康玲
- 作品数:17 被引量:17H指数:2
- 供职机构:大连东软信息学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术医药卫生自然科学总论更多>>
- 基于演化设计的遗传算法在分子对接中的应用被引量:4
- 2011年
- 将自然界的物种动态模型引入到遗传算法当中,反映出物种的真实进化状态,开发了基于演化设计的遗传算法。算法采用自适应策略克服了确定交叉和变异概率值的问题,利用小种群策略和最优保留策略保证了种群的多样性,改善了算法的寻优能力,进而提高了计算效率。运用该遗传算法求解分子对接优化模型,给出基于演化设计的分子对接程序。对接实例表明,算法能有效应用于分子对接问题中。
- 康玲王希诚
- 关键词:遗传算法分子对接
- 基于Q-learning和GA的多目标柔性作业车间调度自学习方法
- 本发明公开了基于Q‑learning和GA的多目标柔性作业车间调度自学习方法,采用分段编码规则,全局、局部和随机结合的机器选择方式初始化种群,采用基于Pareto支配关系的非劣解快速排序方法分配染色体解的适应度值,然后设...
- 常镜洳康玲张明会石冬凌彭钰莹邱谦
- 文献传递
- TOPCARES-CDIO引导的软件测试课程设计被引量:2
- 2016年
- 文章结合TOPCARES-CDIO工程教育理念引导的人才培养模式,探讨了软件测试课程的设计,提出了基于TOPCARE-CDIO工程教育模式的软件测试课程体设计,分别从课程目标和能力指标选择、课程内容及学时设计、教学组织形式、考核方式等方面进行了深入的分析和介绍,同时对课程的实践内容设计也进行了详细的介绍。T-C模式下的软件测试课程设计为软件测试人才培养提供了有利的指导,并为同行院校的课程建设提供了经验。
- 王法胜熊耀华康玲董悦丽任长宁
- 关键词:软件测试课程设计
- 基于Dueling架构深度强化学习的柔性作业车间实时调度方法
- 本发明公开了基于Dueling架构深度强化学习的柔性作业车间实时调度方法,包括构建工件随机抵达的DFJSP数学模型,设计柔性作业车间环境状态空间,车间环境状态空间包括车间加工机床总数、单位时间独立加工工件到达平均数、新插...
- 常镜洳康玲郑纯军石冬玲房颖
- 新药研发网格中药物分子的对接方法
- 建立药物分子优化的粗略和精细对接模型,通过最小化分子间的相互作用得到最优的药物分子取向和构型。粗略对接只考虑配体的柔性信息,将配体小分子的运动处理为平移、转动和柔性键旋转3部分,而受体为刚性;精细对接则是在粗略对接模型中...
- 李正夫康玲于坤千王希诚
- 关键词:新药研发网格网格计算药物分子设计
- 药物分子对接优化模型与算法研究
- 本文从数学规划角度研究药物分子对接问题,首先建立了柔性-刚性分子对接优化模型,即对接时将配体按柔性分子处理,而受体则按刚性分子处理。然后,引入残基基团和关键残基的概念,前者是将受体蛋白划分成若干基团,用各残基基团的运动近...
- 康玲
- 关键词:遗传算法药物分子设计
- 文献传递
- 一种精细药物分子对接模型和优化方法被引量:1
- 2008年
- 首先阐述了分子对接设计的基本原理,然后在蛋白质受体中引入关键残基的概念,建立了一个新的柔性分子对接模型.以配体的中心坐标以及它和受体关键残基的旋转键角为设计变量,以设计变量的尺寸为约束,通过最小化分子间相互作用能得到分子的最优取向和构象.一个自适应的遗传算法被用于求解上述优化模型,该算法采用多种群遗传策略、信息熵控制的空间减缩搜索技术以及拟精确罚函数方法,较好地平衡了效率与精度之间的关系,从而能够快速而稳定地逼近最优解.在此基础上,发展了新的精细分子对接程序,该程序可以进行受体与配体的柔性对接.药物分子对接实例证明,本文发展的精细药物分子对接算法和程序能够有效地用于药物分子设计.
- 康玲李洪林赵晓宇王希诚
- 关键词:分子对接
- 一种采用知识打分函数的分子对接方法被引量:1
- 2010年
- 分子对接是计算机辅助药物分子优化设计的重要组成部分.引入了一种通过计算原子对间距离来评价结合自由能的知识打分函数,其构造方法与平均力势能函数相似.同时采用基于信息熵的多种群自适应遗传算法,形成一种新型的分子对接程序KGAsDock.给出与著名的分子对接程序DOCK6.1的对接结果比较,数值实验表明,该算法在不降低计算效率的前提下,提高了对接的精度.
- 王希诚赵晓宇康玲李洪林
- 关键词:分子对接遗传算法
- 药物分子对接动态任务迁移优化
- 2015年
- 针对药物分子对接任务,基于传统动态任务迁移方法,提出了药物分子对接任务迁移优化策略。通过分析任务动态迁移涉及的各结点自身中断事件发生次数的数学期望和方差,得出了各结点的即时可靠性评价参数,选取可靠性高的目标结点机。在源结点和可靠的目标结点之间实施增量数据预迁移,缩短了停机拷贝时间。最后的实例测试表明,药物分子对接效率和可靠性得到了提高。
- 董悦丽郭权孙斌康玲
- 关键词:计算机系统结构计算机网络虚拟机分子对接配体受体
- 药物分子优化设计方法
- 虚拟筛选是创新药物研究的新方法,药物优化设计是虚拟筛选的重要组成部分。随着分子生物学、结构生物学、结构基因组、功能基因组学及蛋白质组学的发展,越来越多的生物大分子三维结构被测定,深刻地改变了药物研究与开发的思路和策略,最...
- 王希诚杨坤康玲
- 关键词:分子对接优化设计
- 文献传递