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瓜类褪绿黄化病毒新疆分离物基因组分析被引量：12: 2017年; 2016年秋季,新疆维吾尔自治区吐鲁番市哈密瓜大面积发生叶片黄化和褪绿的病害,症状呈瓜类褪绿黄化病毒(Cucurbit chlorotic yellows virus,CCYV)引起的典型特征。通过CCYV的特异性引物对该疑似样本进行了RT-PCR检测,获得了预期大小的扩增片段。随后,对新疆的CCYV分离物(CCYV-Xinjiang)全长基因组进行克隆并测序,获得了CCYV-Xinjiang分离物的RNA1和RNA2全长序列信息。对CCYV-Xinjiang和来自Gen Bank数据库的其他CCYV分离物的基因组序列分析,不同分离物RNA1和RNA2两条链的一致性分别是99.65%~99.93%和99.68%~99.89%。单独对基因组的各个非翻译区(UTRs)和编码区的核苷酸变异分析,数据表明不同区域其变异程度不同,其中RNA2的3'UTR区域变异最大,而RNA1的2个UTRs区域变异最小。对已登录Gen Bank的所有CCYV分离物基因组系统进化树分析结果表明,所有分离物聚在同一个组。另外,对来自Gen Bank的18个分离物的外壳蛋白(CP)氨基酸序列进行系统进化树分析,表明来自伊朗的3个分离物分在组2(GroupⅡ),而来自亚洲其他地区的分离物均被分到组1(GroupⅠ)。基于CCYV基因组的信息,发现来自亚洲地区的CCYV的群体遗传变异很小。; 彭斌刘莉铭刘珊珊张以和吉艳玲吴洋张学军古勤生; 关键词：甜瓜基因组

新疆、甘肃和河南部分地区甜瓜瓜类蚜传黄化病毒分子变异初步分析被引量：9: 2017年; 从新疆鄯善县、甘肃瓜州县和河南通许县采集表现瓜类蚜传黄化病毒(Cucurbit aphid-borne yellows virus,CABYV)症状的甜瓜叶片样品63份,利用反转录PCR(RT-PCR)检测,从阳性样品中选取25个分离物扩增出1.4 kb的片段,并对其序列进行分析。结果表明:63份样品中,36份为CABYV阳性;获得的序列包括部分3′端的依赖RNA的RNA聚合酶(RdRp)基因、非编码区(NCR)和全长外壳蛋白(CP)基因。随机选取25个分离物的CP基因与GenBank中的序列进行比对,其序列相似性为93.2%~100%。通许分离物间序列相似性为98.8%~99.8%,瓜州分离物间序列相似性为98.2%~100%,鄯善分离物间序列相似性为99.2%~100%,组内表现出极高的同源性。基于其部分RdRp基因、NCR及CP基因序列构建的系统进化树表明:25个CABYV分离物与中国及周边地区(泰国、韩国等)的分离物聚为一簇,而与欧洲地区分离物距离较远,说明了该病毒分子变异与分离物的地理分布有关。; 吴洋刘莉铭彭斌古勤生; 关键词：甜瓜分子多样性

河南、甘肃和新疆西瓜甜瓜病毒检测被引量：7: 2017年; 从河南、甘肃和新疆等3个地区采集表现疑似病毒病症状的西瓜和甜瓜叶片样品共132份,采用双抗体夹心酶联免疫吸附(DAS-ELISA)法和反转录PCR(RT-PCR)对其进行病毒检测,以期了解这3个地区的西瓜甜瓜病毒种类及分布,旨在为当地西瓜和甜瓜病毒病的防控提供参考。结果表明:瓜类蚜传黄化病毒(Cucurbit aphid-borne yellows virus,CABYV)的检出率最高,为57.1%,其次为小西葫芦黄花叶病毒(Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)和西瓜花叶病毒(Watermelon mosaic virus,WMV),检出率分别为45.6%、38.9%,黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)和甜瓜蚜传黄化病毒(Melon aphid-borne yellows virus,MABYV)的检出率较低,分别为20.0%、17.5%,而番木瓜环斑病毒西瓜株系(Papaya ring spot virus-watermelon strain,PRSV-W)和南瓜花叶病毒(Squash mosaic virus,Sq MV)未检出,河南和新疆发现MABYV尚属首次。本试验发现在河南通许危害西瓜甜瓜的病毒有ZYMV、WMV、CABYV、MABYV,在甘肃瓜州为ZYMV、CMV、CABYV,在新疆鄯善为ZYMV、WMV、CMV、CABYV、MABYV。其中21.2%的样品受到2种病毒的复合侵染。另外,3个地区的病毒优势种各不相同,鄯善县的优势种为CABYV,通许县的优势种是WMV,瓜州县的优势种是CMV。; 吴洋李俊香彭斌古勤生; 关键词：西瓜甜瓜病毒复合侵染

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吴洋