乔清华 作品数:6 被引量:18 H指数:2 供职机构: 山东棉花研究中心 更多>> 发文基金: 国家现代农业产业技术体系建设项目 国家科技重大专项 更多>> 相关领域: 农业科学 更多>>
棉花不同发育时期根际微生物的动态变化 被引量:5 2019年 为了解棉花不同发育时期根际细菌和真菌的群落结构和多样性变化,对2个棉花栽培种——陆地棉和海岛棉不同发育时期的根际土壤及未种植棉花的对照土DNA进行16S和ITS扩增子测序与分析。结果表明:棉花各发育时期根际土中细菌和真菌的物种丰富度显著(P<0.05)小于对照土,根际土中的物种丰富度在蕾期最高。棉花苗期与蕾期根际细菌群落之间的差异菌群进化距离较远。聚类分析表明,变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、浮霉菌门(Planctomycetes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和疣微菌门(Verrucomicrobia)为棉花根际细菌的优势菌门,子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)和接合菌门(Zygomycota)为棉花根际真菌的优势菌门。此外,棉花根际细菌和真菌群落中相对丰度较对照显著(P<0.05)升高和降低的菌属在不同发育时期存在差异,其中,在根际土中相对丰度显著(P<0.05)升高的菌属在蕾期最多。 刘珊珊 韦鑫 盛福瑞 乔清华关键词:棉花 发育时期 根际 真菌 棉花根际真菌群落结构及其动态变化 大部分常见的棉花土传病是由真菌引起的,这些土传病的发病受多种因素影响。本研究利用二代测序技术对种植在多年棉花连作大田土和营养土中的棉花根际真菌在苗期、蕾期、花期的真菌群落结构变化进行研究,并且与未种植过棉花的2种土壤中3... 王芙蓉 乔清华 张景霞 陈煜 袁哲诚 王静静 张军关键词:棉花 根际 真菌 土壤类型 发育时期 基因型 文献传递 多年连作土壤中棉花根际细菌群落结构及其动态 被引量:12 2018年 【目的】了解多年连作土壤中棉花根际细菌群落结构和动态。【方法】利用高通量测序技术对多年棉花连作土中陆地棉品种TM-1(Gossypium hirsutum L.)不同发育时期的根际细菌16S r DNA进行扩增、测序并分析。【结果】多年棉花连作土中,棉花根际细菌的主导菌门为变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、浮霉菌门(Planctomycetes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)。受棉花根系影响相对丰度变化较大的菌门为4个主导菌门以及厚壁菌门(Firmicutes),其中酸杆菌门、拟杆菌门、浮霉菌门的相对丰度受到棉花根系的促进,而厚壁菌门、变形菌门的相对丰度受到抑制。不同发育时期棉花根际细菌α-多样性没有显著差异,但是根际细菌群落结构间存在显著差异,且在棉花花期与蕾期的差异显著高于蕾期与苗期的差异。多年棉花连作土壤中的根际细菌群落α-多样性显著高于非根际土壤,根际与非根际土壤中细菌β-多样性在棉花花期最大。【结论】确定了多年棉花连作土中棉花根际细菌的群落结构及其动态,发现棉花在花期对根际细菌群落结构的影响较大。 乔清华 张传云 袁哲诚 王芙蓉 张军关键词:棉花 群落结构 发育时期 根际细菌 一种植物组织培养用外植体切刀 本实用新型涉及一种植物组织培养用外植体切刀,包括金属柄、下胚轴切刀和子叶切刀;下胚轴切刀和子叶切刀分别设置在金属柄的两端;所述子叶切刀包括子叶底座和四个刀口方向一致的子叶刀片,四个子叶刀片依次连接形成矩形刀片框,子叶底座... 张景霞 张军 王芙蓉 张传云 刘国栋 陈煜 周娟 乔清华文献传递 棉花根际真菌群落结构及其动态变化 大部分常见的棉花土传病是由真菌引起的,这些土传病的发病受多种因素影响.本研究利用二代测序技术对种植在多年棉花连作大田土和营养土中的棉花根际真菌在苗期、蕾期、花期的真菌群落结构变化进行研究,并且与未种植过棉花的2种土壤中3... 王芙蓉 乔清华 张景霞 陈煜 袁哲诚 王静静 张军关键词:棉花 根际 真菌 土壤类型 发育时期 基因型 棉花茎端发育长链非编码RNA的鉴定及功能预测 被引量:1 2016年 长链非编码RNA(Long non-codingRNA,lncRNA)是一类长度在200 nt以上的非编码RNA。它不具备蛋白质编码功能,但在生物体中以RNA分子的形式参与众多生物过程。利用实验室前期获得的陆地棉茎尖转录组数据,鉴定了8044条lncRNA,其中3691条分布于At亚组,2852条分布于Dt亚组;通过基因组共定位、碱基互补配对等生物信息学方法对其中2227条lncRNA进行功能注释,其中1875条位于编码基因上下游,可能通过与编码基因的顺式作用元件或3’UTR区结合,在转录或者转录后水平调控基因表达;317条反义lncRNA与正义链的mRNA存在互作,通过碱基互补配对调控基因沉默、转录及mRNA的稳定性;20条lncRNA预测为microRNA的前体;5条lncRNA注释到4个lncRNA家族。功能注释表明,这些lncRNA主要参与转录调节、代谢、激素应答和信号转导等生物过程。本研究为充分利用高通量测序数据研究棉花lncRNA提供了新思路。 王芙蓉 乔清华 陈鹏云 袁哲诚 陈煜 樊守金 张军关键词:棉花 长链非编码RNA