徐伟
- 作品数：18 被引量：74H指数：5
- 供职机构：贵州大学动物科学学院更多>>
- 发文基金：贵州省科技计划项目贵州省农业科技攻关项目贵州省工业攻关项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学矿业工程更多>>
- 黔北麻羊DRB1基因Exon3遗传变异分析被引量：5
- 2016年
- 本研究采用构建193只黔北麻羊DNA池并对其PCR结果直接测序和生物信息学分析的方法对MHC-DRB1基因的第三外显子进行遗传变异分析,旨在获得黔北麻羊MHC-DRB1基因的多态性,为MHC基因在山羊的抗病育种研究中提供基础资料。分析结果得到DRB1基因Exon3中共7个SNPs,分别为A^9G(Ile→Val)、G^(120)A(Gly→Ger)、C^(125)T、G^(140)A、T^(245)G(Asp→Glu)、C^(251)T、G^(275)A。生物信息学分析得到各突变位点均引起RNA二级结构的改变,各错义突变位点均引起蛋白质二级结构的改变,但并未引起抗原表位改变。
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- 关键词：黔北麻羊DRB1基因SNPS生物信息学
- 贵州白山羊和贵州黑山羊DRB1基因第3外显子遗传变异分析
- 引言/目的 DRB1基因是位于MHC复合体的第Ⅱ区DR家族B类基因座上,有丰富的多态性。MHC的表达产物是MHC抗原,主要参与体内抗原递呈,与外来抗原结合形成复合体,T淋巴细胞识别后将外来抗原递呈给T淋巴细胞,使之激活,...
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- MC1R基因的研究进展被引量：22
- 2017年
- MC1R基因作为控制毛色的重要候选基因之一,不仅在黑色素合成过程中起着重要的调控作用,参与毛色的形成,还对人畜疾病、生长性状、行为有着不同程度的影响,因而引起相关学者的广泛关注。为加深对MC1R基因的认识和了解,作者对MC1R基因结构、功能、作用机理、基因的定位、多态性检测及其在人畜方面的研究进展进行综述,并提出新的设想。
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- 关键词：MC1R基因毛色
- 黔北麻羊DKK1基因CDS区及部分内含子的多态性与生物信息学分析被引量：1
- 2018年
- 【目的】为黔北麻羊种质资源的综合开发利用提供参考。【方法】应用DNA池结合PCR产物直接测序方法检测黔北麻羊DKK1基因CDS区及部分内含子的多态性,应用生物信息学方法对黔北麻羊DKK1基因的蛋白特性进行预测和分析。【结果】在黔北麻羊的DKK1基因CDS区及部分内含子序列中筛选出8个SNP位点,分别为第1内含子C1626T位点,第3内含子A3083G位点,编码区的T3000C、T3228C、T3238C、G3240A、T3271A和T3411C位点。其中,T3271A为错义突变,导致半胱氨酸(Cys)变为丝氨酸(Ser),其他编码区的SNP位点均为同义突变。DKK1基因的CDS区包含有1条长789 bp的核苷酸序列,编码262个氨基酸,蛋白分子量为28 349.17 D;DKK1基因编码的整个多肽链表现为亲水性,并具有信号肽序列,剪切位点最有可能位于第31~32位氨基酸,在第15~37位氨基酸间存在1个典型的跨膜结构域;其二级结构主要由α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲组成,属于mixed型蛋白;黔北麻羊DKK1基因编码的氨基酸与普通山羊、绵羊和牛等物种均具有较高同源性,基因系统进化情况与其亲缘关系基本一致。【结论】DKK1基因在进化上较保守,其可作为动物骨骼生长发育研究和相关疾病鉴定的重要候选基因。
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- 关键词：黔北麻羊多态性生物信息学
- 组合捕收剂LG-01反浮选贵州某碳酸盐磷矿被引量：6
- 2012年
- 用实验室合成的一种含羟基、羧基及硫酸酯基团的阴离子捕收剂LSMFS,与一种廉价脂肪酸皂组合复配出一种新型碳酸盐磷矿捕收剂LG-01,以P2O5品位为25.31%的贵州某碳酸盐磷矿为对象进行了反浮选效果研究,并用IR分析法探讨了组合捕收剂的主要成分分别与碳酸盐磷矿表面的作用机理。试验表明,组合捕收剂LG-01是一种来源广泛、价格低廉、对温度不敏感的低毒、高效捕收剂,1次粗选即可获得P2O5品位为34.79%、回收率为90.64%、含MgO 1.01%的优质磷精矿。
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- 关键词：反浮选
- 黔北麻羊TYR基因多态性及生物信息学分析被引量：4
- 2018年
- 为研究黔北麻羊毛色形成的遗传机制,本实验对黔北麻羊哺乳动物酪氨酸酶(TYR)基因外显子区域运用混合DNA池结合PCR产物直接测序方法进行多态性分析,在TYR基因外显子区域共筛选出5个SNPs,分别为Exon1-G617A、Exon1-G685T、Exon3-C1236T(Asn-Lys)、Exon5-C1578T(Gly-Glu)、Exon5-T1862C;进而利用生物信息学分析软件对PCR扩增所获序列进行m RNA二级结构及蛋白质二级结构和三级结构分析,发现Exon3-C1236T(Asn-Lys)、Exon5-C1578T(Gly-Glu)引起m RNA二级结构的改变,其中Exon1-G685T、Exon3-C1236T(Asn-Lys)、Exon5-T1862C突变导致其m RNA二级结构最小自由能增大,即二级结构稳定性降低,其错义突变位点Exon3-C1236T(Asn-Lys)、Exon5-C1578T(Gly-Glu)均引起蛋白质二级结构和三级结构的改变。
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- 关键词：黔北麻羊SNPS生物信息学
- 贵州白山羊DRA和DRB1基因的表达差异分析被引量：2
- 2016年
- 本研究旨在利用实时荧光定量PCR技术检测贵州白山羊DRA和DRB1基因在心、肝、肾以及免疫组织共9种动物组织中的相对表达差异。分析数据得到,贵州白山羊DRA、DRB1基因在9种组织中均有表达,在脾组织中两个基因的表达量均明显高于其他组织,在心、肝、肾和颌下腺四中组织中DRA和DRB1基因的表达量均明显低于其他组织,其中在心和肝两种组织中表达量最低。结果表明,在5种免疫组织中除颌下腺外,DRA和DRB1基因的表达量都较高且都在脾脏组织中高表达。
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- 关键词：贵州白山羊荧光定量PCRDRADRB1
- 贵州黑山羊和黔北麻羊LEPR基因第7、8、10和18外显子的多态性分析
- 2016年
- 为探究LEPR基因的遗传多态性,丰富山羊LEPR基因的研究,本研究以贵州黑山羊和黔北麻羊为试验材料,运用DNA池结合直接测序方法进行LEPR基因SNPs位点的筛选,从而对突变的SNPs位点进行RNA二级结构以及所编码蛋白质的二级结构和三级结构进行生物信息学分析。在试羊LEPR基因中共发现4个SNPs,分别为Exon7-T81C(同义突变)、Exon8-C39T(同义突变)、Exon10-A70G(Asn-Ser)和Exon18-C94T(Ser-Leu)。分析表明,4个位点突变前后的等位基因频率、mRNA二级结构的最小自由能、LEPR蛋白质二级结构和三级结构均有改变。结果表明,LEPR基因拥有较为丰富的遗传多态性。
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- 关键词：SNPS贵州黑山羊黔北麻羊生物信息学
- 贵州白山羊和贵州黑山羊DRB1基因第3外显子遗传变异分析
- <正>引言/目的 DRB1基因是位于MHC复合体的第Ⅱ区DR家族B类基因座上,有丰富的多态性。MHC的表达产物是MHC抗原,主要参与体内抗原递呈,与外来抗原结合形成复合体,T淋巴细胞识别后将外来抗原递呈给T淋巴细胞,使之...
- 徐伟黄兰封竣淇康建兵钱成蔡惠芬罗卫星
- 关键词：白山羊黑山羊DRB1基因
- 文献传递
- 贵州地方山羊DRA基因Exon5的多态性分析
- 2016年
- 本研究通过构建3个贵州地方山羊品种的DNA池,并对其MHC-DRA基因第5外显子进行SNPs位点的筛选和生物信息学分析,以丰富山羊抗病育种的基础理论资料。分析发现,在3个山羊品种的DRA基因Exon5中发现两个共同突变位点,分别是C^(172)T和T^(176)G,而贵州白山羊中多一个突变位点G^(205)A;生物信息学分析发现,C^(172)T和G^(205)A位点均引起RNA二级结构和最小自由能的改变。结果表明贵州地方山羊DRA基因具有较丰富的遗传多样性。
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- 关键词：贵州山羊SNPS生物信息学
