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叶丽丽
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1
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供职机构:
北京交通大学理学院生命科学与生物工程研究院
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相关领域:
生物学
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合作作者
魏婷
北京交通大学理学院生命科学与生...
韩光春
中国科学院北京基因组研究所
宋福海
中国科学院北京基因组研究所
彭星
中国科学院北京基因组研究所
雷红星
中国科学院北京基因组研究所
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2016
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基于转录组数据分析小鼠心肌细胞直接重编程的分子机制
2016年
本研究旨在从分子水平揭示小鼠成纤维细胞直接重编程为心肌细胞的机制,为诱导心肌细胞再生提供新思路。在公共基因芯片数据库(GEO)中下载小鼠(Mus musculus)心肌细胞直接重编程相关的基因芯片数据,其中成纤维细胞样本数24例,诱导性心肌细胞样本数43例。利用统计软件R3.1.1采用Rankprod算法(p<0.05,|lg FC|>1)获得心肌细胞直接重编程过程中的差异表达基因,利用DAVID、Topp Gene和STRING等在线工具对差异表达基因进行生物信息学分析。最终分析筛选出210个心肌细胞直接重编程过程的差异表达基因,包括115个表达上调,95个表达下调。生物信息学分析发现Cybb、C1qa和Fabp4等基因以及横纹肌收缩等信号通路在心肌细胞直接重编程过程中起着重要作用。
叶丽丽
宋福海
彭星
韩光春
魏婷
纪丰民
雷红星
关键词:
心肌细胞
差异表达基因
基因芯片
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