孙海燕
- 作品数：8 被引量：53H指数：4
- 供职机构：绍兴第二医院更多>>
- 发文基金：浙江省医药卫生科学研究基金国家科技重大专项浙江省自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 人感染高致病性H5N6禽流感病毒的分子生物学特征被引量：10
- 2016年
- 目的分析2014-2015年3例新型人感染高致病性禽流感（HPAI）H5N6毒株的血凝素（HA）与神经氨酸酶（NA）基因序列,探讨该病毒的遗传变异及分子生物学特征。方法收集Gen Bank、全球共享禽流感数据倡议组织（GISAID）及浙江大学传染病诊治国家重点实验室提供的H5N6病毒基因序列,利用生物信息软件MEGA6.0及Net Nglyc服务器对基因序列进行遗传进化和分子变异特征分析。结果 3例感染HPAI-H5N6患者毒株的HA与NA氨基酸序列的同源性分别为96.5%～98.7%和90.1%～98.2%;HA氨基酸序列比对分析发现A/Guangzhou/39715/2014（H5N6）和A/Sichuan/26221/2014（H5N6）与A/duck/Eastern China/1111/2011（H5N2）同源性最近,分别为97.7%和98.5%;A/Yunnan/0127/2015（H5N6）与A/muscovy duck/Vietnam/LBM631/2014（H5N1）同源性最近（97.2%）;NA氨基酸序列比对分析发现A/Guangzhou/39715/2014（H5N6）和A/Yunnan/0127/2015（H5N6）与A/swine/Guangdong/K6/2010（H6N6）同源性最近,分别为97.2%和97.6%,A/Sichuan/26221/2014（H5N6）与A/duck/Guangdong/S3073/2010（H6N6）同源性最近（97.4%）;进化树分析显示3例患者毒株处于2个不同的分支;HA基因包含有S137A、T160A等突变,糖基化分析显示有6～7个N-糖基化位点。结论新型人感染HPAI-H5N6病毒是一种重组病毒,其HA基因来源于亚洲禽类H5亚型,NA基因来源于亚洲禽类H6N6;HA基因位点突变及N-糖基化改变可能有助于增强对人类的感染。
- 高敏崔大伟杨先知谢国良车飞虎孙海燕陈瑜
- 关键词：血凝素神经氨酸酶N-糖基化
- 2013-2015年浙江地区哨点医院H3N2甲型流感病毒感染患者临床特点与流行病学特征被引量：3
- 2016年
- 目的分析2013-2015年浙江地区哨点医院监测纳入的H3N2甲型流感病毒感染患者的临床特点及流行病学特征。方法对2013年1月至2015年12月浙江地区8家哨点医院纳入的符合急性呼吸道感染（acute respiratory infection,ARI）定义的病例进行流行病学和临床信息调查,采集呼吸道标本进行流感病毒核酸检测。按检测结果将病例分为H3N2阳性组和流感阴性组,分析两组病例流行病学和临床特征。结果 2013-2015年浙江地区8家哨点医院共纳入7 602例急性呼吸道感染,其中实验室确诊H3N2病例490例（占6.4%）。浙江地区连续3年的监测共出现3次发病高峰,分别是2013年12月-2014年3月、2015年1-3月和2015年7-8月。H3N2病例年龄中位数为50岁,其中男性占62.0%,慢性基础性疾病史、恶性肿瘤病史及吸烟史的患者在H3N2阳性组的比例高于流感阴性组,差异有统计学意义（其中慢性基础性疾病史χ~2=6.600、7.519、3.875、53.719、3.997、31.086、63.789、21.309和53.95;恶性肿瘤史χ~2=55.316;吸烟史χ~2=14.418,P值均〈0.05）。H3N2阳性组出现排痰性咳嗽、咯血、X线/CT表现异常和肺部听诊异常的比例较流感阴性组高,而H3N2阳性组白细胞总数和血小板总数较流感阴性组低,差异均有统计学意义（排痰性咳嗽χ~2=82.703,咯血χ~2=104.807,X线/CT表现异常χ~2=5.114,肺部听诊异常χ~2=11.823;白细胞总数t=-2.602,血小板总数t=-3.488,P值均〈0.05）。结论浙江地区H3N2流感多发生在冬春季和夏季,具有慢性基础性疾病及肿瘤等病情的患者是感染的高危人群。
- 孙海燕崔大伟车飞虎高敏杨先知谢国良陈瑜
- 关键词：流感甲型流感病毒H3N2亚型流行病学特征
- 2013-2015年浙江地区新型甲型H1N1流行性感冒的流行病学和临床特征调查被引量：11
- 2016年
- 目的调查2013-2015年浙江地区哨点医院监测的新型甲型H1N1流行性感冒(简称流感)的临床特征及其流行病学特征。方法对2013-2015年浙江地区8家哨点医院纳入的符合急性呼吸道感染的患者进行流行病学和临床特征调查,采集研究对象呼吸道标本进行流感病毒检测,分析新型甲型H1N1流感病毒阳性组与阴性组的临床和流行病学特征。结果 8家哨点医院共纳入7 602例急性呼吸道感染患者,其中,实验室确诊新型甲型H1N1流感779例(10.2%),新型甲型H1N1流感患者中位年龄为51岁,115例(33.6%)患有至少1种慢性基础性疾病,新型甲型H1N1流感中哮喘比例(2.6%)高于流感病毒阴性患者(0.6%),差异有统计学意义(χ2=12.706,P<0.01)。新型甲型H1N1流感中恶心、呕吐所占比例高于流感病毒阴性患者,排痰性咳嗽、腹泻所占比例低于流感病毒阴性患者。新型甲型H1N1流感患者的白细胞计数和中性粒细胞计数均低于流感病毒阴性组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论浙江地区人感染新型甲型H1N1流感的高发期为每年的冬春季节,其他时间呈散发。新型甲型H1N1流感的临床症状与非流感患者相比较无特异表现。
- 车飞虎崔大伟孙海燕高敏杨先知谢国良陈瑜
- 关键词：流行病学
- 胆道感染大肠埃希菌与肺炎克雷伯菌的耐药性分析被引量：8
- 2011年
- 目的对胆道感染大肠埃希菌（ECO）和肺炎克雷伯菌（KPN）的耐药性进行调查分析,为合理使用抗菌药物提供依据。方法共78株ECO和36株KPN,均来自医院2007-2009年接受胆道手术患者的胆汁标本,采用K-B法测定12种常用抗菌药物的敏感性,用纸片协同法检测超广谱β-内酰胺酶（ESBLs）。结果胆道感染ECO和KPN的耐药性普遍较高,对第二-四代头孢菌素耐药率,ECO在53.8%-65.4%,KPN则在47.2%-61.1%;磺胺甲噁唑/甲氧苄啶耐药率分别为70.5%和72.2%,环丙沙星分别为57.7%和47.2%;所有菌株对碳青霉烯类全部敏感,对含酶抑制剂复合药和阿米卡星的耐药率也较低;ESBLs检出率ECO为43.6%,KPN为41.7%。结论 ECO和KPN是胆道感染的主要病原菌,术前过早、过多使用广谱抗菌药物是产酶菌株增多和耐药性增强的主要原因。
- 孙海燕王亚玲肖美英钱小毛
- 关键词：胆道感染大肠埃希菌肺炎克雷伯菌耐药性
- 2013至2015年浙江地区人感染 H7 N9禽流感病毒蛋白关键位点分子特征分析被引量：4
- 2016年
- 目的：分析浙江地区人感染H7 N9禽流感病毒的分子特征，为更好地预防与治疗人感染H7N9禽流感提供科学依据。方法从全球禽流感共享数据库（GISAID）中下载浙江地区2013至2015年分离的人感染H7N9病毒株（共30株）和同时期禽源性病毒株（15株）的基因序列，运用MEGA 6．0软件比较分析人H7N9流感病毒基因的分子进化特征、受体结合位点、毒力相关位点、耐药性位点的变异情况。结果进化树分析显示，浙江地区人感染H7 N9代表株与禽源性参考株的HA、NA蛋白差异较小，同源性分别为98．0％～100．0％和97．4％～100．0％。病毒氨基酸变异分析显示，30株H7N9代表株的HA蛋白均发生了226位（ Q226L／I）和186位（ G186V）突变，且2015年分离株出现A134V突变；有1株NA蛋白出现R294K耐药位点的变异；19株PB2蛋白发生了E627K突变，2株发生D701N突变；所有代表株M2蛋白均发生了S31N突变；HA的裂解位点均为PEIPKGR↓GLF，仍为低致病性毒株。结论2013至2015年浙江地区人感染H7N9流感病毒与同时期的禽源性病毒株具有高度同源性，部分氨基酸位点存在变异，所有代表株对离子通道抑制剂（金刚烷胺类药物）耐药，个别菌株出现对神经氨酸酶抑制剂（奥司他韦）耐药。
- 孙海燕童海江崔大伟Juengpanich SarunPimpakan Aojanepong
- 关键词：分子流行病学进化树
- 浙江省麻疹病毒的基因特征分析被引量：1
- 2017年
- 目的分析浙江省流行的麻疹病毒(MV)的基因特征,为更好地防控麻疹提供科学参考。方法从GenBank检索并下载浙江省所有麻疹病毒株、中国麻疹疫苗株和WHO推荐参考株的血凝素蛋白(H)和核蛋白(N)的基因组序列,利用MEGA 6.0软件进行比对分析,构建种系进化树,确定浙江省麻疹病毒流行的基因型别,并进行同源性和基因变异分析。结果浙江省麻疹病毒以H1基因型为主(27株),其他基因型为辅(2株B3型)。H1a亚型(21/27)占绝对优势,其次为H1b亚型(6/27)。浙江省所有毒株间H蛋白的氨基酸同源性为96.9%~100.0%,与疫苗株Shanghai-191和Changchun-47的同源性均为95.0%~96.0%。浙江省所有毒株间N蛋白羧基末端的氨基酸同源性为82.7%~100.0%,与疫苗株Shanghai-191的同源性为85.8%~89.5%,与疫苗株Changchun-47的同源性为87.3%~91.0%。结论麻疹病毒H1基因型为浙江省麻疹流行的优势株,与现行参考疫苗株(A基因型)差异较大,因此针对麻疹病毒H1基因型疫苗的研制是今后浙江省麻疹病毒防控的关键。
- 孙海燕崔大伟童海江
- 关键词：麻疹病毒基因特征进化树
- 人感染H7N9禽流感病毒的研究进展被引量：13
- 2017年
- 人感染H7N9禽流感是一种新型禽源性流感病毒,于2013年3月底在上海和安徽两地率先发现,并短时间内在我国迅速蔓延,感染导致较高的发病率和病死率,引起人们的担忧和恐慌,并引发全球范围的广泛关注.对患者体内分离的H7N9病毒基因分析显示,该病毒与人类呼吸道上皮细胞的唾液酸 α-2,6型受体的亲和力较高.目前,人感染H7N9禽流感病毒的散发病例仍时有报道,冬春季相对高发.该文就近年来国内外H7N9禽流感感染患者的临床特点、流行病学及病毒基因特征的研究进展做一综述,为人感染H7N9禽流感的有效防控提供科学依据.
- 孙海燕童海江崔大伟陈瑜
- 关键词：流行病学基因特征
- 多重荧光定量RT-PCR检测高致病性H5N6禽流感病毒被引量：4
- 2016年
- 目的建立一种快速检测流感病毒A型(FluA)及高致病性禽流感(HPAI)H5N6病毒感染的荧光定量RT-PCR法。方法以人细胞核糖核酸酶P(RP)基因作为临床样本的内参基因,用Primer Express 3.0软件设计PCR特异性引物和探针,建立一种检测FluA及HPAI-H5N6病毒的一步法多重荧光定量RT-PCR方法,评估其灵敏度、特异性,并与上海之江公司提供的试剂及测序法进行比较。结果建立的多重荧光定量RT-PCR法检测FluA、H5、N6及RP质粒标准品的灵敏度均达102copies/m L。各对引物和相应探针仅检测出相应的病毒,在这些病毒和常见病原分析中未发现存在交叉反应,特异性达100%。用该法检测135例临床标本,结果显示FluA为23例,未发现HPAI-H5N6病毒的感染者;与上海之江公司提供的试剂的检测结果及基因测序结果一致。结论建立的一步法多重荧光定量RT-PCR法可用于FluA及HPAI-H5N6病毒感染患者的早期诊断。
- 马光华崔大伟谢国良杨先知高敏车飞虎孙海燕陈瑜
- 关键词：甲型流感病毒
