穆彩琴
- 作品数：4 被引量：12H指数：2
- 供职机构：山西农业大学更多>>
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- 相关领域：农业科学更多>>
- 谷子突变体110-2-5早抽穗机制的研究
- 抽穗开花是高等植物生长发育的重要过程。谷子是营养价值极高的二倍体植物。目前有关谷子抽穗开花途径的报道鲜少,增加谷子产量备受关注。本研究采用甲基磺酸乙酯（EMS）化学诱变晋谷21得到矮杆、早熟突变体110-2-5,并对其进...
- 穆彩琴
- 关键词：谷子热激蛋白水稻
- 高等植物抽穗开花调控的分子网络被引量：3
- 2016年
- 抽穗开花是高等植物从营养生长向生殖生长转变的过程,该过程受到众多基因的调控,这些基因又相互作用形成了一个复杂的调控网络。综述了近年来模式植物拟南芥和水稻抽穗开花调控分子机制的研究进展,重点介绍了植物抽穗开花调控的光周期途径、赤霉素途径、自主途径和春化途径,比较了这些途径在拟南芥和水稻中的异同。最后,结合作者对谷子抽穗开花调控分子机制的研究,探讨了未来的研究方向。
- 穆彩琴张瑞娟屈聪玲齐晓米怡杨致荣
- 关键词：植物拟南芥水稻
- 谷子CO家族基因的全基因组鉴定与分析被引量：2
- 2016年
- 抽穗开花是高等植物从营养生长向生殖生长转变的过程,该过程受到众多基因的调控。CONSTANS(CO)是光周期开花途径中的一个关键基因,是生物节律钟基因和开花基因之间的关键枢纽。利用生物信息学的方法,从谷子基因组中鉴定了34个CO基因;与拟南芥CO家族的17个成员进行同源比对,发现Seita.7G007800与Seita.9G020100相似性最高;在此基础上,分析了谷子CO基因的启动子,发现启动子有光响应元件Sp1、脱落酸响应元件ABRE以及赤霉素响应元件P-box等;RNA-Seq转录组测序发现,这些CO基因在叶片中表达量存在显著差异,其中,Seita.4G192300基因表达量最高,而Seita.1G304900,Seita.3G080700和Seita.4G001600这3个基因在叶片中不表达。这些结果不仅为深入研究CO基因与抽穗开花的关系提供依据,而且为后续谷子抽穗开花途径的研究奠定理论基础。
- 穆彩琴屈聪玲张瑞娟李燕杨致荣
- 关键词：谷子全基因组CONSTANS抽穗开花
- 基于RNA-Seq技术的谷子新基因发掘及基因结构优化被引量：7
- 2016年
- 尽管谷子(Setaria italica)全基因组序列图谱已经公布,但其基因注释很不完善。为此,本文应用RNA-Seq技术开展了谷子新基因发掘和已注释基因结构优化工作。以‘晋谷21’谷子叶片为材料提取总RNA,构建测序文库并利用Illumina HiSeq2500测序平台进行双端测序,最终获得37 072 949条高质量的干净读段(clean reads)。将其进一步与‘豫谷1号’谷子参考基因组进行序列比对,鉴定出614个新基因。在此基础上,利用COG、GO、KEGG、Swiss-Prot和NR等数据库对其进行了功能注释,获得了438个新基因的注释信息。此外,还优化了7 175个已注释基因的结构,延伸了4 330个基因的5′端和5 362个基因的3′端。本研究旨在为后续谷子功能基因组学研究和其他生物基因组注释信息的完善提供有益的借鉴。
- 穆彩琴张瑞娟屈聪玲韩渊怀王兴春杨致荣
- 关键词：谷子RNA-SEQ转录组
