康文渊
- 作品数：4 被引量：3H指数：1
- 供职机构：西南交通大学生命科学与工程学院更多>>
- 发文基金：中央高校基本科研业务费专项资金国家自然科学基金四川省科技支撑计划更多>>
- 相关领域：理学化学工程生物学医药卫生更多>>
- 响应性聚合物纳米控释材料的研究进展被引量：1
- 2016年
- 介绍了近几年来,pH、温度、磁场以及双重等常见的刺激响应性聚合物纳米材料在药物控制释放领域中的研究进展,并展望了其发展方向。
- 范倩孙岩雷冬梅康文渊王萃娟陈晓浪李孝红张志斌
- 关键词：刺激响应性纳米
- 分子动力学模拟HPV(16,18)E6蛋白
- 2018年
- 目的:对人乳头瘤病毒HPV16,18中E6蛋白结构进行分子模拟和分析,寻找可以作为蛋白-配体相互作用的关键结构区域。方法:以HPV16 E6蛋白为模板,对HPV18 E6蛋白进行同源建模,对构建的HPV18 E6模型以及晶体结构模型HPV16 E6进行分子动力学模拟,通过微观上的loop环分析和宏观上的整体运动分析研究了HPV18 E6与HPV16 E6在溶剂环境下结构变化的异同。结果:发现靠近N端loop环在蛋白-配体结合过程中能介导控制配体、水、离子进出的"门控"的作用,解释了两个蛋白在水溶剂中的运动构象的变化。结论:本研究解释了HPV16 E6与HPV18 E6两个蛋白在溶剂中的运动机制,并发现了loop环在其中扮演"门控"的作用,解释了两个蛋白在水溶剂中的运动构象的变化,该发现能够为基于两个蛋白为靶点的药物设计提供理论依据。
- 张雯雯康文渊邹金晶毕振飞豆荣昆茆灿泉
- 关键词：HPVE6蛋白同源建模分子动力学模拟
- 分子动力学模拟残基突变对芳香烃受体配体结合区的影响被引量：1
- 2017年
- 芳香烃受体(Aryl hydrocarbon receptor,AhR)属于配体依赖性的转录因子蛋白。本文通过对AhR配体结合区域(Ligand binding domain,LBD)的结构功能及物种特异性分析,发现在其结合腔口有一些关键残基可能起到"门控"作用,进一步将野生型(WT)和3个突变模型(Phe289Ala、Tyr316Ala、Ile319Ala)进行分子动力学模拟,从蛋白稳定性、蛋白结构变化、蛋白结合腔变化及蛋白和配体结合能力4个方面分析3个残基的门控作用。研究发现,Phe289、Tyr316、Ile319氨基酸残基通过形成疏水作用为AhR LBD起到"门控"作用;而将这些氨基酸分别突变后,其蛋白稳定性降低,整体运动性增加,配体亲和力减弱,其中Tyr316、Ile319对腔内体积影响较大,Phe289使腔内环境稳定性降低。本研究可为基于芳香烃受体的药物设计提供相关理论指导。
- 康文渊徐锡明郭建秀田菲菲
- 关键词：分子模拟分子动力学突变芳香烃受体
- 噻吩并嘧啶类FLT3抑制剂结合模式预测与分析被引量：1
- 2015年
- FLT3(FMS样酪氨酸酶III)是酪氨酸激酶受体(RTKIII)成员之一,其异常超表达或突变与急性髓细胞白血病(AML)呈现非常大的相关性,成为治疗AML的重要靶位点。本文采用不同的方法对FLT3活性位点进行了预测,利用分子对接、分子动力学以及药效团分析研究了新型嘧啶类化合物与FLT3的相互作用与结合模式。分子对接得到的结合模式与分子动力学模拟得到的结果一致,结合药效团分析表明该嘧啶类化合物主要通过疏水相互作用和氢键与FLT3激活位点结合,从而起到抑制作用。本研究对以FLT3为靶点的嘧啶类抑制剂的开发提供了理论和实验依据。
- 康文渊丁若凡范倩田菲菲
- 关键词：FLT3分子对接分子动力学
