吴燕
- 作品数：9 被引量：14H指数：2
- 供职机构：四川大学生命科学学院四川省分子生物学及生物技术重点实验室更多>>
- 发文基金：国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学轻工技术与工程化学工程更多>>
- 运动发酵单胞菌基因组重组系统RED和CRISPR-Cas9的构建及其应用
- 运动发酵单胞菌(Zymomonas mobilis)是一种高效的乙醇产生菌,基因组仅为2Mb,利用基因组编辑技术对运动发酵单胞菌基因进行敲出和敲入,不仅具有要的科学意义,而且也有很高的应用价值,因此,构建高效和操作简单的...
- 曹庆华李涛吴燕王海燕张义正谭雪梅
- 运动发酵单胞菌RecET重组系统的构建及应用被引量：1
- 2016年
- 为了提高外源基因整合到染色体的效率,在已构建的运动发酵单胞菌-大肠杆菌穿梭载体基础上,构建了RecET表达质粒pSUZM3a-RecET.选取乙醇脱氢酶Ⅰ(adhA)基因作为靶基因,四环素抗性基因(Tcr)作为筛选标记基因,检测RecET重组系统在Z.mobilis中进行基因重组的可行性.将两端带有60bp adhA基因同源臂的四环素抗性基因片段电击转化含有RecET重组系统表达质粒的运动发酵单胞菌ZM4,获得adhA基因缺失突变菌株.对突变菌株adhA基因的PCR产物进行测序发现,adhA基因已被置换为四环素抗性基因.上述结果表明:RecET重组系统在运动发酵单胞菌中具有高效、便捷和可操作性,只需60bp同源臂即可完成同源重组.
- 李涛曹庆华吴燕谭雪梅张义正
- 关键词：运动发酵单胞菌基因敲除基因敲入
- 甘薯耐旱和耐盐基因的挖掘和表达分析被引量：8
- 2016年
- 甘薯是世界第7大粮食作物,具有产量高、营养丰富、耐干旱和盐碱等优点.通过转录组学方法,基于国内3个甘薯品种的综合转录组数据库中进行耐旱和耐盐相关转录本序列的挖掘,共获得238个转录本,随机选取9条具有全长编码序列的转录本进行PCR扩增、克隆和测序后,测定序列与组装序列相似度均高于98%,表明转录本序列是可靠的.分析这些转录本在不同甘薯品种间的表达水平时发现,耐旱基因在京薯6号中表达量普遍较高,而在徐薯18中则普遍偏低,而耐盐相关基因的差异表达模式却与之相反.利用数字基因表达谱数据进一步分析耐旱和耐盐基因在徐薯18的6个组织或生长发育阶段中的差异和特异表达,结果显示:耐旱和耐盐基因在成熟叶和膨大期块根中相对于其他组织具有高表达且差异显著.采用荧光定量PCR方法验证结果表明,耐旱和耐盐基因在徐薯18不同组织器官或发育阶段表达情况与数字基因表达谱分析结果基本一致.
- 吴燕颜朗李雪丹谭雪梅张义正
- 关键词：甘薯转录组耐旱基因耐盐基因基因表达
- 甘薯非特异性脂质转移蛋白基因克隆与表达分析（英文）
- 2016年
- 非特异脂质转移蛋白(ns LTP)是植物界普遍存在的一类涉及多种胁迫反应的可溶性蛋白。为了阐明甘薯中非特异性脂质转移蛋白基因IbLTP1和IbLTP2在盐胁迫反应中的功能,本研究运用PCR技术,对IbLTP1和IbLTP2基因进行了克隆,并通过生物信息学方法分析了序列结构、蛋白质保守结构域和系统进化关系;利用q RT-PCR方法检测了这两个基因在不同组织中的表达模式以及盐胁迫条件下的表达差异;将IbLTP1和IbLTP2基因克隆到大肠杆菌的原核表达载体p ET32a中,对重组菌BL21(p ET32a-LTP)的耐盐性进行分析。序列分析表明:IbLTP1和IbLTP2编码区均不含内含子并都具有等位基因。IbLTP1和IbLTP2基因的蛋白质序列分别包括114和94个氨基酸残基并且不含色氨酸残基,蛋白序列N端含有信号肽序列。保守结构域和系统进化分析结果表明:IbLTP1和IbLTP2均含有ns LTP蛋白的保守结构域,IbLTP1属于TypeⅠ而IbLTP2属于TypeⅡ。实时荧光定量PCR分析表明:IbLTP1在幼叶中表达量最高,根中表达量最低;而IbLTP2在茎中表达量最高,成熟叶中表达量最低。在Na Cl胁迫条件下,IbLTP1和IbLTP2表达量在根中基本无变化而在茎和叶中上调。大肠杆菌BL21(DE3)中异源表达IbLTP1和IbLTP2基因能够提高转基因菌株对Na Cl的耐受性。因此,本研究推测IbLTP1和IbLTP2基因可能在甘薯盐胁迫反应中发挥了作用。
- 李雪丹魏昌赫邵欢欢吴燕张义正王海燕
- 关键词：甘薯非特异性脂质转移蛋白氯化钠胁迫基因克隆实时荧光定量PCR
- 甘薯非生物胁迫抗性相关基因组织间差异表达分析
- 甘薯是世界上第七大粮食作物，产量高、营养丰富、环境适应性极强，能在干旱贫瘠的土地上种植。随着土壤及环境的恶化，大量非生物胁迫因素如干旱、盐、重金属、氧化压力等对植物生长和发育带来了不良影响。然而，甘薯自身表现出的抗逆特性...
- 吴燕颜朗李雪丹张义正
- 关键词：甘薯非生物胁迫抗性基因
- 甘薯基因组概览分析及重要功能基因挖掘
- 甘薯[Ipomoea batatas(L.) Lam]是世界第7大粮食作物,它高产稳产、营养丰富且环境适应性极强,能够种植于干旱贫瘠土壤,投入产出比高且用途广泛,是一种重要的粮食、饲料和工业原料作物.甘薯栽培品种是6倍体...
- 颜朗李雪丹吴燕张义正
- 关键词：甘薯基因组功能注释
- 皇竹草转录组分析揭示其抗冻特性被引量：5
- 2017年
- 皇竹草是一种高产、优质牧草,但因耐寒性较差而极大限制了其在我国大面积种植和推广.选择在冬季平均温度接近皇竹草耐寒极限温度的四川地区进行了5年自然驯化,筛选在最低温度-5℃下能够自然过冬的样本,并在冬季最低温度下和夏季最高温度下分别取样进行转录组测序,挖掘皇竹草本身具有的耐寒、抗冻基因.结果显示:皇竹草转录组共有转录本125 467条,注释转录本65 633条,注释信息及邻近分析显示皇竹草与小米、玉米高度同源.冬夏两季皇竹草比较转录组分析共计筛选差异表达基因11 443个,其中冬季相对于夏季表达量上调基因6 943个,下调基因4 500个,差异显著.在以上差异表达基因中,共计挖掘在冬季低温条件下高度表达的抗冻基因112个,且有17个抗冻基因在冬季样品中特异表达.随机选取6个差异表达的抗冻基因进行荧光定量PCR实验验证,结果显示与预测转录本表达量一致.本研究对皇竹草进行了转录组测序并通过比较转录组的方法挖掘其在自然驯化条件下成功越冬样本中的抗冻基因,有利于揭示皇竹草冷适应下的抗性机制,同时也有助于热带引种植物分子育种的开展.
- 颜朗吴燕陈鼎谭雪梅张义正
- 关键词：皇竹草抗冻基因基因差异表达
- 甘薯非特异性脂质转移蛋白基因克隆与表达分析
- 非特异性脂质转移蛋白(nonspecific lipid transfer protein,nsLTP)是植物体普遍存在的一类分子量小(通常6.5-10.5 kDa)、碱性(pI通常为8.5-12)、表达量高、涉及多种胁...
- 李雪丹吴燕张义正
- 关键词：甘薯非特异性脂质转移蛋白基因克隆基因表达
- 运动发酵单胞菌RecET重组系统的构建及其应用
- 运动发酵单胞菌(Zymomonas mobilis)是一种兼性厌氧革兰氏阴性菌，它具有显著的生长代谢优势和很高的乙醇生产效率。将来源于Rac 噬菌体的RecET重组系统引入运动发酵单胞菌内，通过带有短同源序列的线性DNA...
- 李涛曹庆华吴燕王海燕张义正谭雪梅
- 关键词：运动发酵单胞菌同源重组基因敲除
