曹丹
- 作品数：6 被引量：85H指数：4
- 供职机构：湖南农业大学更多>>
- 发文基金：湖南省重大科技专项国家茶叶产业技术体系建设项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学轻工技术与工程生物学更多>>
- 基于多平台基因表达数据的水稻干旱和盐胁迫相关基因预测被引量：4
- 2021年
- 基于多平台基因表达数据挖掘水稻胁迫相关基因,可增加关键基因预测的可靠性,获得更具普适意义的结果。本研究从NCBI数据库中收集了与水稻非生物胁迫相关的94份affymetrix基因芯片数据和42份RNA-seq转录组数据。首先对同一类型同一胁迫相关的多个数据集以数据转换法融合,得到干旱胁迫相关的affymetrix数据集D_affy和RNA-seq数据集D_rnaseq,盐胁迫相关的affymetrix数据集S_affy和RNA-seq数据集S_rnaseq;接着对4个数据集分别基于Pearson线性相关系数的经典WGCNA法和基于MIC非线性相关系数的改进WGCNA法进行基因共表达网络分析,共获取胁迫相关的8个Hub基因集;进一步,对同一胁迫相关的Hub基因进行整合分析,得到最终的水稻干旱胁迫相关Hub基因1936个、盐胁迫相关的Hub基因1504个。最后,从预测性能、富集分析、文献报道、STRING在线互作分析和Cytoscape可视化分析等多角度解析Hub基因的生物学意义。结果显示:Hub基因整体预测性能较优,且大多富集到了与干旱/盐胁迫相关的通路上,其中有文献已报道的干旱胁迫响应基因31个和盐胁迫响应基因22个。此外,通过对Hub基因的互作分析,预测得到11个干旱胁迫候选基因和5个盐胁迫候选基因。本研究为“高维度、小样本”的农作物基因测序数据的有效分析提供了新思路,实验结果为抗逆水稻品种研究提供了参考。
- 刘亚文张红燕曹丹李兰芝
- 关键词：水稻多平台干旱胁迫盐胁迫
- 最大信息系数优化算法及在生物信息学中的应用
- 准确度量两变量关联是数据挖掘、机器学习的基石。变量对Y-X,无序-无序型关联可用χ2值或互信息I测度,无序-有序型关联可用t值或F值测度,有序-有序型线性关联可用决定系数R测度。然而,χ2、I、t、F值均为无界统计量,χ...
- 曹丹
- 关键词：基因表达谱
- 文献传递
- 不同时间给予大红袍水提物对小鼠急性酒精性肝损伤的影响被引量：5
- 2013年
- 为了比较提前2 h给予、同时给予及推后2 h给予大红袍水提物对小鼠急性酒精性肝损伤的抵御效果,将50只小鼠随机分成5组:对照组给予等量的蒸馏水,乙醇组一次性给予60%乙醇(0.01 mL/g),提前组、同时组及推后组分别在灌喂酒精前2 h、灌喂酒精中和灌喂酒精后2 h给予大红袍水提物。通过检测小鼠体重、肝重以及血清及肝匀浆中谷草转氨酶(AST)、谷丙转氨酶(ALT)、总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、丙二醛(MDA)、总巯基等相关指标,并采用HE染色观察肝组织脂肪变性程度。结果表明,一次性豪饮乙醇的急性酒精性肝损伤小鼠模型造模成功,小鼠肝脏组织细胞、血清的生化代谢指标、抗氧化指标及显微观察结果都显示,提前组、同时组和推后组均能不同程度地抵御小鼠急性酒精性肝损伤,以提前组效果最佳,同时组次之,推后组效果不太明显。
- 曹丹刘仲华黄建安蔡淑娴吴香兰金莉莎林勇
- 关键词：急性酒精性肝损伤
- 不同茶类水提物对酒精性肝损伤的保护作用研究
- 酒精性肝损伤是因人们无节制饮用含酒精饮品所引起的肝脏损害。目前,酒精性肝损伤已日益引起人们的关注。研究表明,茶叶中多种有效成分对由酒精引起的肝脏损害具有明显的保护作用。本文以信阳红、白毫银针、君山银针、大红袍、茯砖茶、信...
- 曹丹
- 关键词：酒精性肝损伤脂质代谢炎症因子
- 文献传递
- 茯砖茶对小鼠肠道免疫功能调节作用的研究被引量：32
- 2013年
- 探讨了茯砖茶水提物对小鼠肠道免疫功能的调整作用。试验以注射用氨苄青霉素灌胃建立小鼠肠道菌群失调及免疫功能紊乱模型。昆明小鼠随机分6组,正常对照组、自然恢复组、模型组和茯砖茶高、中、低剂量组,分别进行肠道菌群检测、小肠黏液sIgA的测定、血清中IL-2的测定、血清白蛋白和总蛋白含量检测以及回肠切片病理检测。结果表明,注射用氨苄青霉素灌胃5 d小鼠,肠道菌群失调,小肠黏液sIgA、血清中IL-2、血清白蛋白和总蛋白均较正常组降低,回肠组织切片明显病变。分别灌服茯砖茶水提物后,肠道菌群得以调整,小肠黏液sIgA、血清中IL-2、血清白蛋白和总蛋白均有所升高,且与自然恢复组比具有显著性差异。各治疗组之间比较,高剂量组疗效优于低剂量组。说明茯砖茶水提物能修复受损黏膜,有调节肠道免疫功能的作用。
- 吴香兰刘仲华曹丹金莉莎林勇
- 关键词：茯砖茶肠道免疫SIGAIL-2
- 茯砖茶减肥作用研究被引量：51
- 2012年
- 探讨了茯砖茶和绿茶对营养型肥胖大鼠的减肥作用。茶叶水提物的低、中、高灌胃剂量分别为:75、150、300 mg/kg。结果表明:与肥胖模型组相比,茯砖茶和绿茶均能显著抑制大鼠体质量增长,降低食物利用率、脂肪系数以及Lee氏指数。脂肪细胞观察表明,喂饲茯砖茶和绿茶组大鼠的脂肪细胞中脂滴含量明显减少,脂肪细胞直径明显变小。茯砖茶降低血清甘油三酯的效果优于绿茶。
- 王蝶黄建安叶小燕曹丹张健炜刘仲华
- 关键词：茯砖茶绿茶减肥
