王凤华 作品数:4 被引量:7 H指数:1 供职机构: 湖南师范大学生命科学学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 湖南省重点学科建设项目 国家自然科学基金创新研究群体项目 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 医药卫生 更多>>
利用尼罗罗非鱼EST序列筛选免疫抗病相关基因及多态性分析 2012年 利用生物信息学方法对尼罗罗非鱼ESTs序列进行基因功能注释和免疫抗病基因筛选。研究结果表明,在120991条EST序列中有60852(50.29%)条与已知的斑马鱼蛋白质相匹配,共获得11157个基因,分属于22个生物学功能。其中32个免疫抗病基因中补体因子和趋化因子相关基因有15个基因,占46.88%。结合运用生物信息学软件对补体因子和趋化因子进行多态性SNP分析,共发现8个基因中的140个SNP位点。其中补体c2基因的突变率最高,达7.57%。提示这些基因有较快的进化速率。本文为今后利用公共数据库中ESTs序列分析SNP位点,建立免疫抗病分子标记提供了新的思路。 王凤华 冯浩 周毅 钟欢关键词:表达序列标签 单核苷酸多态性 拟南芥HMGs家族成员全基因组分析 被引量:7 2012年 高迁移率族蛋白是一种非组蛋白染色体蛋白质。文中通过生物信息学的方法鉴定到17个HMGs家族基因,利用在线工具分析了HMGs家族基因的组成以及染色体定位信息,利用Clustal-W以及MEGA4.0软件构建了拟南芥HMGs家族的系统发育树,利用通过查询基因芯片结果分析了该家族基因的不同组织部位的表达情况,并推测了部分基因的功能,为进一步研究HMGs家族基因的功能提供了参考。 王凤华 刘文锋关键词:全基因组 基因芯片 异源四倍体鲫鲤及亲本ApoE的克隆及组织表达分析 2012年 载脂蛋白E(Apolipoprotein E,ApoE)作为胆固醇代谢过程中的关键因子,参与脂蛋白转运和性腺发育。为进一步了解该基因的作用,本实验克隆并测序了异源四倍体鲫鲤及其父母本ApoE基因的全长序列。异源四倍体鲫鲤、红鲫和鲤的ApoE全长分别为1393 bp、1384 bp和1396 bp,均编码281个氨基酸。序列对比表明,异源四倍体鲫鲤ApoE与父本鲤更为相似。另外有2个氨基酸位点发生了与父母本均不同的变异,证明异源四倍体鲫鲤除了有杂交特征外也产生了变异。通过Mega软件构建的哺乳动物ApoE进化树与系统分类相一致:鲤科鱼类的ApoE聚类在一起而分离于其它物种。Real time PCR分析表明,ApoE基因在3种鱼中的组织表达模式基本一致,所有组织均有表达,而在脾脏中表达最高。 王凤华 周毅 刘少军 钟欢 张纯 陶敏 刘筠关键词:异源四倍体鲫鲤 红鲫 载脂蛋白 高迁移率族蛋白B1与肝功能的关系 2012年 高迁移率族蛋白B1(high mobility group box-1protein,HMGB1,NP_002119)是普遍存在于真核细胞核内且与非组蛋白染色体相结合的蛋白,因为在聚丙烯酰胺凝胶电泳中迁移速度很快而得名[1]。HMGB1是维持生命活动所必需的蛋白,敲除小鼠的HMGB1基因后,其在出生后不久便死亡[2]。近年来发现HMGB1是一种晚期炎性因子[3],其可释放到胞外作为一种重要的信号因子参与细胞分化、 王凤华 刘文锋关键词:高迁移率族蛋白B1 肝功能 聚丙烯酰胺凝胶电泳 HMGB1 非组蛋白 细胞核内