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廖波

作品数：17 被引量：50H指数：4
供职机构：大连理工大学更多>>
发文基金：国家自然科学基金湖南省自然科学基金更多>>
相关领域：生物学自动化与计算机技术理学文化科学更多>>

合作作者

文献类型

  • 14篇期刊文章
  • 2篇学位论文
  • 1篇科技成果

领域

  • 7篇生物学
  • 6篇自动化与计算...
  • 3篇理学
  • 1篇电子电信
  • 1篇医药卫生
  • 1篇文化科学

主题

  • 3篇生物序列
  • 3篇RNA二级结...
  • 3篇DNA序列
  • 2篇蛋白
  • 2篇蛋白质
  • 2篇信息熵
  • 2篇生物学
  • 2篇数据挖掘
  • 2篇网络
  • 2篇矩阵
  • 2篇聚类
  • 2篇距离矩阵
  • 2篇计数
  • 2篇计算生物学
  • 2篇渐近
  • 2篇渐近估计
  • 2篇函数
  • 2篇白质
  • 2篇RNA
  • 1篇蛋白序列

机构

  • 9篇湖南大学
  • 8篇大连理工大学
  • 2篇海南师范大学
  • 1篇大连交通大学

作者

  • 17篇廖波
  • 7篇王天明
  • 2篇彭利红
  • 2篇刘昊
  • 1篇吴霞
  • 1篇陈维洋
  • 1篇赵欢
  • 1篇刘立伟
  • 1篇贾伟峰
  • 1篇朱雯
  • 1篇白凤兰
  • 1篇白凤兰
  • 1篇袁春欣
  • 1篇申众
  • 1篇苏志中
  • 1篇李希
  • 1篇罗娟
  • 1篇姚玉华
  • 1篇吴迪
  • 1篇周方

传媒

  • 3篇生物数学学报
  • 2篇计算机工程与...
  • 1篇生物技术通讯
  • 1篇应用数学
  • 1篇计算机与应用...
  • 1篇小型微型计算...
  • 1篇大连理工大学...
  • 1篇计算机工程与...
  • 1篇微计算机信息
  • 1篇湖南工业职业...
  • 1篇计算机教育

年份

  • 1篇2018
  • 1篇2013
  • 1篇2011
  • 1篇2010
  • 3篇2009
  • 3篇2008
  • 1篇2006
  • 4篇2004
  • 1篇2003
  • 1篇2002
共 17 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
生物序列的数学刻画与应用
王天明廖波姚玉华白凤兰刘立伟
计算生物学是上世纪八十年代末兴起的一门新的交叉学科，它涉及生物学、数学、计算机科学、化学以及它科学。由于测序技术的进步，生物序列和结构数据呈指数增长。面对海量数据，如何对这些数据进行科学的分类、处理、分析和储存，给数学、...
关键词：
关键词：计算生物学生物序列蛋白质二级结构
一类RNA二级结构的计数被引量：4
2002年
多核苷酸的二级结构可视为一类顶点标号平面图 ,通常通过枚举每类RNA二级结构图的各种子图来计算其递推公式 .本文作者给出了限制端环长度的RNA二级结构的递推公式 。
廖波王天明
关键词：RNA二级结构渐近估计母函数
加权K近邻算法在蛋白质功能预测中的应用
2010年
针对蛋白质序列与所属类别往往是多对多的关系,提出了一种新的基于加权K近邻(KNN)的蛋白质功能预测算法。该算法从蛋白质序列出发,与分组重量编码(Encoding Based on Grouped Weight,简记为EBGW)相结合,并为未知蛋白质序列的近邻赋予一定的权重。对比实验的结果表明,此基于加权KNN的功能预测算法可有效的应用于蛋白质的功能预测。
贾伟峰廖波李希
关键词：数据挖掘分组重量编码K近邻
RNA二级结构的最小自由能算法被引量：9
2003年
RNA(即tRNA,rRNA,mRNA和SnRNA)有两大主要功能:一是某些病毒的遗传物质;二是参与蛋白质的合成。这些与细胞分化、代谢、记忆的储存等有重要关系。这些功能与RNA二级结构的稳定性,自由能密切相关。常用的计算自由能的方法有热力学微扰法及热力学微积分法等。本文以寻找最小自由能二级结构为目的,给出了RNA二级结构的最小自由能算法,该算法的时间复杂性不超过O(n^4)。
廖波王天明
关键词：RNA
mRNA序列与蛋白序列对比
2004年
生物序列的对比是计算生物学中的一个基本问题.目前已有许多算法对DNA序列或蛋白序列之间进行对比,多是对同种生物序列进行对比.为得到mRNA序列和蛋白序列之间的对比,采用动态规划算法,提供了寻求mRNA序列和蛋白序列的局部对比和全局对比,解决了核酸与氨基酸之间的对比问题.算法的时间复杂度为O(nm).
袁春欣廖波王天明
关键词：蛋白序列DNA序列核酸MRNA序列生物序列计算生物学
无线传感器网络中一种移动节点定位算法被引量：13
2008年
无线传感器网络中现有的大多数定位算法都是针对静态节点的,不能应用于节点移动的情况.本文提出了MCBE(Monte Carlo Localization Boxed Using Estimation)移动定位算法,该算法利用锚盒子(Anchor box),即包含待定位节点可能位置且平行于坐标轴的矩形以及非锚节点位置来帮助定位.锚盒子大小和定位误差存在正相关关系,算法根据待定位节点的一跳和二跳锚节点位置计算出锚盒子大小,当锚盒子大于一定值时,利用锚盒子小的非锚节点位置缩小锚盒子,最后在锚盒子范围内对位置采样,用蒙特卡罗MCL方法定位.理论分析和仿真结果表明,MCBE能有效地缩小采样区域,提高定位精度.
李鹏程廖波罗娟吴迪
关键词：无线传感网络蒙特卡罗
拓扑指数在生物序列相似性比较中的应用被引量：3
2006年
在生物序列的二维图形表示的基础上,利用Balaban指数和信息分布指数比较生物序列的相似性,我们以包括人类等9种不同物种的DNA序列和yar029w等6种蛋白质为例来说明该方法的使用．
白凤兰廖波王天明
关键词：DNA序列拓扑指数
蛋白质序列的六维表示与相似性分析被引量：5
2004年
给出了蛋白质序列的一种六维表示方法,根据这种表示方法有3种不同表示形式,利用这3种形式来构造距离矩阵的信息熵,然后通过信息熵向量的欧式距离、夹角来比较序列之间的相似性。
吴霞廖波王天明
关键词：蛋白质序列距离矩阵信息熵生物信息学
改进的蚁群算法及其在2DHP模型中的应用被引量：2
2009年
为了提高蛋白质折叠问题解的质量,采用蚁群算法对蛋白质的折叠问题进行研究,并且在现有的蚁群算法的基础上成功引入了淘汰和克隆机制,使其具有更好的运算效率,并成功应用到2DHP模型中。在蚁群对最优值进行搜索的过程中,容易出现局部最优点,导致影响解的质量。为了避免计算结果收敛到局部最优点,引入了一种最大最小蚁群策略。选择测试序列进行实验,实验结果表明,该算法在保证解的质量的同时,还具有较高的效率。
周方廖波
关键词：蚁群算法克隆
基于蛋白质相互作用网络图的聚类方法
2008年
依据人类AD(Alzheimer's Disease)相关蛋白质相互作用网络图,利用基于算术平均最小值——AAMV(Arithmetic Average Minimum Value)的K-means聚类方法对蛋白质进行聚类并预测4个孤立蛋白质的功能。分析结果表明:所得结果与用Maryland Bridge法及Korbel法所得结果非常相似。
彭利红廖波刘昊
关键词：准则函数
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