- 3种RNA提取方法在血清丙型肝炎病毒RNA定量检测中的性能评价被引量：6
- 2009年
- 目的比较3种方法对血清HCV RNA的提取性能,并对其作方法学评价,揭示RNA提取技术对HCVRNA定量的影响。方法使用QIAamp Viral RNA Mini Kit(Q法),NucliSens miniMag系统(M法)和匹基(PG)丙型肝炎病毒定量试剂盒自带RNA提取方法(P法)进行血清HCV RNA提取,实时荧光RT PCR定量检测,对77例临床血清标本进行了提取检测,同时设计了方法学评价实验,从准确度,重复性,线性和灵敏度方面评价3种方法。结果77例临床标本的M、Q和P法阳性率分别是85.7%、84.4%和36.3%;25例共同阳性标本中,M和Q法的CT值分别比P法平均低7.5和9.35,表现出高于P法的提取效率和RNA质量;M和Q法的标准变异指数(S.D.I.)绝对值均<2,P法S.D.I.绝对值>2;M法平均CV为40.0%,Q法为71.0%,P法>100.0%;M法表现最佳的线性(R>0.99),M、Q和P法的最低检测限分别为39.4、394和3943 IU/ml。结论从提取效率和收获RNA质量上M和Q法远远优于P法,进一步方法性能表明,M法为HCV RNA定量最佳提取方法,而P法因其提取效率低、收获RNA质量差以及重复性不好,不适合临床HCV RNA定量试验。
- 张磊陆小军应斌武庄杰丁柳代波王军刘显中林立宋兴勃
- 关键词：RNA提取HCVRNA定量CT值
- 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌基因分型研究被引量：11
- 2008年
- 目的了解本地区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)流行株的来源和遗传背景。方法回顾分析华西医院127例MRSA感染者的病例资料,用SCCmec多重PCR技术、葡萄球菌A蛋白(spa)分型技术和多位点测序分型技术对其中10株MRSA临床分离株进行基因分型,并检测其杀白细胞毒素基因。结果病例资料显示127株MRSA中3株为社区获得性MRSA(CA-MRSA),其余均为医院获得性MRSA(HA-MRSA)。进行分型研究的10株MRSA中,7株HA-MRSA为SCCmec Ⅲ-ST239-PVL(-),呈现高度的克隆一致性,spa分型进一步显示4株为t030,另外3株为t037;CA-MRSAs19165分型为ST8-t008,与USA300属同一克隆,并且携带SCCmecⅣa和PVL基因,符合USA300一般基因特征。另外2株CA-MRSAs35301、s29635均为SCCmecⅣa-ST59-t437,与我国其他地区的报道不同。结论该院分离的MRSA仍以医院获得性为主(124/127),HA-MRSA呈现高度的克隆一致性,并与我国的主要流行株为同一克隆;分离到与美国主要CA-MRSA流行株USA300相同克隆的菌株,另外分离到的CA-MRSAST59-t437克隆株在我国其他地区未有报道。MLST和spa分型技术是金黄色葡萄球菌分子流行病学研究的更为简便快速的方法。
- 李囡范红陈慧莉谢轶陆小军张磊王军应斌武
- 关键词：耐甲氧西林金黄色葡萄球菌葡萄球菌A蛋白
