徐苗
- 作品数:6 被引量:24H指数:3
- 供职机构:新疆大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:环境科学与工程农业科学更多>>
- 邻苯二酚-2,3-双加氧酶基因在芘降解菌基因组的整合与表达被引量:1
- 2019年
- 为了构建能够稳定遗传且高效降解多环芳烃的工程菌,利用PCR技术对Pseudomonas songnenensis wp3-1的邻苯二酚-2, 3-双加氧酶(C23O)基因进行克隆,并将其与自杀性载体pUTmini-Tn5连接,得到重组载体pUTmini-Tn5-C23O。在三亲接合作用下,经mini-Tn5转座子将重组载体pUTmini-Tn5-C23O中的C23O基因整合到菌株Pseudomonas sp. wp4的染色体DNA中,最终得到基因工程菌wp4-C23O。在不同pH、温度下,菌株wp4和工程菌wp4-C23O对浓度为50 mg?L-1的芘进行降解7 d。2株菌降解最适温度为37℃、最适pH为7.5。在此条件下,工程菌wp4-C23O对芘降解率显著高于wp4菌株(P<0.05),降解率提高11.45%。以PAHs降解优势菌株为受体构建工程菌可以去除石油污染土壤中的PAHs。
- 赵亚光段魏魏徐苗吴盼云肖璐梅马腾飞晁群芳
- 关键词:基因工程菌
- 克拉玛依石油污染土壤微生物群落结构及其代谢特征被引量:8
- 2019年
- 为了分析克拉玛依油区内土壤中正构烷烃含量间的差异,微生物群落生理多样性、微生物代谢活性在不同石油污染梯度土壤中的变化规律。本研究采用GC、平板稀释法、Biolog微平板技术探讨了土壤微生物群落特征在3种不同污染程度下的变化情况。研究表明,石油污染土壤烷烃含量与微生物代谢活性呈显著负相关(r=-0.783, p<0.05)。随着石油污染程度增加微生物数量呈下降趋势,不同石油污染土壤中细菌数量占决定优势,细菌>真菌>放线菌。不同石油污染土壤微生物群落对6大碳源的利用体现出差异。主成分分析(PCA)表明,清洁土壤与石油污染土壤对底物利用有明显差异。石油污染严重土样碳源利用率为"酯类>酸类>胺类>氨基酸类>单糖/糖苷/聚合糖类>醇类"。本研究成果为后期修复污染土壤时调整投入的碳源底物等提供科学帮助。
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- 关键词:石油污染土壤微生物群落结构
- 克拉玛依石油污染土壤微生物类群及其代谢活性研究被引量:6
- 2017年
- 采用GC、平板稀释法、Biolog微平板技术研究了克拉玛依石油污染地区不同土层(0~15 cm、15~30 cm、30~45 cm)的土壤烷烃含量、微生物的群落变异情况和微生物代谢活性。结果表明:石油污染土壤烷烃含量高,其与细菌、真菌、放线菌数量分别呈显著负相关(r=-0.885,P<0.05)、负相关及极显著负相关(r=-0.948,P<0.01)。不同土层的清洁土壤和石油污染土壤中细菌、真菌、放线菌数量随深度增加呈递减趋势。不同土层清洁土壤受石油胁迫之后细菌、放线菌数量极显著减少(P<0.01),0~15 cm土层真菌数量增加极显著(P<0.01),15~30 cm、30~45 cm土层增加不显著(P>0.01)。不同土层清洁土壤微生物代谢活性极显著高于石油污染土壤(P<0.01),土壤微生物代谢活性随深度增加代谢活性降低。不同土层的清洁土壤和石油污染土壤微生物群落对六大碳源利用体现出差异。主成分分析(PCA)表明,不同土层的清洁土壤与石油污染土壤微生物群落对31种碳源利用在PC1方向有极显著差异(P<0.01),不同土层之间差异主要体现在PC2方向。综合PC1、PC2对碳源利用差异主要是I-赤藻糖醇、L-苏氨酸。
- 赵亚光段魏魏晁群芳梁建芳徐苗肖璐梅
- 关键词:石油污染土壤
- 响应面法优化芘降解菌的降解条件及降解基因分析
- 2017年
- 采用响应面法进行实验设计,选择p H值、温度、天数为影响因素,对芘浓度为50 mg/L无机盐培养基进行wp3-1菌株降解条件优化,得到了芘降解率与3种因素间的非线性回归方程,确定了降解芘的最优工艺条件:在温度为34.15?C,p H值为6.98,降解时间为4.28天时,预测芘的降解率为86.42%,实验验证值为85.70%,结果显示,建立的模型具有较高的精度.采用PCR技术克隆邻苯二酚-2,3-双加氧酶基因,生物信息学分析结果表明:C23O基因所编码的氨基酸序列具有双加氧酶基因保守结构域,编码的蛋白质也是一种稳定的酸性亲水蛋白质,分子量为35.01k D,等电点为5.45,二级结构由17%α-螺旋、36%β-折叠和45%的无规则卷曲组成,具有跨膜结构,不具有信号肽.三级结构预测结果与二级结构一致,三级结构有Fe2+结合位点.
- 晁群芳赵亚光吴盼云徐苗段魏魏肖路梅马腾飞
- 关键词:响应面法
- 一株产胞外邻苯二酚-2,3-双加氧酶菌种的筛选及鉴定被引量:3
- 2017年
- 为了筛选得到一株产胞外邻苯二酚-2,3-双加氧酶的芘降解菌株,以新疆克拉玛依石油污染土壤为样品源,采用芘平板升华法,筛选具有多环芳烃降解能力的菌株。利用显色反应及酶促反应对菌株所产胞外邻苯二酚-2,3-双加氧酶进行定性定量试验并对其进行形态学观察、BIOLOG GENⅢ微孔板鉴定及16S rRNA序列分析。通过单因子影响试验和正交试验对菌株的生长特性及最佳降解条件进行了初步探讨。结果表明:芘降解菌株W39能分泌胞外邻苯二酚-2,3-双加氧酶,且经芘诱导后,产酶能力提高了3倍;经鉴定,菌株W39为阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae);最适培养条件:35℃,p H 7.0,芘浓度50 mg/L。可见,邻苯二酚-2,3-双加氧酶是降解芘的关键酶之一,可对其进行进一步研究。
- 徐苗晁群芳
- 关键词:3-双加氧酶菌种筛选阴沟肠杆菌
- 石油污染土壤理化性质对微生物代谢特征的影响被引量:10
- 2018年
- 采用Biolog技术研究了克拉玛依油田5种不同石油污染梯度下土壤微生物群落代谢特征的变化,探讨石油烃污染程度及土壤理化性质对微生物群落功能多样性的影响。研究表明:随着石油烃污染梯度的增加,土壤微生物代谢活性和细菌数量呈先升高后降低的趋势;中度污染土壤中微生物对不同碳源的相对利用率显著高于其他土样(P<0.05),石油污染土壤微生物代谢模式由氨基酸类转变为羧酸类和聚合物类;经微生物群落多样性指数分析可知,丰富度指数(H)、均一度指数(U)和优势度指数(1/D)均达到极显著差异(P<0.01),石油污染土壤的微生物群落结构复杂但均一性差;冗余分析表明:pH、含水量与碳源的利用程度呈正相关,石油含量与碳源的利用程度呈负相关。
- 徐苗段魏魏赵亚光吴盼云晁群芳
- 关键词:石油污染土壤群落多样性