李妮
- 作品数：3 被引量：40H指数：2
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- 相关领域：医药卫生生物学农业科学更多>>
- 葫芦科和景天属植物的DNA条形码通用序列研究
- 目的：评价几个热点DNA条形码候选序列对葫芦科、景天属植物的鉴别能力。 方法：使用ITS2.rbcL、matK和psbA-trnH序列的通用引物对葫芦科、景天属植物进行PCR扩增和测序,通过比较各序列的扩增和测序成功率、...
- 李妮
- 关键词：DNA条形码葫芦科景天属PSBA-TRNHRBCL
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- 葫芦科植物通用DNA条形码的筛选被引量：25
- 2011年
- 目的评价几个热点DNA条形码候选序列对葫芦科植物的鉴别能力。方法使用ITS2、rbcL、matK和psbA-trnH序列的通用引物对葫芦科植物进行PCR扩增和测序,通过比较各序列的扩增和测序成功率、种内和种间的变异、barcodinggap,并采取相似性探索BLAST 1和最近距离Nearest Distance方法评价不同序列的鉴别能力。结果 ITS2序列对葫芦科33个属、90个物种、182个样本进行分析,其鉴定成功率较高,在属水平为100.0%,在物种水平为88.5%;psbA-trnH序列对201个样本进行分析,其鉴定成功率在属水平为93.0%,在物种水平为73.1%,但其可以补充部分ITS2不能分析的物种区域。结论 ITS2和psbA-trnH是适合葫芦科植物鉴别的一个较好的DNA条形码序列组合。
- 李妮陈士林刘义梅陈科力
- 关键词：DNA条形码葫芦科PSBA-TRNHMATKRBCLITS2
- 景天属药用植物DNA条形码研究被引量：16
- 2010年
- 目的:评价DNA条形码候选序列对景天属药用植物及其混伪品的鉴别能力,探索景天属药用植物鉴定的新方法。方法:使用ITS2、rbcL、matK和psbA-trnH序列的通用引物对景天属药用植物进行PCR扩增和测序,通过比较各序列的扩增效率、种内和种间变异的显著性,以及Barcoding gap,采取BLAST1和Nearest Distance方法评价不同序列的鉴定能力。结果:ITS2序列在采集的景天属几种药用植物中扩增成功率为100%,其种内种间变异差异、Barcoding Gap较psbA-trnH、rbcL序列具有更明显的优势,而且纳入网上48个样品33个种的数据后鉴定成功率仍达到100%。结论:ITS2序列能够准确鉴定景天属药用植物,并将其与常见混伪品区别开,ITS2可推荐为景天属首选的DNA条形码序列。
- 李妮陈科力刘震叶丛进陈士林
- 关键词：DNA条形码景天属ITS2药用植物
