周索童
- 作品数：4 被引量：5H指数：2
- 供职机构：大连工业大学更多>>
- 发文基金：中国博士后科学基金国家自然科学基金辽宁省教育厅科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 杂草稻的分类与起源分析
- 杂草稻(Oryza sativa L.)是经过长期自然选择和人工干预而产生的兼有野生稻和栽培稻特性的水稻中间类型。由于生长的环境恶劣，具有很多优良抗性性状(如耐旱、耐寒、抗病虫害、耐盐碱等)，是栽培稻育种和改良的优良基因...
- 周索童
- 关键词：杂草稻籼粳分类PSBA-TRNH克隆测序系统树
- 杂草稻nrDNA ITS片段的PCR扩增条件优化及测定被引量：2
- 2008年
- 对杂草稻的nrDNA ITS片段的PCR扩增条件进行了优化并测定,建立的PCR最优体系为:20μL反应体系含1μL模板DNA,0.125 mmol/L dNTPs,0.5μmol/L正反向引物,1 UTaq酶,2.0μL 10×TaqPCR Buffer;退火温度为57℃。这样的条件下充分保证了ITS PCR产物的质量和纯度要求,直接测序结果为600 bp左右,与网上结果十分类似,表明结果准确可靠。这些ITS片段的系统学信息将为杂草稻的起源进化提供有力的分子水平证据。
- 刘志文韩旭周索童王丽李宪臻陈温福
- 关键词：杂草稻NRDNA测序
- 水稻不同组织总DNA对叶绿体标记分析的影响被引量：2
- 2010年
- 叶绿体DNA标记是水稻分子生物学分析中的常用方法之一。但是水稻叶绿体DNA的提取过程复杂且耗时,为了简化分析步骤,本试验使用CTAB与SDS方法分别提取栽培水稻籼93-11和粳沈农265的叶、根、种子3种组织总DNA,选择3对叶绿体基因间隔区标记(psbA-trnH、petG-trnP和infA-rpl36)以及2对水稻叶绿体籼粳分类标记(ORF100和ORF29-TrnCGCA)进行PCR扩增。结果显示以它们种子、根为模板的扩增效果与叶片模板的扩增效果相一致,并与预期的结果相符合。最后对60份杂草稻种子总DNA进行叶绿体籼粳分类标记扩增分析,结果表明,杂草稻种子总DNA中扩增出目的片段同样能够进行有效的籼粳分类。这在一定程度上简化了水稻叶绿体标记的分析过程,加快分析速度。
- 周索童刘志文
- 关键词：水稻DNA提取PCR扩增
- 杂草稻叶绿体psbA-trnH片段的PCR扩增条件优化被引量：1
- 2008年
- 对杂草稻叶绿体psbA-trnH片段的PCR扩增条件进行了优化,建立的最优体系为:20μL反应体积含1μL模板DNA,0.125mM dNTPs,0.5μM正反向引物,1U Taq酶,2.0μL 10×Taq PCR buffer;退火温度为61℃,在此条件下充分保证了psbA-trnH PCR产物的质量和纯度要求。对该片段进行了直接测序,结果为510bp左右,在NCBI中比较分析表明其测序结果准确可靠,经ClustW分析表明含有丰富的系统学信息。
- 刘志文周索童韩旭曲佐寅王占久孙之音李宪臻陈温福
- 关键词：杂草稻测序
