孙路
- 作品数：5 被引量：16H指数：3
- 供职机构：中国疾病预防控制中心传染病预防控制所更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 中国幽门螺杆菌基因组多样性与种群结构分析被引量：3
- 2016年
- 目的 了解中国幽门螺杆菌（Helicobacter pylori，HP）基因组特征及种群结构。方法 利用中国不同地域不同疾病分离的10株HP的基因组序列，并整合公共数据库中其他地域的HP基因组数据，通过比较基因组和生物信息学方法分析中国HP的基因组与种群结构特征。结果 中国HP核心基因为1 203个。菌株特异基因为19-32个，这些基因可能与中国HP在不同地域、不同疾病宿主中的适应性进化有关。基因组变异较大区域主要集中在编码限制修饰系统的基因和编码四型分泌系统的基因。基于核心基因组单核苷酸多态性（SNP）的种群分析确定中国菌株均属于hpEastAsia群，hspEAsia亚群，且不同地域菌株具有地域聚集性特点。在3株中国HP基因组序列中发现了前噬菌体序列，携带噬菌体组装所需的必要元件。结论 基于核心基因组SNP分析中国菌株均属于hpEastAsia群，hspEAsia亚群，且具有地域聚集性。为深入挖掘中国不同地域不同疾病相关HP的遗传特征及研究噬菌体在HP进化与致病中的作用奠定了基础。
- 尤元海何利华彭贤慧孙路张建中
- 关键词：幽门螺杆菌种群结构基因组
- 截短的BabA蛋白结合区(C51)具有促进幽门螺杆菌AGS细胞黏附作用被引量：1
- 2021年
- 目的获得能与Lewis b结合的截短的BabA结合域,并评价其对幽门螺杆菌黏附人胃腺癌上皮细胞系(AGS细胞)的影响。方法采用Swiss Model分析蛋白截短后的结构变化,克隆表达截短的BabA结合区蛋白,命名为C51,用Native-PAGE蛋白电泳法检测其是否为多聚体。用流式细胞术检测C51蛋白对J99和M523两株幽门螺杆菌黏附AGS细胞的影响,并用革兰染色观察C51蛋白对幽门螺杆菌聚集的影响。结果体外表达的C51蛋白以多聚体形式存在,该蛋白促进了J99和M523的聚集并使其与AGS的黏附分别增加了12%(t=8.211,P=0.001)和22%(t=4.402,P=0.012)。结论C51蛋白仍保持了与黏附相关的空间结构,并促进了幽门螺杆菌和AGS细胞的结合。
- 韩秀瑞范如岳何利华宫雅楠薛志静翟康乐杨雅名孙路尤元海赵飞范冬洁张建中
- 关键词：幽门螺杆菌黏附素
- 幽门螺杆菌克拉霉素异质性耐药及其特征分析被引量：7
- 2018年
- 目的对幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,HP)克拉霉素异质性耐药进行检测,并分析异质性耐药的遗传进化特征。方法对中国某医院50个^(13)C尿素呼气试验阳性患者的胃窦黏液标本进行HP分离培养,每个样本挑取16个HP单克隆(分离培养平板中不满16个克隆者选取全部HP克隆),用Etest法测定各克隆的克拉霉素最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)。进一步在异质性克拉霉素耐药病例中选取6份样本(MIC值差异较大的样本)相关的81个幽门螺杆菌克隆,利用多位点序列(MLST)分析的方法进行初步进化分析。结果 44个分离培养阳性的样本中24个全敏感,9个全耐药,11个为异质性耐药;6个MIC值差异较大的样本,最大值与最小值差别在100～1 000倍间。每个样本的9～16个克隆可分为1～6个ST型,结合vacA基因差异,分为2～8个基因型。遗传进化树显示2个样本的敏感、耐药克隆分为两簇,余4个样本中ST型与耐药间无明显关联。结论 HP在中国感染存在明显的克拉霉素异质性耐药现象,传统药敏试验可能不足以充分反映克拉霉素异质性耐药的现象,可能会引起误判,应高度关注。
- 孙路何利华张艺瑶张建中
- 关键词：幽门螺杆菌
- 低温冻存对幽门螺杆菌阿莫西林耐药表型的影响分析被引量：4
- 2019年
- 目的探讨低温冻存对耐阿莫西林(AMX)的幽门螺杆菌(Hp)阿莫西林耐药表型(AMXR)稳定性的影响。方法以国际标准菌株ATCC 43504及11株中国临床分离株作为出发菌株,经体外压力筛选传代50~60代后成功诱导AMXR,检测其最小抑菌浓度(MIC)。将获得的耐药克隆置-80℃冻存1~3个月后再复苏,比较冻存前后MIC的变化。药敏试验重复2~3次。结果共得到46个AMXR克隆(MIC≥0.5μg/ml)。经-80℃冻存后,其中19个(41.3%)克隆耐药水平显著下降,MIC变化最大者下降率在98%以上。这一变化在各地分离株具有普遍性,在不同耐药水平菌株之间具有差异性。结论AMXR耐药Hp经低温冻存后耐药性下降,且这一现象在高耐药菌株尤为明显。提示在临床上以冻存标本进行的Hp分离培养中,可能存在AMX耐药率和耐药水平的低估。
- 张艺瑶何利华胡源尤元海孙路韩秀瑞宫雅楠张建中
- 关键词：幽门螺杆菌阿莫西林冻存耐药
- 幽门螺杆菌分子伴侣GroEL相互作用蛋白分析被引量：1
- 2023年
- 【目的】获得幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,HP)GroEL结合蛋白质组构成谱,为进一步探究GroEL及其与相互作用蛋白在HP致病机制中的作用提供新思路。【方法】在构建HP GroEL原核表达重组大肠杆菌(Escherichia coli)BL21(DE3)pET-28a(+)-groEL基础上,纯化带有His标签的GroEL蛋白,与HP全菌蛋白提取液共孵育后,利用Protein G磁珠和抗His标签抗体免疫沉淀法对复合物进行捕获,然后对复合物中GroEL及其结合的蛋白质进行质谱法鉴定,根据主要功能对其进行分类,并完成蛋白质相互关系网络分析。【结果】对GroEL蛋白捕获成分进行分析,共鉴定出59种可能与GroEL结合的蛋白质,其中包括19种代谢酶类(KatA、GltA和AhpC等参与氧化还原相关酶类7种,PepA、RocF和HtrA等肽酶5种,以及2种参与脂肪代谢酶、2种参与ATP合成酶、2种尿素酶和HP17_08079蛋白等)、15种外膜蛋白(黏附素BabA、SabA、HapA及其他膜蛋白等)、8种转录翻译相关蛋白(Tuf、RpoBC等)、5种分子伴侣(DnaK、GroES等)、3种细胞毒素相关蛋白(CagA等)、3种氧化还原相关蛋白(TrxA等)、2种信号转导蛋白(TlpB、TlpD)和4种功能尚不明确蛋白。蛋白质相互关系网络分析发现,可形成多个分簇,并以GroEL为网络的中心节点。外膜蛋白,特别是重要黏附素BabA、SabA、HapA等与GroEL的广泛关联,提示GroEL可能在HP与宿主胃黏膜上皮细胞相互作用中发挥重要作用。【结论】HP中GroEL结合蛋白质谱广泛,功能涉及HP代谢、转录翻译、氧化还原和黏附等,并参与HP生存适应、定殖及致病过程。GroEL有望成为一种新的研究HP致病性及发展感染干预策略的重要靶点。
- 翟康乐宫雅楠肖迪孙路何利华房梦飏尤元海王磊闫笑梅张建中
- 关键词：幽门螺杆菌免疫共沉淀质谱
