苏志磊
- 作品数：4 被引量：41H指数：4
- 供职机构：青岛市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：青岛市公共领域科技支撑计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 2013—2014年青岛市柯萨奇病毒B5型手足口病病原学及重症病例临床特征被引量：14
- 2018年
- 目的分析青岛市感染萨奇病毒B5（CV-B5）手足口病病例的分子特征及其所致重症病例的临床特征。方法以2013--2014年青岛市妇女儿童医院常规监测的手足口病病例为研究对象，共1844例，收集其咽拭子标本和脑脊液标本；采用回顾性研究的方法，收集研究对象的临床资料。对标本进行病毒核酸提取和分型鉴定；采用RT．PCR对CV-B5病毒株进行VPI基因全长扩增，并进行序列测定。采用MEGA7．0软件进行系统进化分析及分子特征分析；并与原型株Faulkner毒株进行比较，其VPl氨基酸序列来源于GenBank数据库。结果共获得CV．B5阳性病例8例，其中男性4例，女性4例；住院重症病例6例，门诊病例2例。6例重症住院病例的年龄为3-48月龄，中位数为26月龄，临床症状以发热、抽搐、呕吐、腹泻、皮疹为主，均合并病毒性脑炎。在VPl区，8株CV-B5病毒株与原型株核苷酸同源性和氨基酸同源性分别为77-3％-78．8％和95．5％-97．0％，氨基酸有13处变异，6株分离自重症病例毒株中有5株在VPl区发生N95S变异；在VPl进化树上，8株CV-B5病毒株全部属于D基因亚型，与同期国内其他地方毒株成一簇。结论感染CV-B5所致重症手足口病可出现神经系统受累，主要的并发症为病毒性脑炎；CV．B5毒株在VPl区核苷酸和氨基酸变异较小，呈现一定的区域聚集性。
- 梁荣香史晓燕张艳辉苏志磊张凤柴青宫金伶汪照国
- 关键词：手足口病中枢神经系统
- 青岛地区2012—2014年甲型H1N1流感病毒基因特征被引量：10
- 2016年
- 目的了解2012—2014年山东省青岛地区人群甲型H1N1流行性感冒(流感)病毒流行株基因特征及变异趋势。方法收集2012年4月—2014年3月青岛地区流感样病例咽试子2 100份,分离鉴定136株,随机抽取51株,应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增血凝素(HA)、神经氨酸酶(NA)、基质蛋白(MP)3个基因片段全长,并进行序列测定,对各基因片段进行系统发育分析及基因和氨基酸位点变异分析。结果 HA、NA进化树分析发现,2012—2014年青岛地区流行的甲型H1N1流感病毒分为3个分支;HA蛋白的氨基酸位点分析显示,部分毒株在抗原决定位点,受体结合位点以及其他位点上发生一定程度的变异,涉及15个氨基酸位点变化;NA蛋白的氨基酸位点分析显示,与疫苗株比较有10处氨基酸位点发生了明显变异;M2蛋白分析显示所有毒株均对金刚烷胺类药物耐药。结论 2012—2014年青岛地区流行的甲型H1N1流感病毒在抗原和受体结合位点均发生基因变异及抗药毒株的出现对流感防控提出更大的挑战。
- 赵丹苏志磊于萍柴青宫金伶史晓燕汪照国
- 关键词：HA基因NA基因基因特征
- 2009-2015年青岛市手足口病病原中柯萨奇病毒A4型VP1区基因特征分析被引量：10
- 2017年
- 目的阐明2009-2015年引起青岛市手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)的病原之一柯萨奇病毒A4型(CV-A4)VP1编码区的基因特征。方法用荧光RT-PCR法对青岛市2009-2015年HFMD患者的咽拭子标本进行总肠道病毒(EV)、柯萨奇病毒A16(CV-A16)型和肠道病毒71(EVA71)型检测,以半巢式反转录PCR扩增非EV-A71,非CV-A16型肠道病毒VP1区部分基因序列,结合序列分析鉴定CV-A4血清型。对全部CV-A4阳性分离株进行VP1基因全长序列扩增及基因序列测定。用MEGA 5.0软件进行遗传进化及分子特征分析。结果青岛市2009-2015年7 967份HFMD患者的咽拭子标本中共分离到CV-A4 39株,分别占各年度肠道病毒总构成比的0.18%(1/541)、0.21%(2/944)、0.29%(2/681)、1.37%(4/292)、2.25%(12/534)、0.75%(7/928)和1.86%(11/591)。遗传进化分析显示,94.87%(37/39)的青岛地区CV-A4分离株位于C2b亚型,5.13%(2/39)位于C1亚型;青岛C2b亚型病毒株VP1区核苷酸一致性为90.7%~100.0%,氨基酸一致性为96.9%~100.0%。结论 CVA4不是引起HFMD的优势病原,C2b亚型毒株是青岛市CV-A4的优势流行株,同时伴有C1亚型毒株的流行。
- 史晓燕汪照国宫金伶柴青赵丹苏志磊张凤高汝钦
- 关键词：手足口病遗传进化分析
- 青岛市2015年成人散发腹泻病例诺如病毒感染分子流行病学特征被引量：7
- 2017年
- 目的 了解青岛市2015年成人散发腹泻病例中诺如病毒（Norovirus, NoV）感染的分子流行病学特征.方法 收集2015年5月至12月间青岛市成人散发腹泻病例粪便标本409份,Real-time RT-PCR进行NoV检测,应用RT-PCR扩增NoV ORF1和ORF2部分基因片段,并进行序列测定和系统进化分析.结果 NoV检测阳性率为18.1%（74/409）,其中GⅠ 10份,GⅡ 64份.53份GⅡ被成功测序,分成4个基因型,分别是GⅡ.Pe-GⅡ.4（26/53）、GⅡ.P17-GⅡ.17（19/53）、GⅡ.P12-GⅡ.3（7/53）和GⅡ.P16-GⅡ.13（1/53）.GⅡ.Pe-GⅡ.4全部为GⅡ.4-Sydney-2012变异株.2015年5月至8月,GⅡ.4 只占 5.3%（1/19）,GⅡ.17是最主要的流行株（68.4%,13/19）.而2015年9月至12月,GⅡ.17减少至10.9%（6/55）,GⅡ.4成为最主要的流行株,增加至45.5%（25/55）.结论 NoV是成人病毒性腹泻的重要病原体.GⅡ.4-Sydney-2012和新变异株GⅡ.P17-GⅡ.17是2015年青岛市成人散发腹泻病例中NoV的主要流行株.
- 赵丹苏志磊张凤史晓燕汪照国
- 关键词：诺如病毒基因型分子流行病学
