许花
- 作品数：2 被引量：14H指数：2
- 供职机构：教育部更多>>
- 发文基金：江苏省普通高校研究生科研创新计划项目教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 基因组水平上拟南芥和水稻mrs2基因家族的比较系统发生分析被引量：2
- 2007年
- mrs2(mitochondrial RNA splicing 2)基因是植物线粒体中Ⅱ类内含子自我剪接缺陷的抑制基因,同时参与了植物中镁离子的运输。本研究利用已经分离的植物的mrs2基因,鉴别出MRS2结构域,同时对拟南芥和水稻中的mrs2基因家族的成员进行了鉴定;利用这些基因编码的蛋白质序列构建了系统发生树,并进行了序列保守性分析,最后查找了相关基因的EST表达信息。结果表明:①系统发生分析表明拟南芥和水稻的mrs2基因的结构在拟南芥和水稻分离之前已经形成,并在分离之后按照物种特异性的方式进行了扩张;②MEME分析表明植物的Mrs2蛋白质具有高度保守的基序,并且在蛋白质中的排列顺序也大致相似;③mrs2基因在拟南芥和水稻中的表达有差异,但在部分表达上仍保持了一致性。
- 许花杨泽峰顾世梁
- 关键词：拟南芥水稻系统发生分析
- 拟南芥和水稻cystatin基因家族的生物信息学分析被引量：12
- 2007年
- 利用已经分离的植物半胱氨酸蛋白酶抑制剂(cystatin)基因的cystatin结构域为检索序列在基因组水平上对拟南芥和水稻中的cystatin基因家族的成员进行分析;同时利用这些基因编码的蛋白质序列构建系统发生树,并对这些蛋白序列的保守序列进行分析;最后在GenBank的EST数据库中查找这些基因的ESTs表达序列。结果表明:1结合结构域的鉴定、多序列联配以及MEME分析最终确定了7个拟南芥和11个水稻的cystatin基因。2系统发生分析表明,cystatin基因的基本特征很可能是在拟南芥和水稻的分离之前就已经形成。3 cystatin结构域在蛋白质间高度保守。4拟南芥和水稻的cystatin基因主要在花、叶、根、种子和愈伤组织中表达,这有助于植物避免昆虫的侵害。
- 杨泽峰顾世梁许花徐辰武
- 关键词：拟南芥水稻半胱氨酸蛋白酶抑制剂基因家族
