVA6型代表株进行全基因组测序,遗传进化树显示:7株盐城株位于B进化分支B2基因亚群分支,3株疱疹性咽峡炎CVA6型代表株与2株2018年手足口病CVA6型毒株聚集成簇构成一进化小分支,2株手足口病毒株(2017年、2018年各1株)形成独立的进化小分支,形成2条传播链。选取2个进化小分支中疱疹性咽峡炎、手足口病CVA6型各1株,进行分子进化重组分析,均未发现明显的重组来源。结论2018年盐城市疱疹性咽峡炎的病原谱呈现遗传多样性,CVA6型肠道病毒为优势流行株,与手足口病的CVA6型肠道病毒可能有着共同的来源,盐城株未发现基因重组。
- 王瑶陈国清薛宇铭安然李长城徐士林李春香
- 关键词：疱疹性咽峡炎全基因组序列基因重组
- 盐城市1起病毒性脑炎疫情的肠道病毒Echovirus18VP1基因分子特征
- 2021年
- 目的对盐城市1起病毒性脑炎聚集性疫情分离的Echovirus18(E-18)型肠道病毒进行VP1基因分子进化特征分析。方法通过实时荧光RT-PCR方法,对2019年盐城市病毒性脑炎聚集性疫情标本进行肠道病毒的检测,对非EV71或CVA16其他肠道病毒进行分子分型,采用RT-PCR扩增E-18型肠道病毒VP1基因并测序,采用生物信息软件从核苷酸、氨基酸和分子进化3个层面进行分子特征分析。结果该起病毒性脑炎聚集性疫情是由E-18型肠道病毒感染引起,其6例病例;肛拭子肠道病毒核酸通用阳性4例,阳性率66.67%;均为轻症,全部治愈。4株E-18型肠道病毒株VP1基因片段均未见核苷酸的插入或者缺失,长度均为861bp、编码287个氨基酸,其核苷酸、氨基酸同源性分别为99.9%~100.0%和100.0%;与2019年E-18型手足口病盐城株(151/HFMD/JSYC/2019)VP1基因核苷酸、氨基酸同源性分别为99.5%~99.7%和100.0%;与原型株Metcalf VP1基因核苷酸、氨基酸同源性分别为79.0%~79.1%和93.4%。遗传进化树显示,2019年盐城市4株病毒性脑炎代表株与1株手足口病代表株聚集成簇,构成1个独立进化分支,属于C2基因亚群分支毒株。与原型株Metcalf相比,盐城市4株病毒性脑炎代表株涉及19个氨基酸位点的变异,变异率为6.62%,与1株手足口病代表株在VP1基因B-C loop区域发生了R84N氨基酸位点的变异。结论该起病毒性脑炎聚集疫情由E-18型肠道病毒引起,该病毒属于C2基因亚群优势进化分支,与本地手足口病代表株可能有共同的来源。
- 李春香陈国清王瑶李峰徐士林李长城
- 关键词：病毒性脑炎基因型VP1基因
- 2022-2024年盐城市甲型H3N2流感病毒HA1和NA基因分子特征
- 2024年
- 目的研究2022-2024年盐城市分离的甲型H3N2流感病毒血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)分子进化特征。方法收集盐城市2022年4月至2024年3月间的流感哨点监测医院以及各县市区流感暴发点采集的流感样病例标本,Rt-qPCR进行核酸检测,阳性样本进行病毒分离。分离的甲型H3N2毒株,采用一步RT-PCR方法扩增HA1和NA基因并测序,采用相关生物信息学软件分析基因核苷酸、氨基酸位点变异及进化特征。结果2022年4月至2024年3月间共采集5020份样本,流感病毒核酸阳性检出率为18.59%(933/5020)。2022年4月至2024年3月两个监测季冬春季流感峰明显,其中,仅2022年4月-2023年3月监测季夏季流感峰明显,甲型H3N2亚型流感病毒是两个监测季的优势流行株。遗传进化树显示:2022-2024年盐城市32株甲型H3N2毒株HA1和NA基因在各分支的聚类关系基本一致,2023-2024年24株分离株的HA1基因和NA基因与2022-2024年北半球疫苗株A/Darwin/9/2021(H3N2)聚类位于3C.2a1b.2a.2a.3a.1进化谱系;2022年8株分离株与2021-2022年北半球疫苗株A/Cambodia/e0826360/2020(H3N2)聚类位于3C.2a1b.2a.1a进化谱系。6株分离株(A/JSTH/11735/2023、A/JSTH/11788/2023、A/JSTH/11974/2023、A/JSYD/353/2023、A/JSYD/354/2023、A/JSTH/138/2023)均发生F79L、N122D、P239S、K276E氨基酸位点的变异,既存在于散发株又存在于暴发株。盐城市甲型H3N2毒株HA1基因编码区抗原表位、受体结合位点、糖基化位点发生了一定程度变异,基因层面上分析,2023-2024年24株分离株与2022-2024年北半球疫苗株A/Darwin/9/2021免疫原性匹配性较好,2022年8株分离株与2021-2022年北半球疫苗株A/Cambodia/e0826360/2020免疫原性匹配性较好。盐城市分离株未发生NA蛋白酶活性位点以及耐药位点的变化。结论2022-2024年盐城市流行的甲型H3N2毒株HA1和NA基因正逐渐发生抗原性漂移,增加推荐疫苗株的不匹配度,造成流感的暴发流行。
- 李春香孙雄英杨敏沈鹏袁嘉婧张敏陈晨李长城陈国清
- 关键词：RT-PCRHA1基因NA基因
- 2016年盐城地区麻疹病毒分子分型及血凝素蛋白基因特征分析被引量：1
- 2017年
- 目的 鉴定2016年流行于盐城地区的麻疹野病毒的基因型别,并对血凝素蛋白基因进行分子进化特征分析.方法 通过实时荧光RT-PCR方法对2016年盐城市疑似麻疹病例咽拭子标本进行核酸检测,对麻疹病毒核酸阳性标本RT-PCR扩增核蛋白、血凝素蛋白基因并测序,采用相应的生物信息软件对核苷酸及氨基酸序列比对及基因亲缘关系进化特征分析.结果 2016年盐城地区麻疹病毒经基因型分型为H1a基因亚型和D8基因型.5株H1a代表株与江西代表株（KJ136545）聚集成簇形成独立的进化小分支,属H1a-1进化基因群分支;7株D8代表株与2009年美国代表株（JN635404）聚集成簇,属D8-3-2小分支基因群毒株.与疫苗株沪S191相比,盐城地区5株H1a基因亚型代表株240位氨基酸发生了S240 N的变异,丢失了238位N-连接的糖基化位点,7株D8基因型代表株未发生N-糖基化位点的变化.结论 2016年盐城地区麻疹病毒流行株主要为中国本土H1a优势基因亚型和D8输入基因型;除5株H1a基因亚型代表株丢失了238位N-连接的糖基化位点,盐城地区12株麻疹病毒HA基因大部分重要中和抗原位点未发生变异.
- 陈国清李春香王瑶李峰徐士林李长城邵荣标
- 关键词：麻疹病毒HA基因N基因
- 2015年盐城市甲型H3N2亚型流感病毒HA1基因分子进化特征分析被引量：4
- 2017年
- 目的了解盐城市2015年甲型H3N2流感病毒分离株表面血凝素HA1基因分子进化特征。方法对哨点医院流感样病例标本进行核酸检测、病毒分离;选取甲型H3N2毒株,采用一步法RT-PCR扩增其HA1区,并进行序列分析,采用DNAStar软件包中MegAlign进行核苷酸及氨基酸同源性分析,以MEGA6.0软件进行序列比对及基因种系进化特征分析。结果 2015年盐城市流感样病例(ILI)监测样本中流感病毒核酸阳性率为8.36%,乙型、甲型H3N2、新甲H1N1型交替流行。抽取的7株甲型H3N2分离株,其HA1基因核苷酸同源性为98.7%~100.0%,氨基酸同源性为97.9%~100.0%;其HA1区氨基酸位点变异呈散在性分布,均未发生氨基酸的丢失和插入,氨基酸突变主要位于抗原决定簇的A、B和C区。除A/JSYC/11025/2015外,其余6株新增2个糖基化位点,其中158aa位点位于抗原决定簇B区。结论 2015年盐城市流感流行以甲型H3N2和乙型Yamagata系为主,具有典型的冬、夏双高峰特点。病毒HA1区基因特性逐渐发生变异,可能导致抗原变化,应进一步加强流感病原学监测。
- 陈国清李春香邵荣标王瑶徐士林李长城
- 关键词：流感RT-PCRHA1基因
- 2010年盐城地区手足口病例肠道病毒型别调查被引量：15
- 2012年
- 目的对盐城地区2010年手足口病患儿及其临床重症病例进行病原学调查。方法采集手足口病患儿咽拭子和肛拭子,对其病毒核酸进行肠道病毒检测定型。结果 481例(含重症52例)患儿采集的咽拭、肛拭标本中,共检测出病毒核酸阳性326例,阳性率为67.78%,其中CA16型44例(13.50%)、EV71型179例(54.91%)、未定型103例(31.59%)。52例重症病例中共检测出病毒核酸阳性45例,阳性率为86.54%,其中EV71型32例(71.11%)、未定型13例(28.89%)、CA16型0例。326例病毒核酸阳性患儿中男214例,女112例;45例病毒核酸阳性重症患儿中男33例,女12例。结论盐城地区手足口病患儿检测到的主要病原体是CA16和EV71等,EV71感染率高于CA16感染率,肠道病毒EV71是引起重症病例的主要病原体。
- 陈国清邵荣标王海燕陈玉宏李春香
- 关键词：手足口病EV71CA16肠道病毒
- 2016年盐城市手足口病病原学特征及EV71和CVA16型肠道病毒VP1基因特征被引量：11
- 2017年
- 目的了解2016年盐城市手足口病肠道病毒病原谱分布特征,并对鉴定为EV71、CVA16型肠道病毒VP1基因进行分子进化特征分析。方法收集疑似手足口病咽肛拭子标本,采用实时荧光RT-PCR方法检测通用、EV71和CVA16型肠道病毒核酸,以RT-PCR法扩增其VP1基因全长编码区并进行序列分析,采用MegAlign、mafft、MEGA等软件进行核苷酸及氨基酸序列比对及基因种系进化特征分析。结果 2016年盐城市共收集疑似手足口病标本504份,检出肠道病毒核酸阳性165份,阳性率32.74%,EV71型、CVA16型、其他型别分别占4.37%、6.94%、21.43%。对EV71、CVA16型肠道病毒遗传进化树分析显示,盐城地区EV71和CVA16代表株分别属于C4a、B1b基因亚群进化分支,未发生基因亚群的转换,在各自进化分支中形成3条传播主链,远离各自原型株。结论 2016年盐城市手足病病原谱为多种基因型的肠道病毒共同流行。其他肠道病毒为优势病原体,EV71和CVA16仍占有一定比例。
- 陈国清李春香王瑶李峰徐士林李长城邵荣标
- 关键词：手足口病EV71VP1基因
