何连花
- 作品数：6 被引量：3H指数：1
- 供职机构：中国科学院计算机网络信息中心更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术理学更多>>
- 高性能计算数值模拟框架软件研究进展被引量：2
- 2021年
- 【背景】本世纪我国超级计算机得到迅速发展,为降低面向超级计算机并行编程难度,高性能编程框架已经成为高性能计算的研究方向之一。【方法】本文简要介绍了高性能数值模拟编程框架的研究目的,主要关注国内外结构网格和非结构网格编程框架的发展现状。【结论】面向E级计算机即将到来,框架软件的发展也需针对E级计算机的体系结构特征,调整底层数据结构和核心算法,提升并行可扩展性,增强对异构众核计算的支持,使其能具备支撑开发E级并行计算应用软件的能力。同时也需要结合领域专家的需求,不断拓展新领域新方向,针对新问题开发新的功能模块,以便应用到更多的科学计算领域。
- 何连花赵莲姜金荣金钟
- 关键词：编程框架数值模拟
- 基于Intel MIC平台大规模耗散粒子动力学模拟的设计与优化
- 2017年
- 耗散粒子动力学(DPD)模拟是一种重要的研究流体动力学特性的计算模拟方法,基于Intel MIC平台设计实现了面向大规模耗散粒子动力学模拟,充分结合了DPD模拟本身的特性和MIC平台的特征。对DPD模拟中的近邻列表构建和短程作用力关键代码实现了向量化优化,在CPU和MIC协处理器之间采用任务计算负载平衡机制,支持MPI进程内线程数量负载平衡控制。分别在原型程序上和LAMMPS集成中做了性能对比分析,实验结果显示了引入相关优化技术的有效性,为进一步研究面向MIC众核平台的分子动力学相关工作奠定了基础。
- 徐顺刘倩张宝花何连花金钟
- 关键词：耗散粒子动力学图像处理单元分子动力学
- 半线性椭圆问题的自适应有限元分析
- 2016年
- 本文既不利用非线性问题的单调性,也不利用有限元逼近的一致有界性进行半线性椭圆问题的自适应有限元分析.本文先推导有限元逼近解的先验和后验误差估计,然后,利用这些估计,分析一类自适应有限元算法,特别是,得到该算法的收敛率和复杂度.
- 何连花周爱辉
- 关键词：自适应有限元收敛性复杂度半线性
- 第一性原理软件北京原子技术模拟工具包的重构进展被引量：1
- 2020年
- 基于第一性原理的理论方法的研究,代表了材料计算、分子模拟等领域的科学高地,相应的第一性原理计算软件直接关系到该领域相关理论、算法的积累.本文汇报了我们在重构第一性原理计算模拟软件—北京原子技术模拟工具包(BSTATE)的一些最新进展.重构的核心思想是降低用户使用门槛、扩展软件适用范围、增加软件对于流行计算框架的支持.基于此思路,在BSTATE原有Makefile编译系统的基础上添加了CMake编译环境,并支持各种数学函数库的自动和交互式配置;通过在原有内置泛函基础上增添Libxc泛函库的支持,使BSTATE支持的泛函数量有了数量级上的增长;分析测试BSTATE在集群的并行特点,并以更新数学库接口(FFTW3、Cufftw)的形式提供对于流行异构框架的初步支持.
- 马英晋张坦何连花金钟
- 关键词：密度泛函理论
- 基于国家高性能计算环境的生物医药应用服务社区的移动端服务开发
- 2019年
- 基于国家高性能计算环境的生物医药应用服务社区旨在推进高性能计算在生物信息和药物研发领域的应用服务,便于生物医药从业者更好地利用日渐丰富的高性能计算资源并降低其使用门槛。社区在稳定运行的基础上,设计开发了移动端应用服务,用户可以随时随地了解社区和自有计算服务的最新动态。
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- 面向E级计算的线性代数解法器研究综述
- 2023年
- 基于E级计算的科学工程计算应用给数值线性代数算法的发展,既提供了更多机遇,又带来了更大挑战。首先分析了E级计算的特点,包括:针对大规模异构并行体系结构的并行编程成为主流方式;降低运行大规模应用带来的极高能耗成本成为了主要考虑问题;多精度的异构计算硬件引发了混合精度算法进一步的研发。其次综述了主流稠密及稀疏线性代数解法器面向高性能计算体系架构进行的功能及性能方面的优化工作,对比分析了各解法器的特点及优势。随后总结分析了线性代数解法器核心技术进展,主要包括:隔离异构计算模块和设计新的统一编程框架,以实现软件算法的性能可移植;在保证科学工程计算应用的整体需求之下,利用混合精度方法提升数值计算和数据存储的性能水平;结合硬件多级cache和网络通讯特征发展先进并行计算算法,避免或减少效率低下的大规模数据通讯。最后对未来研究进行了展望。
- 何连花徐顺金钟
