汪亚玲
- 作品数:1 被引量:0H指数:0
- 供职机构:南通大学更多>>
- 发文基金:江苏省高校自然科学研究项目江苏省博士后科研资助计划项目博士科研启动基金更多>>
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- 盐碱胁迫下玉米EST数据库对比分析
- 2016年
- 提取了盐碱胁迫处理的玉米YQ7-96品系3叶1心期的叶茎混合组织总RNA,运用SMART技术构建p DNR-LIB载体的cDNA文库,并随机挑选克隆进行EST序列的Blast X比对和MIPS归类分析。结果发现,在随机挑取的2个4 000个cDNA克隆测序中,95.0%的EST符合分析要求(长度大于150 bp,非rRNA),共获得3 217条拥有Blast X注释信息的EST序列,盐碱胁迫的EST数据库归类的比例信息比较接近。其中维持正常生理活动占比分别为50.63%(盐胁迫)和52.79%(碱胁迫),参与细胞内运输、细胞内信号传导、细胞防御和细胞循环和DNA代谢过程的基因分别为22.05%(盐胁迫)、19.03%(碱胁迫),参与能量代谢和转录相关的基因分别为15.77%(盐胁迫)、15.36%(碱胁迫)。本研究构建的盐碱胁迫下玉米cDNA文库及相关基因表达分析结果,为后续研究提供了基础数据。
- 周鸣鸣王顺汪亚玲蔡洪玉李德全谈蓉赵德兵俞晨豆长明张洁
- 关键词:玉米盐胁迫碱胁迫EST