杨茗羽
- 作品数：6 被引量：13H指数：1
- 供职机构：四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生理学更多>>
- 藏酋猴和恒河猴血液DNA甲基化组学研究
- 猕猴属各物种间广泛存在的杂交事件,以及与人类很近的亲缘关系,使得猕猴成为研究物种分化、基因交流等的良好模式生物和重要的医学模式动物.对基因组的研究使人们意识到表观遗传特别是DNA甲基化对生物性状的重要作用,全基因组重亚硫...
- 严超超杨茗羽岳碧松范振鑫
- 关键词：藏酋猴恒河猴血液
- 大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)血液microRNA的初步研究
- microRNA是小的非编码RNA,是许多生理过程的重要调控者.近年来许多研究表明microRNA在动物免疫、疾病发生和衰老中具有重要调解作用.大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)属于国家一级保护动物,...
- 杨茗羽杜联名李午佼沈富军范振鑫简作义侯蓉岳碧松张修月
- 关键词：大熊猫MICRORNA免疫
- 德国小蠊全基因组中微卫星分布规律被引量：13
- 2015年
- 【目的】分析德国小蠊Blattella germanica全基因组中微卫星的数量和分布规律,并对外显子中含有微卫星的基因进行功能注释。【方法】使用微卫星搜索软件查找德国小蠊基因组中微卫星的数量、重复次数以及所有微卫星的位置信息,编写Python脚本对微卫星进行定位,并通过Blast2Go和KASS程序对外显子中含有微卫星的基因进行功能注释。【结果】共找到1~6碱基重复类型的微卫星序列604 386个,总长度15 301 255 bp,约占全基因组序列(约2.04 Gb)的0.75%,分布频率为1/3.37 kb,微卫星序列的长度主要在12~60个碱基长度范围内。不同类型的微卫星中,三碱基(226 876)重复类型微卫星数量最多,占微卫星总数的37.54%;四碱基(150 355)重复类型次之,占微卫星总数的24.88%;其余依次是单碱基(141 167)、二碱基(60 877)、五碱基(21 570)和六碱基(3 541)重复类型,分别占微卫星总数的23.36%,10.07%,3.57%和0.59%。出现最多的重复拷贝类别有:ATT,AAT,A,T,AAAT,ATTT和AT,共411 789个微卫星,占微卫星总数的68.13%,这7种类别的微卫星数量均大于30 000个。共有2 372个微卫星在外显子上,它们分别位于1 481个基因上。GO功能注释结果表明,其中434条归类于细胞组分(cellular component),402条归类于分子功能(molecular function),660条归类于生物学过程(biological process)。KEGG通路分析结果表明,与新陈代谢相关的基因最多(380个),其次是与机体系统相关的(276个),与遗传信息进程相关的基因最少(92个)。【结论】本研究为进一步系统深入分析德国小蠊微卫星功能及微卫星分子标记筛选打下了基础。
- 王晨杜联明李鹏杨茗羽李午佼沈咏梅张修月岳碧松
- 关键词：德国小蠊微卫星生物信息学功能注释基因组外显子
- 大熊猫血液microRNA的初步研究
- microRNA是小的非编码RNA,是许多生理过程的重要调控者。近年来许多研究表明microRNA在动物免疫、疾病发生和衰老中具有重要调解作用。大熊猫Ailuropoda melanoleuca属于国家一级保护动物,尽管...
- 杨茗羽杜联名李午佼沈富军范振鑫简作义侯蓉岳碧松张修月
- 关键词：大熊猫MICRORNA免疫
- 文献传递
- 在熊猫血液中与年龄相关的microRNA的差异性表达
- 大熊猫基因组早已组装完成,但是还没有关于其microRNA的研究报道.最近有研究表明,microRNA 表达量的改变与年龄及相关疾病有关,比如人类癌症和心血管疾病.本研究通过Solexa深度测序技术测序了四只不同年龄不同...
- 杨茗羽杜联明范振鑫张修月岳碧松
- 关键词：年龄
- 大熊猫血液转录组分析
- 大熊猫Ailuropoda melanoleuca 是我国特有珍稀濒危动物,目前野生大熊猫仅有2500-3000只。大熊猫全基因组已测序完毕,预测了2万多个基因。然而大熊猫至今没有转录组数据,NCBI dbEST数据库中...
- 杜联明李午佼沈福军杨茗羽范振鑫汪自立简佐义侯蓉岳碧松张修月
- 关键词：大熊猫转录组免疫基因注释选择性剪接
